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API del Portal de Complejos

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El Portal de Complejos como API, impulsado por EMBL-EBI — una base de datos enciclopédica curada manualmente de complejos macromoleculares estables: ensamblajes de dos o más proteínas (y a veces ácidos nucleicos, ligandos o moléculas pequeñas) que trabajan juntos como una unidad funcional única, como ribosomas, proteasomas, ARN y ADN polimerasas, el espliceosoma, complejos de la cadena respiratoria y miles más en muchas especies. Busque los complejos por palabra clave y opcionalmente por organismo, obteniendo el identificador de acceso del Portal de Complejos (CPX-…), nombre, organismo, descripción y si es predicho computacionalmente; lea el registro completo curado de un complejo, incluyendo sus nombres recomendados y sistemáticos, sinónimos, especie, función biológica, las subunidades participantes cada una con su identificador de molécula (por ejemplo, un identificador UniProt) y estequiometría, cualquier ligando y enfermedad asociados, el tipo de evidencia y referencias cruzadas a UniProt, Gene Ontology, Reactome, Wikidata y más; y obtenga solo la composición de subunidades de un complejo. Ideal para biología estructural y de sistemas, análisis de rutas y redes, investigación de función de proteínas y tuberías bioinformáticas. Los identificadores de acceso de complejos se ven como CPX-6036. Datos del Portal de Complejos de EMBL-EBI (consorcio IMEx, CC-BY). Para redes de interacción proteína-proteína, vea la API de STRING, para secuencias de proteínas UniProt, para rutas biológicas Reactome y para familias y dominios InterPro.

#complex-portal #macromolecular-complexes #proteins #structural-biology #bioinformatics #life-sciences #ebi
api.oanor.com/complexes-api
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Especificaciones legibles por máquina para que los agentes de IA puedan integrar este API.

/api/complexes-api/openapi.json
/api/complexes-api/llms.txt

Descubrimiento: GET /api/index.json enumera todos los API.

salud API

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Otros APIs con etiquetas superpuestas.

API de Ontología Génica

Función génica como API — impulsada por QuickGO de EMBL-EBI y la Ontología Génica (GO), el vocabulario estándar que describe lo que hacen los productos génicos en tres aspectos: función molecular, proceso biológico y componente celular. Dado un gen o proteína (un acceso de UniProt), enumera cada anotación GO realizada para él — el término GO, su aspecto, el calificador, el código de evidencia, la referencia de apoyo (ej. un id de PubMed), el organismo y quién lo asignó — opcionalmente filtrado por aspecto u organismo. Consulta cualquier término GO para obtener su definición, aspecto, sinónimos y número de términos hijos; y busca en la ontología por nombre para encontrar los términos GO correctos. Los nombres de los términos GO se resuelven automáticamente en las anotaciones. Desde TP53 hasta cualquier proteína en cualquier especie, es la columna vertebral de la genómica funcional — ideal para análisis de enriquecimiento, pipelines de anotación, bioinformática y herramientas de investigación. Un recurso de anotación de función génica (qué genes tienen qué funciones, con evidencia) — distinto de la consulta genérica de términos de ontología. Datos abiertos de QuickGO de EMBL-EBI y el Consorcio GO (CC BY 4.0).

api.oanor.com/quickgo-api

API de EMDB

El Banco de Datos de Microscopía Electrónica (EMDB) como API, impulsado por EMBL-EBI — el archivo público de mapas de densidad tridimensionales de microscopía electrónica de proteínas, ácidos nucleicos y grandes complejos macromoleculares. EMDB es la contraparte de microscopía electrónica del Protein Data Bank, que alberga mapas resueltos mediante criomicroscopía electrónica de partícula única, tomografía electrónica y cristalografía electrónica, la técnica detrás de la reciente "revolución de la resolución" en biología estructural. /v1/search?q=ribosoma busca en el archivo y devuelve el ID de EMDB de cada entrada coincidente (p. ej., EMD-1010), título, método de microscopía electrónica y resolución en ångström. /v1/entry?id=EMD-1010 devuelve los metadatos de una entrada: su título, el método de EM (partícula única, tomografía, …), el estado de agregación, la resolución, la muestra biológica estudiada, palabras clave de clasificación, las fechas de depósito, publicación del mapa y última actualización, y los autores depositantes. Los IDs de EMDB tienen el formato EMD-1010, y puede pasar solo el número. Ideal para herramientas de biología estructural y criomicroscopía electrónica, aplicaciones de comparación y visualización de estructuras, y educación. Datos de EMBL-EBI EMDB (dominio público). Este es el archivo de MAPAS experimentales de microscopía electrónica — distinto de las estructuras de coordenadas atómicas (PDB), estructuras predichas (AlphaFold) y bases de datos de secuencias de proteínas (UniProt).

