A project's metadata
API · /pride-api
PRIDE API
Το αρχείο πρωτεομικής PRIDE ως API, που υποστηρίζεται από το EMBL-EBI PRIDE Archive — το μεγαλύτερο δημόσιο αποθετήριο δεδομένων πρωτεομικής φασματομετρίας μάζας στον κόσμο και ιδρυτικό μέλος του ProteomeXchange. Αναζητήστε δημόσια πειράματα πρωτεομικής με λέξη-κλειδί (επιστρέφοντας το accession, τον τίτλο, τους οργανισμούς, τις ασθένειες και τα όργανα κάθε έργου). Διαβάστε τα πλήρη μεταδεδομένα ενός έργου, συμπεριλαμβανομένων της περιγραφής, των λέξεων-κλειδιών, των οργανισμών και των μερών οργανισμών, των οργάνων φασματομετρίας μάζας, του λογισμικού, των ταυτοποιημένων τροποποιήσεων πρωτεϊνών, των πρωτοκόλλων επεξεργασίας δειγμάτων και δεδομένων, των υποβαλλόντων, των συνεργασιών και της συνδεδεμένης δημοσίευσης (DOI και PubMed). Καταγράψτε τα αρχεία δεδομένων ενός έργου με την κατηγορία, τη μορφή, το μέγεθος και έναν άμεσο σύνδεσμο λήψης. Εξερευνήστε πτυχές — τις ασθένειες, τους οργανισμούς, τα όργανα, τους τύπους πειραμάτων, το λογισμικό και τις χώρες που εκπροσωπούνται σε αντίστοιχα έργα — για ανακάλυψη. Ιδανικό για έρευνα πρωτεομικής και συστημικής βιολογίας, επαναχρησιμοποίηση συνόλων δεδομένων και μετα-ανάλυση, βιοπληροφορικές ροές εργασίας και εργαλεία που ενσωματώνουν πειραματικά δεδομένα. Τα accessions έργων μοιάζουν με PXD000001. Δεδομένα από EMBL-EBI.
Υγεία API
υγιής- Χρόνος λειτουργίας
- 100.00%
- Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
- Μέση καθυστέρηση
- 301 ms
- Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
- Συνδρομητές
- 4,443
- ενεργός
- Σύνολο κλήσεων
- 15
- τις τελευταίες 7 ημέρες
Τιμολόγηση
Επιλέξτε μια βαθμίδα — χρεώνεται μηνιαία, ακυρώστε ανά πάσα στιγμή.
Free
Δωρεάν
- 540 κλήσεις / μήνα
- 2 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 540 κλήσεις/μήνα
- 2 αιτήσεις/δευτ.
- Αναζήτηση, έργα & αρχεία
- Χωρίς πιστωτική κάρτα
Starter
€6.60 /μήνας
- 19,500 κλήσεις / μήνα
- 6 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 19.5k κλήσεις/μήνα
- 6 αιτήσεις/δευτ.
- Αναζήτηση έργου & αρχείου
- Υποστήριξη μέσω email
Pro
€20.00 /μήνας
- 88,000 κλήσεις / μήνα
- 15 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 88k κλήσεις/μήνα
- 15 req/sec
- Επαναχρησιμοποίηση συνόλων δεδομένων & μετα-ανάλυση
- Υποστήριξη προτεραιότητας
Mega
€55.50 /μήνας
- 340,000 κλήσεις / μήνα
- 40 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 340k κλήσεις/μήνα
- 40 req/sec
- Πρωτεομική υψηλής απόδοσης
- Αφιερωμένο SLA
Κατασκευάστηκε από
Σχετικό API
Άλλο API με επικαλυπτόμενες ετικέτες.
UniProt API
Η βάση γνώσης πρωτεϊνών UniProt ως API, που υποστηρίζεται από την επίσημη υπηρεσία REST UniProt που επιμελούνται οι EMBL-EBI, SIB και PIR. Αναζητήστε οποιαδήποτε πρωτεΐνη με το αναγνωριστικό UniProt για ονόματα πρωτεϊνών και γονιδίων, οργανισμό, μήκος, μάζα, λειτουργία, λέξεις-κλειδιά, όρους Gene Ontology (GO) και συνδεδεμένες τρισδιάστατες δομές PDB· εκτελέστε αναζητήσεις πλήρους κειμένου πρωτεϊνών φιλτραρισμένες ανά οργανισμό (αναγνωριστικό ταξινομίας NCBI) και κατάσταση αναθεώρησης Swiss-Prot· λάβετε αλληλουχίες αμινοξέων με FASTA, μοριακό βάρος και άθροισμα ελέγχου CRC64· καταγράψτε χαρακτηριστικά αλληλουχίας όπως πεπτίδια σήματος, αλυσίδες, τομείς, ενεργές θέσεις και θέσεις δέσμευσης, τροποποιημένα κατάλοιπα και φυσικές παραλλαγές, με ανάλυση ανά τύπο· επιλύστε κόμβους ταξινομίας NCBI με την πλήρη γενεαλογία τους· και αντλήστε πρωτεώματα αναφοράς με μετρήσεις πρωτεϊνών και αναγνωριστικά συναρμολόγησης γονιδιώματος. Σε όλα τα βασίλεια της ζωής, από τον άνθρωπο έως τα βακτήρια. Ιδανικό για βιοπληροφορικές σωληνώσεις, εργαλεία ανακάλυψης φαρμάκων και πρωτεωμικής, πίνακες ελέγχου ανάλυσης αλληλουχιών, εφαρμογές ακαδημαϊκής έρευνας και chatbots επιστημών ζωής.
