AlphaFold predicted structure
API · /alphafold-api
API AlphaFold
Η βάση δεδομένων δομών πρωτεϊνών AlphaFold ως API, με την υποστήριξη των EMBL-EBI και Google DeepMind. Το AlphaFold προβλέπει την τρισδιάστατη δομή μιας πρωτεΐνης από την αλληλουχία αμινοξέων της με ακρίβεια πειραματικού επιπέδου και η βάση δεδομένων καλύπτει πλέον πάνω από 200 εκατομμύρια πρωτεΐνες — σχεδόν κάθε αλληλουχία στο UniProt. Αναζητήστε το μοντέλο AlphaFold για οποιαδήποτε πρωτεΐνη με το αναγνωριστικό UniProt της και λάβετε την περιγραφή γονιδίου και πρωτεΐνης, τον οργανισμό και το μήκος αλληλουχίας, την έκδοση μοντέλου και την ημερομηνία δημιουργίας, τη συνολική μετρική εμπιστοσύνης, την πλήρη αλληλουχία αμινοξέων και άμεσους συνδέσμους λήψης της προβλεπόμενης δομής ως mmCIF, PDB και BinaryCIF μαζί με την εικόνα και τα δεδομένα του Προβλεπόμενου Σφάλματος Ευθυγράμμισης (PAE)· και διαβάστε τη δομική κάλυψη μιας πρωτεΐνης — τα προβλεπόμενα μοντέλα AlphaFold και τυχόν συνδεδεμένες δομές με τον πάροχο, την κατηγορία μοντέλου, τη μέθοδο και το εύρος υπολειμμάτων UniProt που καλύπτεται. Ιδανικό για δομική βιολογία, ανακάλυψη φαρμάκων και αξιολόγηση στόχων, πρωτεϊνική μηχανική, μοριακή οπτικοποίηση και διδασκαλία. Οι πρωτεΐνες αναγνωρίζονται με αναγνωριστικό UniProt (για παράδειγμα P00520 ή P38398). Δεδομένα από τη βάση δεδομένων AlphaFold (CC-BY 4.0). Για πειραματικά προσδιορισμένες τρισδιάστατες δομές, δείτε το API PDB, για αλληλουχίες πρωτεϊνών και λειτουργική σήμανση το API UniProt και για οικογένειες και τομείς το InterPro.
Υγεία API
υποβαθμισμένος- Χρόνος λειτουργίας
- 87.50%
- Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
- Μέση καθυστέρηση
- 100 ms
- Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
- Συνδρομητές
- 3,074
- ενεργός
- Σύνολο κλήσεων
- 9
- τις τελευταίες 7 ημέρες
Τιμολόγηση
Επιλέξτε μια βαθμίδα — χρεώνεται μηνιαία, ακυρώστε ανά πάσα στιγμή.
Free
Δωρεάν
- 560 κλήσεις / μήνα
- 2 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 560 κλήσεις/μήνα
- 2 αιτήσεις/δευτ.
- Προβλέψεις & δομική κάλυψη
- Χωρίς πιστωτική κάρτα
Starter
€6.90 /μήνας
- 21,100 κλήσεις / μήνα
- 6 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 21.1k κλήσεις/μήνα
- 6 αιτήσεις/δευτ.
- Σύνδεσμοι λήψης μοντέλου
- Υποστήριξη μέσω email
Pro
€21.10 /μήνας
- 93,500 κλήσεις / μήνα
- 15 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 93.5k κλήσεις/μήνα
- 15 αιτήσεις/δευτερόλεπτο
- Ανακάλυψη & μηχανική φαρμάκων
- Υποστήριξη προτεραιότητας
Mega
€58.50 /μήνας
- 405,000 κλήσεις / μήνα
- 40 αιτήματα / δευτερόλεπτο
- Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
- 405k κλήσεις/μήνα
- 40 αιτήσεις/δευτερόλεπτο
- Δομική βιολογία υψηλής απόδοσης
- Αφιερωμένο SLA
Κατασκευάστηκε από
Σχετικό API
Άλλο API με επικαλυπτόμενες ετικέτες.