api.oanor.com/emdb-api

API de AlphaFold

La Base de Datos de Estructuras de Proteínas AlphaFold como una API, impulsada por EMBL-EBI y Google DeepMind. AlphaFold predice la estructura tridimensional de una proteína a partir de su secuencia de aminoácidos con precisión a nivel experimental, y la base de datos ahora cubre más de 200 millones de proteínas — casi todas las secuencias en UniProt. Busca el modelo AlphaFold de cualquier proteína por su acceso UniProt y obtén su descripción de gen y proteína, organismo y longitud de secuencia, versión del modelo y fecha de creación, la métrica de confianza global, la secuencia completa de aminoácidos, y enlaces de descarga directa a la estructura predicha como mmCIF, PDB y BinaryCIF junto con la imagen y datos del gráfico de Error Alineado Predicho (PAE); y lee la cobertura estructural de una proteína — el(los) modelo(s) predicho(s) de AlphaFold y cualquier estructura vinculada con su proveedor, categoría de modelo, método y el rango de residuos de UniProt cubierto. Ideal para biología estructural, descubrimiento de fármacos y evaluación de dianas, ingeniería de proteínas, visualización molecular y enseñanza. Las proteínas se identifican por el acceso UniProt (por ejemplo P00520 o P38398). Datos de la Base de Datos AlphaFold (CC-BY 4.0). Para estructuras 3D determinadas experimentalmente, consulta la API de PDB; para secuencias de proteínas y anotación funcional, la API de UniProt; y para familias y dominios, InterPro.

api.oanor.com/alphafold-api

API de PDB

El Banco de Datos de Proteínas RCSB como una API — estructuras macromoleculares 3D de proteínas, ácidos nucleicos y complejos, impulsado por los datos y servicios de búsqueda oficiales de RCSB PDB. Obtén una entrada de estructura por su ID de PDB de 4 caracteres para su título, método experimental (rayos X, crio-EM, RMN), resolución, palabras clave, fechas de depósito y publicación, autores, cita principal y recuentos de entidades y ensamblajes; realiza búsquedas de texto completo en todo el archivo devolviendo IDs de PDB coincidentes y el recuento total de resultados; lee una entidad polimérica para su nombre de proteína o ácido nucleico, secuencia de una letra, longitud, organismo fuente, cadenas e IDs de UniProt vinculados; lee un ensamblaje biológico para su estado oligomérico, simetría y recuentos de cadenas y átomos; lista los ligandos unidos en una estructura con sus IDs de componente y nombres; y busca cualquier componente químico (ligando) por código para su fórmula, peso, SMILES e InChIKey. Ideal para herramientas de biología estructural y descubrimiento de fármacos, visores moleculares, tuberías de bioinformática, aplicaciones educativas y paneles de investigación.

api.oanor.com/pdb-api

Preguntas frecuentes

Respuestas rápidas sobre precios, cuotas e integración.

¿Cómo obtengo una clave API para API del Portal de Complejos?
Regístrate gratis en oanor.com, genera una clave API desde el panel de desarrollador y llama a API del Portal de Complejos con la cabecera x-oanor-key. No se necesita tarjeta de crédito para el plan gratuito.
¿Cuál es el límite de velocidad de API del Portal de Complejos?
El plan gratuito permite 1 solicitud por segundo. Los planes de pago escalan hasta 50 solicitudes por segundo en el nivel Mega. Los límites rígidos devuelven HTTP 429 por encima de la cuota — sin cargos sorpresa por exceso.
¿Cuánto cuesta API del Portal de Complejos?
API del Portal de Complejos ofrece un plan gratuito con 100 llamadas / mes. Los planes de pago empiezan en €6.70 / mes con cuotas más altas y límites de tasa más rápidos.
¿Puedo cancelar mi suscripción en cualquier momento?
Sí. Los planes se facturan mensualmente y puedes cancelar en cualquier momento desde el panel de facturación. Sin contratos a largo plazo ni penalización por cancelación.
¿Cumple API del Portal de Complejos con el RGPD?
Todas las solicitudes a API del Portal de Complejos pasan por nuestra pasarela en la UE. Tu clave API upstream nunca sale de nuestro servidor y no se comparten datos personales con el proveedor upstream más allá de la solicitud enviada.

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curl https://api.oanor.com/complexes-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/complexes-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/complexes-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/complexes-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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