A complex full record
API · /complexes-api
Complex Portal API
De Complex Portal als API, mogelijk gemaakt door EMBL-EBI — een handmatig samengestelde, encyclopedische database van stabiele macromoleculaire complexen: assemblages van twee of meer eiwitten (en soms nucleïnezuren, liganden of kleine moleculen) die samenwerken als een enkele functionele eenheid, zoals ribosomen, proteasomen, RNA- en DNA-polymerasen, het spliceosoom, ademhalingsketencomplexen en duizenden andere in vele soorten. Zoek de complexen op trefwoord en optioneel op organisme, en verkrijg voor elk complex de Complex Portal-toegang (CPX-…), naam, organisme, beschrijving en of het computationeel voorspeld is; lees een volledig samengesteld record van een complex inclusief de aanbevolen en systematische namen, synoniemen, soort, biologische functie, de deelnemende subeenheden elk met hun molecuulidentificatie (bijvoorbeeld een UniProt-toegang) en stoichiometrie, eventuele geassocieerde liganden en ziekten, het bewijstype en kruisverwijzingen naar UniProt, Gene Ontology, Reactome, Wikidata en meer; en haal alleen de subeenheidsamenstelling van een complex op. Ideaal voor structurele en systeembiologie, pad- en netwerkanalyse, eiwitfunctieonderzoek en bioinformatica-pijplijnen. Complex-toegangen zien eruit als CPX-6036. Gegevens van EMBL-EBI Complex Portal (IMEx-consortium, CC-BY). Voor eiwit-eiwitinteractienetwerken zie de STRING API, voor eiwitsequenties UniProt, voor biologische routes Reactome en voor families en domeinen InterPro.
API-gezondheid
gedegradeerd- Uptime
- 93.75%
- Serversondes · 24 uur
- Gem. latentie
- 362 ms
- Serversondes · 24 uur
- Abonnees
- 3,747
- actief
- Totaal aantal oproepen
- 12
- laatste 7 dagen
Prijzen
Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.
Free
Vrij
- 565 oproepen / maand
- 2 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 565 oproepen/maand
- 2 verzoeken/sec
- Zoeken, complexen & subeenheden
- Geen creditcard
Starter
€6.70 /maand
- 21,200 oproepen / maand
- 6 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 21,2k oproepen/maand
- 6 verzoeken/sec
- Volledige complexe records
- E-mailondersteuning
Pro
€20.80 /maand
- 91,500 oproepen / maand
- 15 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 91,5k oproepen/maand
- 15 verzoeken/sec
- Systeembiologie-pijplijnen
- Prioritaire ondersteuning
Mega
€57.50 /maand
- 395,000 oproepen / maand
- 40 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 395k oproepen/maand
- 40 verzoeken/sec
- High-throughput proteomics
- Toegewijde SLA
Gebouwd door
Gerelateerd APIs
Andere APIs met overlappende tags.
Gene Ontology API
Genfunctie als API — aangedreven door EMBL-EBI's QuickGO en de Gene Ontology (GO), de standaard vocabulaire die beschrijft wat genproducten doen over drie aspecten: moleculaire functie, biologisch proces en cellulaire component. Gegeven een gen of eiwit (een UniProt-accessie), vermeld elke GO-annotatie die ervoor is gemaakt — de GO-term, het aspect, de kwalificatie, de bewijscode, de ondersteunende referentie (bijv. een PubMed-id), het organisme en wie het heeft toegewezen — optioneel gefilterd op aspect of organisme. Zoek elke GO-term op om de definitie, het aspect, synoniemen en het aantal kindtermen te krijgen; en doorzoek de ontologie op naam om de juiste GO-termen te vinden. GO-termnamen worden automatisch opgelost bij annotaties. Van TP53 tot elk eiwit in elke soort, het is de ruggengraat van functionele genomica — ideaal voor verrijkingsanalyse, annotatiepijplijnen, bio-informatica en onderzoekstools. Een gen-functieannotatiebron (welke genen welke functies hebben, met bewijs) — anders dan generieke ontologie-termopzoekingen. Open data van EMBL-EBI QuickGO en het GO Consortium (CC BY 4.0).