PDB API
Η RCSB Protein Data Bank ως API — τρισδιάστατες μακρομοριακές δομές πρωτεϊνών, νουκλεϊκών οξέων και συμπλόκων, υποστηριζόμενες από τα επίσημα δεδομένα και τις υπηρεσίες αναζήτησης του RCSB PDB. Λάβετε μια καταχώρηση δομής με το 4-χαρακτήρων αναγνωριστικό PDB για τον τίτλο, τη μέθοδο πειραματισμού (ακτίνες Χ, cryo-EM, NMR), την ανάλυση, λέξεις-κλειδιά, ημερομηνίες κατάθεσης και δημοσίευσης, συγγραφείς, κύρια παραπομπή και μετρήσεις οντοτήτων & συναρμολογήσεων· εκτελέστε αναζήτηση πλήρους κειμένου σε ολόκληρο το αρχείο επιστρέφοντας τα αντίστοιχα αναγνωριστικά PDB και τον συνολικό αριθμό αποτελεσμάτων· διαβάστε μια πολυμερή οντότητα για το όνομα της πρωτεΐνης ή του νουκλεϊκού οξέος, την αλληλουχία μονογραμμάτων, το μήκος, τον οργανισμό προέλευσης, τις αλυσίδες και τα συνδεδεμένα αναγνωριστικά UniProt· διαβάστε μια βιολογική συναρμολόγηση για την ολιγομερή κατάσταση, τη συμμετρία και τις μετρήσεις αλυσίδων & ατόμων· λίστα των συνδεδεμένων προσδετών σε μια δομή με τα αναγνωριστικά συστατικών και τα ονόματά τους· και αναζητήστε οποιοδήποτε χημικό συστατικό (προσδέτη) με κωδικό για τον τύπο, το βάρος, το SMILES και το InChIKey. Ιδανικό για εργαλεία δομικής βιολογίας και ανακάλυψης φαρμάκων, μοριακούς θεατές, βιοπληροφορικές αγωγούς, εκπαιδευτικές εφαρμογές και πίνακες ελέγχου έρευνας.
api.oanor.com/pdb-api
EMDB API
Η Τράπεζα Δεδομένων Ηλεκτρονικής Μικροσκοπίας (EMDB) ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — το δημόσιο αρχείο τρισδιάστατων χαρτών πυκνότητας ηλεκτρονικής μικροσκοπίας πρωτεϊνών, νουκλεϊκών οξέων και μεγάλων μακρομοριακών συμπλόκων. Το EMDB είναι το αντίστοιχο της Τράπεζας Δεδομένων Πρωτεϊνών για την ηλεκτρονική μικροσκοπία, περιέχοντας χάρτες που επιλύθηκαν με κρυο-ΗΜ μονοσωματιδίου, ηλεκτρονική τομογραφία και ηλεκτρονική κρυσταλλογραφία, την τεχνική πίσω από την πρόσφατη «επανάσταση ανάλυσης» στη δομική βιολογία. Το /v1/search?q=ribosome αναζητά στο αρχείο και επιστρέφει για κάθε αντίστοιχη εγγραφή το αναγνωριστικό EMDB (π.χ. EMD-1010), τον τίτλο, τη μέθοδο ηλεκτρονικής μικροσκοπίας και την ανάλυση σε ångström. Το /v1/entry?id=EMD-1010 επιστρέφει τα μεταδεδομένα μιας εγγραφής — τον τίτλο της, τη μέθοδο ΗΜ (μονοσωματίδιο, τομογραφία, …), την κατάσταση συσσωμάτωσης, την ανάλυση, το βιολογικό δείγμα που μελετήθηκε, λέξεις-κλειδιά ταξινόμησης, τις ημερομηνίες κατάθεσης, απελευθέρωσης χάρτη και τελευταίας ενημέρωσης, και τους συγγραφείς κατάθεσης. Τα αναγνωριστικά EMDB μοιάζουν με EMD-1010, και μπορείτε να περάσετε μόνο τον αριθμό. Ιδανικό για εργαλεία δομικής βιολογίας και κρυο-ΗΜ, εφαρμογές σύγκρισης δομών και οπτικοποίησης, και εκπαίδευση. Δεδομένα από το EMBL-EBI EMDB (δημόσιος τομέας). Αυτό είναι το αρχείο πειραματικών ΧΑΡΤΩΝ ηλεκτρονικής μικροσκοπίας — διακριτό από δομές ατομικών συντεταγμένων (PDB), προβλεπόμενες δομές (AlphaFold) και βάσεις δεδομένων αλληλουχιών πρωτεϊνών (UniProt).
