AlphaFold predicted structure
API · /alphafold-api
AlphaFold API
De AlphaFold-eiwitstructuurdatabase als API, aangedreven door EMBL-EBI en Google DeepMind. AlphaFold voorspelt de driedimensionale structuur van een eiwit op basis van de aminozuursequentie met experimentele nauwkeurigheid, en de database bevat nu meer dan 200 miljoen eiwitten — bijna elke sequentie in UniProt. Zoek het AlphaFold-model voor elk eiwit op via de UniProt-toegangscode en verkrijg de gen- en eiwitbeschrijving, organisme en sequentielengte, modelversie en aanmaakdatum, de globale betrouwbaarheidsmaatstaf, de volledige aminozuursequentie en directe downloadlinks naar de voorspelde structuur als mmCIF, PDB en BinaryCIF samen met de Predicted Aligned Error (PAE)-plotafbeelding en -gegevens; en lees de structurele dekking van een eiwit — de voorspelde AlphaFold-modellen en eventuele gekoppelde structuren met hun aanbieder, modelcategorie, methode en het gedekte UniProt-residubereik. Ideaal voor structurele biologie, medicijnontdekking en doelwitevaluatie, eiwitengineering, moleculaire visualisatie en onderwijs. Eiwitten worden geïdentificeerd door UniProt-toegangscodes (bijvoorbeeld P00520 of P38398). Gegevens van de AlphaFold DB (CC-BY 4.0). Voor experimenteel bepaalde 3D-structuren, zie de PDB API, voor eiwitsequenties en functionele annotatie de UniProt API, en voor families en domeinen InterPro.
API-gezondheid
gedegradeerd- Uptime
- 87.50%
- Serversondes · 24 uur
- Gem. latentie
- 100 ms
- Serversondes · 24 uur
- Abonnees
- 3,074
- actief
- Totaal aantal oproepen
- 9
- laatste 7 dagen
Prijzen
Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.
Free
Vrij
- 560 oproepen / maand
- 2 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 560 oproepen/maand
- 2 verzoeken/sec
- Voorspellingen & structurele dekking
- Geen creditcard
Starter
€6.90 /maand
- 21,100 oproepen / maand
- 6 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 21.1k oproepen/maand
- 6 verzoeken/sec
- Model downloadlinks
- E-mailondersteuning
Pro
€21.10 /maand
- 93,500 oproepen / maand
- 15 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 93,5k oproepen/maand
- 15 verzoeken/sec
- Geneesmiddelenontdekking & engineering
- Prioritaire ondersteuning
Mega
€58.50 /maand
- 405,000 oproepen / maand
- 40 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 405k oproepen/maand
- 40 verzoeken/sec
- Structurele biologie met hoge doorvoer
- Toegewijde SLA
Gebouwd door
Gerelateerd APIs
Andere APIs met overlappende tags.
PDB API
De RCSB Protein Data Bank als API — 3D-macromoleculaire structuren van eiwitten, nucleïnezuren en complexen, aangedreven door de officiële RCSB PDB-gegevens en zoekdiensten. Haal een structuurinvoer op met de 4-karakter PDB-id voor de titel, experimentele methode (röntgen, cryo-EM, NMR), resolutie, trefwoorden, deponerings- en releasedatums, auteurs, primaire citatie en entiteit- & assemblage-aantallen; voer een full-text zoekopdracht uit over het hele archief die overeenkomende PDB-id's en het totale aantal hits retourneert; lees een polymeer-entiteit voor de eiwit- of nucleïnezuurnaam, één-letter sequentie, lengte, bronorganisme, ketens en gekoppelde UniProt-id's; lees een biologische assemblage voor de oligomere toestand, symmetrie en keten- & atoomtellingen; vermeld de liganden die in een structuur zijn gebonden met hun component-id's en namen; en zoek een chemische component (ligand) op code voor de formule, gewicht, SMILES en InChIKey. Ideaal voor structurele biologie en geneesmiddelenontdekkingstools, moleculaire viewers, bioinformatica-pijplijnen, onderwijsapps en onderzoeksdashboards.