api.oanor.com/uniprot-api
API MetaboLights
Το MetaboLights ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — το κορυφαίο ανοιχτό αποθετήριο στον κόσμο για πειράματα μεταβολομικής (φασματοσκοπία NMR και φασματομετρία μάζας) και αδελφός πόρος του PRIDE για πρωτεομική. Αναζητήστε τις δημόσιες μελέτες μεταβολομικής με λέξη-κλειδί (επιστρέφοντας τον κωδικό πρόσβασης, τον τίτλο, την περιγραφή και τον οργανισμό κάθε μελέτης)· διαβάστε τα πλήρη μεταδεδομένα μιας μελέτης, συμπεριλαμβανομένης της περίληψης, της κατάστασης, των ημερομηνιών υποβολής και δημοσίευσης, των περιγραφικών παραγόντων σχεδιασμού της μελέτης, των πειραματικών παραγόντων, των αναλυτικών δοκιμασιών με τον τύπο μέτρησης, την τεχνολογία και την πλατφόρμα τους, των συντελεστών και των ρόλων τους, των συνδεδεμένων δημοσιεύσεων με αναγνωριστικά DOI και PubMed, των υποβαλλόντων, του αριθμού δειγμάτων, της διεύθυνσης URL λήψης FTP και της άδειας δεδομένων· επιθεωρήστε την αναλυτική ροή εργασίας — κάθε πρωτόκολλο με το όνομα, τον τύπο, την περιγραφή και τις παραμέτρους του (συλλογή δειγμάτων, εκχύλιση, χρωματογραφία, φασματοσκοπία NMR/MS, μετασχηματισμός δεδομένων και ταυτοποίηση μεταβολιτών)· και καταγράψτε τους οργανισμούς και τα μέρη οργανισμών που μελετήθηκαν με τους όρους οντολογίας τους. Ιδανικό για έρευνα μεταβολομικής και συστημικής βιολογίας, επαναχρησιμοποίηση συνόλων δεδομένων και μετα-ανάλυση, βιοπληροφορικές αγωγούς και εργαλεία που ενσωματώνουν πειραματικές αποδείξεις. Οι κωδικοί πρόσβασης μελετών μοιάζουν με MTBLS1. Δεδομένα από το EMBL-EBI MetaboLights.
api.oanor.com/metabolights-api
API Γονιδιακής Έκφρασης
Πειράματα λειτουργικής γονιδιωματικής ως API — υποστηρίζεται από το NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), το μεγαλύτερο δημόσιο αποθετήριο δεδομένων γονιδιακής έκφρασης. Το GEO αρχειοθετεί σειρές έκφρασης και επιμελημένα σύνολα δεδομένων από πειράματα μικροσυστοιχιών και αλληλούχησης υψηλής απόδοσης σε κάθε οργανισμό. Αναζητήστε πειράματα με λέξη-κλειδί και προαιρετικά με οργανισμό, και αναζητήστε οποιαδήποτε σειρά ή σύνολο δεδομένων για να λάβετε τα μεταδεδομένα του: τίτλο, περίληψη, τύπο ανάλυσης (προφίλ έκφρασης με μικροσυστοιχία ή με αλληλούχηση), οργανισμό, αριθμό δειγμάτων, πλατφόρμα και τη δημοσίευση που το υποστηρίζει. Από μελέτες στρες β-κυττάρων έως μεταγραφομική καρκίνου σε άνθρωπο και ποντίκι, μετατρέπει το αρχείο GEO σε ένα απλό API αναζήτησης και ανάκτησης για μεταγραφομική, βιοπληροφορική και ανακάλυψη ερευνητικών δεδομένων. Ένα αποθετήριο συνόλων δεδομένων γονιδιακής έκφρασης / λειτουργικής γονιδιωματικής — διακριτό από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), παραλλαγών (ClinVar, dbVar), δομής (PDB) και οντολογιών. Ανοικτά δεδομένα από το NCBI GEO (δημόσιος τομέας).
