oanor
Gratis registreren
Marktplaats Prijzen Functies Inloggen

API · /pdb-api

PDB API

gezond 4,496 Abonnees

De RCSB Protein Data Bank als API — 3D-macromoleculaire structuren van eiwitten, nucleïnezuren en complexen, aangedreven door de officiële RCSB PDB-gegevens en zoekdiensten. Haal een structuurinvoer op met de 4-karakter PDB-id voor de titel, experimentele methode (röntgen, cryo-EM, NMR), resolutie, trefwoorden, deponerings- en releasedatums, auteurs, primaire citatie en entiteit- & assemblage-aantallen; voer een full-text zoekopdracht uit over het hele archief die overeenkomende PDB-id's en het totale aantal hits retourneert; lees een polymeer-entiteit voor de eiwit- of nucleïnezuurnaam, één-letter sequentie, lengte, bronorganisme, ketens en gekoppelde UniProt-id's; lees een biologische assemblage voor de oligomere toestand, symmetrie en keten- & atoomtellingen; vermeld de liganden die in een structuur zijn gebonden met hun component-id's en namen; en zoek een chemische component (ligand) op code voor de formule, gewicht, SMILES en InChIKey. Ideaal voor structurele biologie en geneesmiddelenontdekkingstools, moleculaire viewers, bioinformatica-pijplijnen, onderwijsapps en onderzoeksdashboards.

#pdb #protein-structure #structural-biology #crystallography #cryo-em #bioinformatics #rcsb
api.oanor.com/pdb-api
Verkrijg een API-sleutel Probeer het in de speeltuin → Provider contacteren

Machineleesbare specificaties zodat AI-agenten deze API kunnen integreren.

/api/pdb-api/openapi.json
/api/pdb-api/llms.txt

Ontdekking: GET /api/index.json vermeldt elke API.

API-gezondheid

gezond
Uptime
100.00%
Serversondes · 24 uur
Gem. latentie
331 ms
Serversondes · 24 uur
Abonnees
4,496
actief
Totaal aantal oproepen
21
laatste 7 dagen
status Volledige statuspagina → · 42 sondes/24u

Prijzen

Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.

Free

Vrij

  • 550 oproepen / maand
  • 2 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 550 oproepen/maand
  • 2 verzoeken/sec
  • Structuren, entiteiten & liganden
  • Geen creditcard
Meld u aan om u te abonneren

Starter

€7.10 /maand

  • 19,000 oproepen / maand
  • 6 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 19k oproepen/maand
  • 6 verzoeken/sec
  • Volledige tekst structuur zoeken
  • E-mail ondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Pro

€20.50 /maand

  • 88,000 oproepen / maand
  • 15 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 88k oproepen/maand
  • 15 verzoeken/sec
  • Assemblies & sequenties
  • Prioritaire ondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Mega

€57.00 /maand

  • 340,000 oproepen / maand
  • 40 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 340k oproepen/maand
  • 40 verzoeken/sec
  • Structurele biologie met hoge doorvoer
  • Toegewijde SLA
Meld u aan om u te abonneren

Gebouwd door

P
PremiumApi

Gerelateerd APIs

Andere APIs met overlappende tags.

AlphaFold API

De AlphaFold-eiwitstructuurdatabase als API, aangedreven door EMBL-EBI en Google DeepMind. AlphaFold voorspelt de driedimensionale structuur van een eiwit op basis van de aminozuursequentie met experimentele nauwkeurigheid, en de database bevat nu meer dan 200 miljoen eiwitten — bijna elke sequentie in UniProt. Zoek het AlphaFold-model voor elk eiwit op via de UniProt-toegangscode en verkrijg de gen- en eiwitbeschrijving, organisme en sequentielengte, modelversie en aanmaakdatum, de globale betrouwbaarheidsmaatstaf, de volledige aminozuursequentie en directe downloadlinks naar de voorspelde structuur als mmCIF, PDB en BinaryCIF samen met de Predicted Aligned Error (PAE)-plotafbeelding en -gegevens; en lees de structurele dekking van een eiwit — de voorspelde AlphaFold-modellen en eventuele gekoppelde structuren met hun aanbieder, modelcategorie, methode en het gedekte UniProt-residubereik. Ideaal voor structurele biologie, medicijnontdekking en doelwitevaluatie, eiwitengineering, moleculaire visualisatie en onderwijs. Eiwitten worden geïdentificeerd door UniProt-toegangscodes (bijvoorbeeld P00520 of P38398). Gegevens van de AlphaFold DB (CC-BY 4.0). Voor experimenteel bepaalde 3D-structuren, zie de PDB API, voor eiwitsequenties en functionele annotatie de UniProt API, en voor families en domeinen InterPro.

api.oanor.com/alphafold-api

EMDB API

De Electron Microscopy Data Bank (EMDB) als API, aangedreven door EMBL-EBI — het openbare archief van driedimensionale elektronenmicroscopie-dichtheidskaarten van eiwitten, nucleïnezuren en grote macromoleculaire complexen. EMDB is de elektronenmicroscopie-tegenhanger van de Protein Data Bank, met kaarten opgelost door single-particle cryo-EM, elektronentomografie en elektronenkristallografie, de techniek achter de recente 'resolutie-revolutie' in de structurele biologie. /v1/search?q=ribosome doorzoekt het archief en retourneert voor elke overeenkomende vermelding de EMDB-id (bijv. EMD-1010), titel, elektronenmicroscopiemethode en resolutie in ångström. /v1/entry?id=EMD-1010 retourneert de metadata van een vermelding — de titel, de EM-methode (single particle, tomografie, …), de aggregatietoestand, de resolutie, het bestudeerde biologische monster, classificatie-sleutelwoorden, de datums van deponering, kaartpublicatie en laatste update, en de indienende auteurs. EMDB-ids zien eruit als EMD-1010, en u kunt alleen het nummer doorgeven. Ideaal voor structurele-biologie- en cryo-EM-tools, structuurvergelijking- en visualisatie-apps, en onderwijs. Gegevens van EMBL-EBI EMDB (publiek domein). Dit is het archief van experimentele elektronenmicroscopie-KAARTEN — te onderscheiden van atomaire-coördinaatstructuren (de PDB), voorspelde structuren (AlphaFold) en eiwitsequentiedatabases (UniProt).

