A project's metadata
API · /pride-api
PRIDE API
Het PRIDE-proteomicsarchief als API, aangedreven door het EMBL-EBI PRIDE Archive — 's werelds grootste openbare repository van massaspectrometrie-proteomicsgegevens en een oprichtend lid van ProteomeXchange. Doorzoek de openbare proteomics-experimenten op trefwoord (met terugkeer van elk project's toegangsnummer, titel, organismen, ziekten en instrumenten); lees de volledige metadata van een project inclusief de beschrijving, trefwoorden, organismen en orgaandelen, massaspectrometrie-instrumenten, software, de geïdentificeerde eiwitmodificaties, monster- en dataverwerkingsprotocollen, indieners, affiliaties en de gekoppelde publicatie (DOI en PubMed); toon de gegevensbestanden van een project met hun categorie, formaat, grootte en een directe downloadlink; en verken facetten — de ziekten, organismen, instrumenten, experimenttypen, software en landen die vertegenwoordigd zijn in overeenkomende projecten — voor ontdekking. Ideaal voor proteomics- en systeembiologieonderzoek, hergebruik van datasets en meta-analyse, bioinformatica-pijplijnen en tools die experimenteel bewijs integreren. Projecttoegangsnummers zien eruit als PXD000001. Gegevens van EMBL-EBI.
API-gezondheid
gezond- Uptime
- 100.00%
- Serversondes · 24 uur
- Gem. latentie
- 301 ms
- Serversondes · 24 uur
- Abonnees
- 4,443
- actief
- Totaal aantal oproepen
- 15
- laatste 7 dagen
Prijzen
Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.
Free
Vrij
- 540 oproepen / maand
- 2 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 540 oproepen/maand
- 2 verzoeken/sec
- Zoeken, projecten en bestanden
- Geen creditcard
Starter
€6.60 /maand
- 19,500 oproepen / maand
- 6 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 19.5k oproepen/maand
- 6 verzoeken/sec
- Project- en bestandsopzoekingen
- E-mailondersteuning
Pro
€20.00 /maand
- 88,000 oproepen / maand
- 15 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 88k oproepen/maand
- 15 verzoeken/sec
- Hergebruik van datasets & meta-analyse
- Prioritaire ondersteuning
Mega
€55.50 /maand
- 340,000 oproepen / maand
- 40 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 340k oproepen/maand
- 40 verzoeken/sec
- High-throughput proteomics
- Toegewijde SLA
Gebouwd door
Gerelateerd APIs
Andere APIs met overlappende tags.
UniProt API
De UniProt-eiwitkennisdatabase als een API, aangedreven door de officiële UniProt REST-service, samengesteld door EMBL-EBI, SIB en PIR. Zoek elk eiwit op via zijn UniProt-toegangsnummer voor eiwit- en gennamen, organisme, lengte, massa, functie, trefwoorden, Gene Ontology (GO)-termen en gekoppelde PDB 3D-structuren; voer full-text eiwitzoekopdrachten uit, gefilterd op organisme (NCBI-taxon-id) en Swiss-Prot-beoordelingsstatus; haal aminozuursequenties op met FASTA, molecuulgewicht en CRC64-checksum; vermeld sequentiekenmerken zoals signaalpeptiden, ketens, domeinen, actieve en bindingsplaatsen, gemodificeerde residuen en natuurlijke varianten, met een uitsplitsing per type; los NCBI-taxonomieknooppunten op met hun volledige afstamming; en haal referentieproteomen op met eiwitaantallen en genoomassemblage-ID's. Over alle rijken van het leven, van mens tot bacterie. Ideaal voor bioinformatica-pijplijnen, geneesmiddelenontdekking en proteomicatools, sequentieanalyse-dashboards, academische onderzoeksapps en levenswetenschap-chatbots.