api.oanor.com/pdb-api
EMDB API
De Electron Microscopy Data Bank (EMDB) als API, aangedreven door EMBL-EBI — het openbare archief van driedimensionale elektronenmicroscopie-dichtheidskaarten van eiwitten, nucleïnezuren en grote macromoleculaire complexen. EMDB is de elektronenmicroscopie-tegenhanger van de Protein Data Bank, met kaarten opgelost door single-particle cryo-EM, elektronentomografie en elektronenkristallografie, de techniek achter de recente 'resolutie-revolutie' in de structurele biologie. /v1/search?q=ribosome doorzoekt het archief en retourneert voor elke overeenkomende vermelding de EMDB-id (bijv. EMD-1010), titel, elektronenmicroscopiemethode en resolutie in ångström. /v1/entry?id=EMD-1010 retourneert de metadata van een vermelding — de titel, de EM-methode (single particle, tomografie, …), de aggregatietoestand, de resolutie, het bestudeerde biologische monster, classificatie-sleutelwoorden, de datums van deponering, kaartpublicatie en laatste update, en de indienende auteurs. EMDB-ids zien eruit als EMD-1010, en u kunt alleen het nummer doorgeven. Ideaal voor structurele-biologie- en cryo-EM-tools, structuurvergelijking- en visualisatie-apps, en onderwijs. Gegevens van EMBL-EBI EMDB (publiek domein). Dit is het archief van experimentele elektronenmicroscopie-KAARTEN — te onderscheiden van atomaire-coördinaatstructuren (de PDB), voorspelde structuren (AlphaFold) en eiwitsequentiedatabases (UniProt).
api.oanor.com/emdb-api
Complex Portal API
De Complex Portal als API, mogelijk gemaakt door EMBL-EBI — een handmatig samengestelde, encyclopedische database van stabiele macromoleculaire complexen: assemblages van twee of meer eiwitten (en soms nucleïnezuren, liganden of kleine moleculen) die samenwerken als een enkele functionele eenheid, zoals ribosomen, proteasomen, RNA- en DNA-polymerasen, het spliceosoom, ademhalingsketencomplexen en duizenden andere in vele soorten. Zoek de complexen op trefwoord en optioneel op organisme, en verkrijg voor elk complex de Complex Portal-toegang (CPX-…), naam, organisme, beschrijving en of het computationeel voorspeld is; lees een volledig samengesteld record van een complex inclusief de aanbevolen en systematische namen, synoniemen, soort, biologische functie, de deelnemende subeenheden elk met hun molecuulidentificatie (bijvoorbeeld een UniProt-toegang) en stoichiometrie, eventuele geassocieerde liganden en ziekten, het bewijstype en kruisverwijzingen naar UniProt, Gene Ontology, Reactome, Wikidata en meer; en haal alleen de subeenheidsamenstelling van een complex op. Ideaal voor structurele en systeembiologie, pad- en netwerkanalyse, eiwitfunctieonderzoek en bioinformatica-pijplijnen. Complex-toegangen zien eruit als CPX-6036. Gegevens van EMBL-EBI Complex Portal (IMEx-consortium, CC-BY). Voor eiwit-eiwitinteractienetwerken zie de STRING API, voor eiwitsequenties UniProt, voor biologische routes Reactome en voor families en domeinen InterPro.
api.oanor.com/complexes-api
Genome Assemblies API
Referentie-genoomassemblages als een API — aangedreven door NCBI Assembly, het register van genoomversies voor organismen in de hele levensboom. Zoek assemblages op organisme (of vrije tekst) en raadpleeg de metadata van elke assemblage: de accession (GCF_… RefSeq of GCA_… GenBank), naam (bijv. GRCh38.p14), organisme en taxon-id, assemblage-niveau (volledig genoom, chromosoom, scaffold of contig), contiguïteitsstatistieken (contig- en scaffold-N50), sequentiedekking, RefSeq-categorie, UCSC- en Ensembl-namen, de indienende organisatie, releasedatum en FTP-downloadpaden. Van het menselijke referentiegenoom tot elk gesequenced microbe, plant of dier, het verandert het genoomassemblage-register in een schone zoek-en-haal API. Een genoomassemblage-register — te onderscheiden van sequentie (ENA), genoomannotatie (Ensembl), variant (ClinVar, dbVar) en genexpressie (GEO) databases. Open data van NCBI Assembly (publiek domein).
api.oanor.com/genomes-api
Veelgestelde vragen
Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.
Hoe krijg ik een API-sleutel voor AlphaFold API?
Wat is de rate-limit voor AlphaFold API?
Wat kost AlphaFold API?
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Voldoet AlphaFold API aan de AVG?
Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.
Codefragmenten
Meld u aan om een API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.
curl https://api.oanor.com/alphafold-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/alphafold-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/alphafold-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/alphafold-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())
Beoordelingen
Log in om te beoordelen.
Nog geen beoordelingen.
Discussie
Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.
Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.
InloggenNieuwe discussie
·
-
Antwoord van aanbieder
🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.
-
·
- Nog geen discussies — start de eerste.
Support
Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.
Meld je aan om een supportticket te openen.
InloggenNieuw ticket openen
Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.
-
·
Urgent - Nog geen tickets voor deze API.