#mass-spectrometry

MetaboLights als API, aangedreven door EMBL-EBI — 's werelds belangrijkste open repository voor metabolomics-experimenten (NMR-spectroscopie en massaspectrometrie) en een zusterbron van PRIDE voor proteomics. Doorzoek de openbare metabolomics-studies op trefwoord (met terugkeer van elke studie's toegangscode, titel, beschrijving en organisme); lees de volledige metadata van een studie inclusief de samenvatting, status, inzendings- en releasedatums, studiedesign-beschrijvingen, experimentele factoren, de analytische assays met hun meettype, technologie en platform, de bijdragers en hun rollen, de gelinkte publicaties met DOI- en PubMed-identificaties, indieners, aantal monsters, FTP-download-URL en datalicentie; inspecteer de analytische workflow — elk protocol met zijn naam, type, beschrijving en parameters (monsterverzameling, extractie, chromatografie, NMR/MS-spectroscopie, datatransformatie en metabolietidentificatie); en vermeld de bestudeerde organismen en organismendelen met hun ontologieteremen. Ideaal voor metabolomics- en systeembiologie-onderzoek, hergebruik van datasets en meta-analyse, bioinformatica-pijplijnen en tools die experimenteel bewijs integreren. Studie-toegangscodes zien eruit als MTBLS1. Gegevens van EMBL-EBI MetaboLights.

api.oanor.com/metabolights-api

Het PRIDE-proteomicsarchief als API, aangedreven door het EMBL-EBI PRIDE Archive — 's werelds grootste openbare repository van massaspectrometrie-proteomicsgegevens en een oprichtend lid van ProteomeXchange. Doorzoek de openbare proteomics-experimenten op trefwoord (met terugkeer van elk project's toegangsnummer, titel, organismen, ziekten en instrumenten); lees de volledige metadata van een project inclusief de beschrijving, trefwoorden, organismen en orgaandelen, massaspectrometrie-instrumenten, software, de geïdentificeerde eiwitmodificaties, monster- en dataverwerkingsprotocollen, indieners, affiliaties en de gekoppelde publicatie (DOI en PubMed); toon de gegevensbestanden van een project met hun categorie, formaat, grootte en een directe downloadlink; en verken facetten — de ziekten, organismen, instrumenten, experimenttypen, software en landen die vertegenwoordigd zijn in overeenkomende projecten — voor ontdekking. Ideaal voor proteomics- en systeembiologieonderzoek, hergebruik van datasets en meta-analyse, bioinformatica-pijplijnen en tools die experimenteel bewijs integreren. Projecttoegangsnummers zien eruit als PXD000001. Gegevens van EMBL-EBI.

api.oanor.com/pride-api