api.oanor.com/uniprot-api
MetaboLights API
MetaboLights als API, aangedreven door EMBL-EBI — 's werelds belangrijkste open repository voor metabolomics-experimenten (NMR-spectroscopie en massaspectrometrie) en een zusterbron van PRIDE voor proteomics. Doorzoek de openbare metabolomics-studies op trefwoord (met terugkeer van elke studie's toegangscode, titel, beschrijving en organisme); lees de volledige metadata van een studie inclusief de samenvatting, status, inzendings- en releasedatums, studiedesign-beschrijvingen, experimentele factoren, de analytische assays met hun meettype, technologie en platform, de bijdragers en hun rollen, de gelinkte publicaties met DOI- en PubMed-identificaties, indieners, aantal monsters, FTP-download-URL en datalicentie; inspecteer de analytische workflow — elk protocol met zijn naam, type, beschrijving en parameters (monsterverzameling, extractie, chromatografie, NMR/MS-spectroscopie, datatransformatie en metabolietidentificatie); en vermeld de bestudeerde organismen en organismendelen met hun ontologieteremen. Ideaal voor metabolomics- en systeembiologie-onderzoek, hergebruik van datasets en meta-analyse, bioinformatica-pijplijnen en tools die experimenteel bewijs integreren. Studie-toegangscodes zien eruit als MTBLS1. Gegevens van EMBL-EBI MetaboLights.
api.oanor.com/metabolights-api
Gene Expression API
Functionele-genomica-experimenten als een API — aangedreven door NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), de grootste openbare repository van genexpressiegegevens. GEO archiveert expressieseries en samengestelde datasets van microarray- en high-throughput-sequencing-experimenten voor elk organisme. Zoek experimenten op trefwoord en optioneel op organisme, en raadpleeg elke serie of dataset om de metadata te krijgen: titel, samenvatting, assaytype (expressieprofilering door array of door sequencing), organisme, aantal monsters, platform en de publicatie erachter. Van β-celstressstudies tot kankertranscriptomics bij mens en muis, het verandert het GEO-archief in een eenvoudige zoek-en-ophaal-API voor transcriptomics, bio-informatica en onderzoeksgegevensontdekking. Een genexpressie / functionele-genomica-datasetrepository — te onderscheiden van sequentie- (ENA), variant- (ClinVar, dbVar), structuur- (PDB) en ontologiedatabases. Open data van NCBI GEO (publiek domein).
api.oanor.com/geodatasets-api
DataCite API
DataCite als API — het wereldwijde register van DOI's (Digital Object Identifiers) voor onderzoeksoutputs. Waar Crossref DOI's registreert voor tijdschriftartikelen, registreert en beschrijft DataCite DOI's voor onderzoeksdata, software, monsters, dissertaties, preprints, modellen, afbeeldingen en andere outputs, van repositories zoals Zenodo, Dryad en duizenden instellingen. /v1/search?query=climate doorzoekt het register op volledige tekst en kan worden verfijnd op brontype (type=dataset, software, text, image, audiovisual, collection, model en meer), waarbij elke DOI wordt geretourneerd met zijn titel, type, makers, uitgever en publicatiejaar. /v1/doi?id=10.5281/zenodo.3509134 retourneert de volledige metadata van een enkele DOI — titel, brontype, makers, uitgever, publicatiejaar, beschrijving, onderwerpen, versie, licentie en registratiedatum. DOI's zien eruit als 10.5281/zenodo.3509134 (Zenodo) of 10.5061/dryad.xxxx (Dryad). Ideaal voor het ontdekken en citeren van onderzoeksdata, tools voor datarepositories en referentiebeheer, softwarecitatie-functies en reproduceerbaarheidswerkstromen. Metadata is CC0 van DataCite. Dit is het register van onderzoeksdata en software-DOI's — te onderscheiden van de DOI-index voor tijdschriftartikelen (Crossref) en van preprint- en open-accessdiensten.
api.oanor.com/datacite-api
Veelgestelde vragen
Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.
Hoe krijg ik een API-sleutel voor PRIDE API?
Wat is de rate-limit voor PRIDE API?
Wat kost PRIDE API?
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Voldoet PRIDE API aan de AVG?
Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.
Codefragmenten
Meld u aan om een API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.
curl https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())
Beoordelingen
Log in om te beoordelen.
Nog geen beoordelingen.
Discussie
Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.
Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.
InloggenNieuwe discussie
·
-
Antwoord van aanbieder
🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.
-
·
- Nog geen discussies — start de eerste.
Support
Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.
Meld je aan om een supportticket te openen.
InloggenNieuw ticket openen
Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.
-
·
Urgent - Nog geen tickets voor deze API.