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API de Ontología Génica

saludable 4,853 Suscriptoras

Función génica como API — impulsada por QuickGO de EMBL-EBI y la Ontología Génica (GO), el vocabulario estándar que describe lo que hacen los productos génicos en tres aspectos: función molecular, proceso biológico y componente celular. Dado un gen o proteína (un acceso de UniProt), enumera cada anotación GO realizada para él — el término GO, su aspecto, el calificador, el código de evidencia, la referencia de apoyo (ej. un id de PubMed), el organismo y quién lo asignó — opcionalmente filtrado por aspecto u organismo. Consulta cualquier término GO para obtener su definición, aspecto, sinónimos y número de términos hijos; y busca en la ontología por nombre para encontrar los términos GO correctos. Los nombres de los términos GO se resuelven automáticamente en las anotaciones. Desde TP53 hasta cualquier proteína en cualquier especie, es la columna vertebral de la genómica funcional — ideal para análisis de enriquecimiento, pipelines de anotación, bioinformática y herramientas de investigación. Un recurso de anotación de función génica (qué genes tienen qué funciones, con evidencia) — distinto de la consulta genérica de términos de ontología. Datos abiertos de QuickGO de EMBL-EBI y el Consorcio GO (CC BY 4.0).

#gene-ontology #genomics #bioinformatics #annotations #proteins #science
api.oanor.com/quickgo-api
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Especificaciones legibles por máquina para que los agentes de IA puedan integrar este API.

/api/quickgo-api/openapi.json
/api/quickgo-api/llms.txt

Descubrimiento: GET /api/index.json enumera todos los API.

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saludable
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217 ms
Sondas del servidor · 24h
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  • 2,700 llamadas/mes
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  • Sin tarjeta de crédito
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Starter

€7.30 /mes

  • 54,000 llamadas / mes
  • 8 solicitudes / segundo
  • Límite máximo (429 por encima de la cuota, sin excedente)
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  • 8 solicitudes/segundo
  • Filtros de aspecto y taxón
  • Soporte por correo electrónico
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Pro

€23.00 /mes

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  • Límite máximo (429 por encima de la cuota, sin excedente)
  • 255k llamadas/mes
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  • Aplicaciones de genómica funcional
  • Soporte prioritario
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Mega

€60.50 /mes

  • 900,000 llamadas / mes
  • 50 solicitudes / segundo
  • Límite máximo (429 por encima de la cuota, sin excedente)
  • 900k llamadas/mes
  • 50 req/seg
  • Plataforma de anotación/enriquecimiento
  • SLA dedicado
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Relacionado APIs

Otros APIs con etiquetas superpuestas.

API de Ontología OLS

El Servicio de Búsqueda de Ontologías (OLS) de EMBL-EBI como una API — un punto de acceso único a más de 280 ontologías biomédicas y científicas y vocabularios controlados en un solo lugar: la Ontología Génica (GO), la Ontología de Enfermedades Humanas (DOID), la Ontología del Fenotipo Humano (HP), ChEBI (entidades químicas), Uberon (anatomía), la Ontología de Factores Experimentales (EFO), Mondo, NCIt y muchos más. /v1/search?q=diabetes busca términos en todas las ontologías (o restringe a una con ontology=doid), devolviendo la etiqueta de cada coincidencia, el id OBO (como DOID:9351 o GO:0008150), la ontología, el IRI y una definición breve. /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 devuelve el detalle de un solo término: su etiqueta, definición, IRI, sinónimos y si está obsoleto. /v1/ontologies navega por las ontologías disponibles con su id, título, descripción y número de términos. Los ids OBO se ven como DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 o CHEBI:15377. Ideal para procesamiento de lenguaje natural biomédico, anotación y armonización de datos, autocompletado sobre terminología científica, y herramientas semánticas y de grafos de conocimiento. Datos de EMBL-EBI OLS (abierto). Esta es una búsqueda general de ontologías/vocabularios controlados que abarca muchos dominios — más amplia que un solo tesauro médico como MeSH.

