#proteins

Función génica como API — impulsada por QuickGO de EMBL-EBI y la Ontología Génica (GO), el vocabulario estándar que describe lo que hacen los productos génicos en tres aspectos: función molecular, proceso biológico y componente celular. Dado un gen o proteína (un acceso de UniProt), enumera cada anotación GO realizada para él — el término GO, su aspecto, el calificador, el código de evidencia, la referencia de apoyo (ej. un id de PubMed), el organismo y quién lo asignó — opcionalmente filtrado por aspecto u organismo. Consulta cualquier término GO para obtener su definición, aspecto, sinónimos y número de términos hijos; y busca en la ontología por nombre para encontrar los términos GO correctos. Los nombres de los términos GO se resuelven automáticamente en las anotaciones. Desde TP53 hasta cualquier proteína en cualquier especie, es la columna vertebral de la genómica funcional — ideal para análisis de enriquecimiento, pipelines de anotación, bioinformática y herramientas de investigación. Un recurso de anotación de función génica (qué genes tienen qué funciones, con evidencia) — distinto de la consulta genérica de términos de ontología. Datos abiertos de QuickGO de EMBL-EBI y el Consorcio GO (CC BY 4.0).

api.oanor.com/quickgo-api

El Portal de Complejos como API, impulsado por EMBL-EBI — una base de datos enciclopédica curada manualmente de complejos macromoleculares estables: ensamblajes de dos o más proteínas (y a veces ácidos nucleicos, ligandos o moléculas pequeñas) que trabajan juntos como una unidad funcional única, como ribosomas, proteasomas, ARN y ADN polimerasas, el espliceosoma, complejos de la cadena respiratoria y miles más en muchas especies. Busque los complejos por palabra clave y opcionalmente por organismo, obteniendo el identificador de acceso del Portal de Complejos (CPX-…), nombre, organismo, descripción y si es predicho computacionalmente; lea el registro completo curado de un complejo, incluyendo sus nombres recomendados y sistemáticos, sinónimos, especie, función biológica, las subunidades participantes cada una con su identificador de molécula (por ejemplo, un identificador UniProt) y estequiometría, cualquier ligando y enfermedad asociados, el tipo de evidencia y referencias cruzadas a UniProt, Gene Ontology, Reactome, Wikidata y más; y obtenga solo la composición de subunidades de un complejo. Ideal para biología estructural y de sistemas, análisis de rutas y redes, investigación de función de proteínas y tuberías bioinformáticas. Los identificadores de acceso de complejos se ven como CPX-6036. Datos del Portal de Complejos de EMBL-EBI (consorcio IMEx, CC-BY). Para redes de interacción proteína-proteína, vea la API de STRING, para secuencias de proteínas UniProt, para rutas biológicas Reactome y para familias y dominios InterPro.

api.oanor.com/complexes-api