api.oanor.com/quickgo-api
EMDB API
De Electron Microscopy Data Bank (EMDB) als API, aangedreven door EMBL-EBI — het openbare archief van driedimensionale elektronenmicroscopie-dichtheidskaarten van eiwitten, nucleïnezuren en grote macromoleculaire complexen. EMDB is de elektronenmicroscopie-tegenhanger van de Protein Data Bank, met kaarten opgelost door single-particle cryo-EM, elektronentomografie en elektronenkristallografie, de techniek achter de recente 'resolutie-revolutie' in de structurele biologie. /v1/search?q=ribosome doorzoekt het archief en retourneert voor elke overeenkomende vermelding de EMDB-id (bijv. EMD-1010), titel, elektronenmicroscopiemethode en resolutie in ångström. /v1/entry?id=EMD-1010 retourneert de metadata van een vermelding — de titel, de EM-methode (single particle, tomografie, …), de aggregatietoestand, de resolutie, het bestudeerde biologische monster, classificatie-sleutelwoorden, de datums van deponering, kaartpublicatie en laatste update, en de indienende auteurs. EMDB-ids zien eruit als EMD-1010, en u kunt alleen het nummer doorgeven. Ideaal voor structurele-biologie- en cryo-EM-tools, structuurvergelijking- en visualisatie-apps, en onderwijs. Gegevens van EMBL-EBI EMDB (publiek domein). Dit is het archief van experimentele elektronenmicroscopie-KAARTEN — te onderscheiden van atomaire-coördinaatstructuren (de PDB), voorspelde structuren (AlphaFold) en eiwitsequentiedatabases (UniProt).
api.oanor.com/emdb-api
AlphaFold API
De AlphaFold-eiwitstructuurdatabase als API, aangedreven door EMBL-EBI en Google DeepMind. AlphaFold voorspelt de driedimensionale structuur van een eiwit op basis van de aminozuursequentie met experimentele nauwkeurigheid, en de database bevat nu meer dan 200 miljoen eiwitten — bijna elke sequentie in UniProt. Zoek het AlphaFold-model voor elk eiwit op via de UniProt-toegangscode en verkrijg de gen- en eiwitbeschrijving, organisme en sequentielengte, modelversie en aanmaakdatum, de globale betrouwbaarheidsmaatstaf, de volledige aminozuursequentie en directe downloadlinks naar de voorspelde structuur als mmCIF, PDB en BinaryCIF samen met de Predicted Aligned Error (PAE)-plotafbeelding en -gegevens; en lees de structurele dekking van een eiwit — de voorspelde AlphaFold-modellen en eventuele gekoppelde structuren met hun aanbieder, modelcategorie, methode en het gedekte UniProt-residubereik. Ideaal voor structurele biologie, medicijnontdekking en doelwitevaluatie, eiwitengineering, moleculaire visualisatie en onderwijs. Eiwitten worden geïdentificeerd door UniProt-toegangscodes (bijvoorbeeld P00520 of P38398). Gegevens van de AlphaFold DB (CC-BY 4.0). Voor experimenteel bepaalde 3D-structuren, zie de PDB API, voor eiwitsequenties en functionele annotatie de UniProt API, en voor families en domeinen InterPro.
api.oanor.com/alphafold-api
PDB API
De RCSB Protein Data Bank als API — 3D-macromoleculaire structuren van eiwitten, nucleïnezuren en complexen, aangedreven door de officiële RCSB PDB-gegevens en zoekdiensten. Haal een structuurinvoer op met de 4-karakter PDB-id voor de titel, experimentele methode (röntgen, cryo-EM, NMR), resolutie, trefwoorden, deponerings- en releasedatums, auteurs, primaire citatie en entiteit- & assemblage-aantallen; voer een full-text zoekopdracht uit over het hele archief die overeenkomende PDB-id's en het totale aantal hits retourneert; lees een polymeer-entiteit voor de eiwit- of nucleïnezuurnaam, één-letter sequentie, lengte, bronorganisme, ketens en gekoppelde UniProt-id's; lees een biologische assemblage voor de oligomere toestand, symmetrie en keten- & atoomtellingen; vermeld de liganden die in een structuur zijn gebonden met hun component-id's en namen; en zoek een chemische component (ligand) op code voor de formule, gewicht, SMILES en InChIKey. Ideaal voor structurele biologie en geneesmiddelenontdekkingstools, moleculaire viewers, bioinformatica-pijplijnen, onderwijsapps en onderzoeksdashboards.
api.oanor.com/pdb-api
Veelgestelde vragen
Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.
Hoe krijg ik een API-sleutel voor Complex Portal API?
Wat is de rate-limit voor Complex Portal API?
Wat kost Complex Portal API?
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Voldoet Complex Portal API aan de AVG?
Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.
Codefragmenten
Meld u aan om een API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.
curl https://api.oanor.com/complexes-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/complexes-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/complexes-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/complexes-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())
Beoordelingen
Log in om te beoordelen.
Nog geen beoordelingen.
Discussie
Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.
Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.
InloggenNieuwe discussie
·
-
Antwoord van aanbieder
🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.
-
·
- Nog geen discussies — start de eerste.
Support
Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.
Meld je aan om een supportticket te openen.
InloggenNieuw ticket openen
Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.
-
·
Urgent - Nog geen tickets voor deze API.