api.oanor.com/ols-api

API de Ontología

Ontologías biomédicas como API, impulsadas por el Servicio de Búsqueda de Ontologías del EBI (OLS). Busque en más de 280 ontologías curadas — enfermedades (MONDO), fenotipos humanos (HP), la Ontología Génica (GO), anatomía (UBERON), tipos celulares (CL), química (ChEBI), factores experimentales (EFO), el Tesauro del NCI y muchas más — para encontrar términos por nombre; explore el catálogo completo de ontologías con versiones y recuentos de términos; lea cualquier término para obtener su definición, sinónimos exactos, id OBO, IRI y estado de obsoleto; y recorra la jerarquía de clases a través de los padres e hijos directos de un término. Ideal para armonización y codificación de datos clínicos, búsqueda biomédica y autocompletado, enriquecimiento de grafos de conocimiento, anotación y curaduría, y aplicaciones de investigación y EHR que necesiten vocabularios estándar. Los ids OBO se ven como MONDO:0005148 o GO:0008150.

api.oanor.com/ontology-api

API de Ensamblajes Genómicos

Ensamblajes genómicos de referencia como una API — impulsada por NCBI Assembly, el registro de construcciones genómicas para organismos en todo el árbol de la vida. Busque ensamblajes por organismo (o texto libre) y consulte los metadatos de cualquier ensamblaje: su acceso (GCF_… RefSeq o GCA_… GenBank), nombre (ej. GRCh38.p14), organismo e ID de taxón, nivel de ensamblaje (genoma completo, cromosoma, andamio o contig), estadísticas de contigüidad (N50 de contig y andamio), cobertura de secuenciación, categoría RefSeq, nombres UCSC y Ensembl, la organización que lo envió, fecha de publicación y rutas de descarga FTP. Desde el genoma de referencia humano hasta cualquier microbio, planta o animal secuenciado, convierte el registro de ensamblajes genómicos en una API limpia de búsqueda y obtención. Un registro de ensamblajes genómicos — distinto de las bases de datos de secuencias (ENA), anotación genómica (Ensembl), variantes (ClinVar, dbVar) y expresión génica (GEO). Datos abiertos de NCBI Assembly (dominio público).

api.oanor.com/genomes-api

API de Expresión Génica

Experimentos de genómica funcional como una API — impulsada por NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), el repositorio público más grande de datos de expresión génica. GEO archiva series de expresión y conjuntos de datos curados de experimentos de microarreglos y secuenciación de alto rendimiento en todos los organismos. Busque experimentos por palabra clave y opcionalmente por organismo, y consulte cualquier serie o conjunto de datos para obtener sus metadatos: título, resumen, tipo de ensayo (perfil de expresión por microarreglo o por secuenciación), organismo, número de muestras, plataforma y la publicación detrás de él. Desde estudios de estrés de células β hasta transcriptómica del cáncer en humanos y ratones, convierte el archivo GEO en una API simple de búsqueda y obtención para transcriptómica, bioinformática y descubrimiento de datos de investigación. Un repositorio de conjuntos de datos de expresión génica / genómica funcional — distinto de las bases de datos de secuencia (ENA), variantes (ClinVar, dbVar), estructura (PDB) y ontología. Datos abiertos de NCBI GEO (dominio público).

api.oanor.com/geodatasets-api

Preguntas frecuentes

Respuestas rápidas sobre precios, cuotas e integración.

¿Cómo obtengo una clave API para API de Ontología Génica?
Regístrate gratis en oanor.com, genera una clave API desde el panel de desarrollador y llama a API de Ontología Génica con la cabecera x-oanor-key. No se necesita tarjeta de crédito para el plan gratuito.
¿Cuál es el límite de velocidad de API de Ontología Génica?
El plan gratuito permite 1 solicitud por segundo. Los planes de pago escalan hasta 50 solicitudes por segundo en el nivel Mega. Los límites rígidos devuelven HTTP 429 por encima de la cuota — sin cargos sorpresa por exceso.
¿Cuánto cuesta API de Ontología Génica?
API de Ontología Génica ofrece un plan gratuito con 100 llamadas / mes. Los planes de pago empiezan en €7.30 / mes con cuotas más altas y límites de tasa más rápidos.
¿Puedo cancelar mi suscripción en cualquier momento?
Sí. Los planes se facturan mensualmente y puedes cancelar en cualquier momento desde el panel de facturación. Sin contratos a largo plazo ni penalización por cancelación.
¿Cumple API de Ontología Génica con el RGPD?
Todas las solicitudes a API de Ontología Génica pasan por nuestra pasarela en la UE. Tu clave API upstream nunca sale de nuestro servidor y no se comparten datos personales con el proveedor upstream más allá de la solicitud enviada.

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Fragmentos de código

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curl https://api.oanor.com/quickgo-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/quickgo-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/quickgo-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/quickgo-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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