api.oanor.com/geodatasets-api
API DataCite
Το DataCite ως API — το παγκόσμιο μητρώο DOIs (Ψηφιακών Αναγνωριστικών Αντικειμένων) για ερευνητικά αποτελέσματα. Ενώ το Crossref καταχωρεί DOIs για άρθρα περιοδικών, το DataCite καταχωρεί και περιγράφει DOIs για ερευνητικά δεδομένα, λογισμικό, δείγματα, διατριβές, προεκτυπώσεις, μοντέλα, εικόνες και άλλα αποτελέσματα, από αποθετήρια όπως το Zenodo, το Dryad και χιλιάδες ιδρύματα. Το /v1/search?query=climate πραγματοποιεί αναζήτηση πλήρους κειμένου στο μητρώο και μπορεί να περιοριστεί ανά τύπο πόρου (type=dataset, software, text, image, audiovisual, collection, model και άλλα), επιστρέφοντας κάθε DOI με τον τίτλο, τον τύπο, τους δημιουργούς, τον εκδότη και το έτος δημοσίευσής του. Το /v1/doi?id=10.5281/zenodo.3509134 επιστρέφει τα πλήρη μεταδεδομένα ενός μόνο DOI — τίτλο, τύπο πόρου, δημιουργούς, εκδότη, έτος δημοσίευσης, περιγραφή, θέματα, έκδοση, άδεια και ημερομηνία καταχώρισης. Τα DOIs μοιάζουν με 10.5281/zenodo.3509134 (Zenodo) ή 10.5061/dryad.xxxx (Dryad). Ιδανικό για ανακάλυψη και παραπομπή ερευνητικών δεδομένων, εργαλεία αποθετηρίων δεδομένων και διαχείρισης αναφορών, λειτουργίες παραπομπής λογισμικού και ροές εργασίας αναπαραγωγιμότητας. Τα μεταδεδομένα είναι CC0 από το DataCite. Αυτό είναι το μητρώο DOIs ερευνητικών δεδομένων και λογισμικού — διακριτό από το ευρετήριο DOIs άρθρων περιοδικών (Crossref) και από υπηρεσίες προεκτυπώσεων και ανοικτής πρόσβασης.
api.oanor.com/datacite-api
Συχνές ερωτήσεις
Γρήγορες απαντήσεις για τιμές, ποσοστώσεις και ενσωμάτωση.
Πώς αποκτώ ένα κλειδί API για το PRIDE API;
Ποιο είναι το όριο ρυθμού του PRIDE API;
Πόσο κοστίζει το PRIDE API;
Μπορώ να ακυρώσω τη συνδρομή μου ανά πάσα στιγμή;
Είναι το PRIDE API συμβατό με τον GDPR;
Επιλέξτε ένα τελικό σημείο από τη λίστα στα αριστερά για να δείτε τις λεπτομέρειες και δοκιμάστε το.
Αποσπάσματα κώδικα
Εγγραφείτε για να λάβετε ένα API key και, στη συνέχεια, καλέστε οποιαδήποτε διαδρομή κάτω από το slug σας.
curl https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/pride-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())
Αξιολογήσεις
Συνδεθείτε για να βαθμολογήσετε.
Δεν υπάρχουν ακόμη κριτικές.
Συζήτηση
Κάνε ερωτήσεις, μοιράσου συμβουλές, πάρε απαντήσεις από τον πάροχο και άλλους προγραμματιστές. Δημόσιο — όλοι μπορούν να διαβάσουν.
Συνδέσου για να γράψεις ή να απαντήσεις.
ΣύνδεσηΝέα συζήτηση
·
-
Απάντηση παρόχου
🔒 Η συζήτηση είναι κλειδωμένη — δεν επιτρέπονται νέες απαντήσεις.
-
·
- Δεν υπάρχουν συζητήσεις — ξεκίνα την πρώτη.
Υποστήριξη
Ιδιωτική υποστήριξη 1:1 με τον πάροχο — χρέωση, ενσωμάτωση, λογαριασμός. Μόνο εσύ και η ομάδα του παρόχου βλέπετε αυτά τα threads.
Συνδέσου για να ανοίξεις ticket υποστήριξης.
ΣύνδεσηΆνοιγμα νέου ticket
Περιέγραψε με τι χρειάζεσαι βοήθεια. Η ομάδα λαμβάνει email και απαντά στη σελίδα του ticket.
-
·
Επείγουσα - Δεν υπάρχουν tickets για αυτό το API.