api.oanor.com/emdb-api

Complex Portal API

De Complex Portal als API, mogelijk gemaakt door EMBL-EBI — een handmatig samengestelde, encyclopedische database van stabiele macromoleculaire complexen: assemblages van twee of meer eiwitten (en soms nucleïnezuren, liganden of kleine moleculen) die samenwerken als een enkele functionele eenheid, zoals ribosomen, proteasomen, RNA- en DNA-polymerasen, het spliceosoom, ademhalingsketencomplexen en duizenden andere in vele soorten. Zoek de complexen op trefwoord en optioneel op organisme, en verkrijg voor elk complex de Complex Portal-toegang (CPX-…), naam, organisme, beschrijving en of het computationeel voorspeld is; lees een volledig samengesteld record van een complex inclusief de aanbevolen en systematische namen, synoniemen, soort, biologische functie, de deelnemende subeenheden elk met hun molecuulidentificatie (bijvoorbeeld een UniProt-toegang) en stoichiometrie, eventuele geassocieerde liganden en ziekten, het bewijstype en kruisverwijzingen naar UniProt, Gene Ontology, Reactome, Wikidata en meer; en haal alleen de subeenheidsamenstelling van een complex op. Ideaal voor structurele en systeembiologie, pad- en netwerkanalyse, eiwitfunctieonderzoek en bioinformatica-pijplijnen. Complex-toegangen zien eruit als CPX-6036. Gegevens van EMBL-EBI Complex Portal (IMEx-consortium, CC-BY). Voor eiwit-eiwitinteractienetwerken zie de STRING API, voor eiwitsequenties UniProt, voor biologische routes Reactome en voor families en domeinen InterPro.

api.oanor.com/complexes-api

Crystallography API

Kristalstructuren als API — aangedreven door de Crystallography Open Database (COD), de open, publiek-domein verzameling van meer dan 500.000 kristalstructuren van organische, anorganische, metaal-organische verbindingen en mineralen. Doorzoek de database op chemische formule (elke standaard schrijfwijze — TiO2, Al2O3, H2O — wordt automatisch genormaliseerd) of op vrije tekst over mineraalnamen, titels en opmerkingen, en bekijk vervolgens elke structuur om de volledige kristallografische gegevens te krijgen: chemische en celformule, ruimtegroep (Hermann-Mauguin en Hall), de volledige eenheidscel (a, b, c, alfa, bèta, gamma en volume), de bronpublicatie (titel, auteurs, tijdschrift, jaar, DOI) en een link naar het CIF-bestand. Van kwarts, calciet en diamant tot anatase, korund en diopsiet, het is ideaal voor materiaalkunde, vastestofchemie, mineralogie, kristallografie onderwijs en onderzoekstools. Dit is een kristalstructuur- en materialendatabase — verschillend van molecuul-eigenschap (chemie / PubChem) en eiwitstructuur (PDB) databases. Open data van de Crystallography Open Database (CC0 / publiek domein).

api.oanor.com/cod-api

Veelgestelde vragen

Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.

Hoe krijg ik een API-sleutel voor PDB API?
Registreer gratis op oanor.com, genereer een API-sleutel in het ontwikkelaarsdashboard en roep PDB API aan met de x-oanor-key-header. Geen creditcard nodig voor het gratis abonnement.
Wat is de rate-limit voor PDB API?
Het gratis pakket staat 1 verzoek per seconde toe. Betaalde pakketten schalen tot 50 verzoeken per seconde op het Mega-niveau. Harde limieten geven HTTP 429 boven de quota — geen verrassende meerkosten.
Wat kost PDB API?
PDB API heeft een gratis pakket met 100 calls / maand. Betaalde pakketten beginnen bij €7.10 / maand met hogere quota's en snellere rate-limits.
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Ja. Abonnementen worden maandelijks gefactureerd en je kunt op elk moment opzeggen via je facturatie-dashboard. Geen langetermijncontracten en geen opzegkosten.
Voldoet PDB API aan de AVG?
Alle aanvragen aan PDB API lopen via onze EU-gateway. Je upstream-API-sleutel verlaat nooit onze server en er worden geen persoonsgegevens gedeeld met de upstream-leverancier behalve de aanvraag zelf.

Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.

Codefragmenten

Meld u aan om een ​​API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.

curl https://api.oanor.com/pdb-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/pdb-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/pdb-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/pdb-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Beoordelingen

Log in om te beoordelen.

Nog geen beoordelingen.

Discussie

Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.

Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.

Inloggen

Nieuwe discussie

/ 4000

📌 Vastgepind 🔒 Vergrendeld

·

· ·

/ 4000

🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.

  • Nog geen discussies — start de eerste.

Support

Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.

Meld je aan om een supportticket te openen.

Inloggen

Nieuw ticket openen

Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.

  • Nog geen tickets voor deze API.

Abonnement actief: calls kunnen direct starten.

Verstuur uw eerste aanvraag —

Abonnement actief: kopieer een fragment en start uw eerste oproep.