api.oanor.com/emdb-api
Complex Portal API
Το Complex Portal ως API, υποστηριζόμενο από το EMBL-EBI — μια χειροκίνητα επιμελημένη, εγκυκλοπαιδική βάση δεδομένων σταθερών μακρομοριακών συμπλόκων: συναρμολογήσεις δύο ή περισσότερων πρωτεϊνών (και μερικές φορές νουκλεϊκών οξέων, προσδεμάτων ή μικρών μορίων) που λειτουργούν μαζί ως μια ενιαία λειτουργική μονάδα, όπως ριβοσώματα, πρωτεασώματα, RNA και DNA πολυμεράσες, το σωμάτιο ματίσματος, σύμπλοκα της αναπνευστικής αλυσίδας και χιλιάδες ακόμη σε πολλά είδη. Αναζητήστε τα σύμπλοκα με λέξη-κλειδί και προαιρετικά με οργανισμό, λαμβάνοντας για κάθε σύμπλοκο την πρόσβαση του Complex Portal (CPX-…), το όνομα, τον οργανισμό, την περιγραφή και αν είναι υπολογιστικά προβλεπόμενο· διαβάστε μια πλήρη επιμελημένη εγγραφή συμπλόκου, συμπεριλαμβανομένων των προτεινόμενων και συστηματικών ονομάτων, συνωνύμων, είδους, βιολογικής λειτουργίας, των συμμετεχόντων υπομονάδων με το αναγνωριστικό μορίου τους (για παράδειγμα μια πρόσβαση UniProt) και στοιχειομετρία, τυχόν σχετικούς προσδέτες και ασθένειες, τον τύπο απόδειξης και διασταυρούμενες αναφορές σε UniProt, Gene Ontology, Reactome, Wikidata και άλλα· και εξάγετε μόνο τη σύνθεση υπομονάδων ενός συμπλόκου. Ιδανικό για δομική και συστημική βιολογία, ανάλυση μονοπατιών και δικτύων, έρευνα λειτουργίας πρωτεϊνών και βιοπληροφορικές αγωγούς. Οι προσβάσεις συμπλόκων μοιάζουν με CPX-6036. Δεδομένα από το EMBL-EBI Complex Portal (IMEx consortium, CC-BY). Για δίκτυα αλληλεπίδρασης πρωτεϊνών-πρωτεϊνών δείτε το STRING API, για αλληλουχίες πρωτεϊνών το UniProt, για βιολογικά μονοπάτια το Reactome και για οικογένειες & τομείς το InterPro.
api.oanor.com/complexes-api
API Συναρμολογήσεων Γονιδιώματος
Συναρμολογήσεις γονιδιώματος αναφοράς ως API — με τη δύναμη του NCBI Assembly, του καταλόγου γονιδιωματικών κατασκευών για οργανισμούς σε όλο το δέντρο της ζωής. Αναζητήστε συναρμολογήσεις ανά οργανισμό (ή ελεύθερο κείμενο) και δείτε τα μεταδεδομένα οποιασδήποτε συναρμολόγησης: την πρόσβασή της (GCF_… RefSeq ή GCA_… GenBank), το όνομα (π.χ. GRCh38.p14), τον οργανισμό και το αναγνωριστικό taxon, το επίπεδο συναρμολόγησης (πλήρες γονιδίωμα, χρωμόσωμα, σκαλωσιά ή contig), στατιστικά συνέχειας (N50 contig και scaffold), κάλυψη αλληλούχισης, κατηγορία RefSeq, ονόματα UCSC και Ensembl, τον οργανισμό υποβολής, ημερομηνία κυκλοφορίας και διαδρομές λήψης FTP. Από το ανθρώπινο γονιδίωμα αναφοράς έως οποιονδήποτε αλληλουχημένο μικροοργανισμό, φυτό ή ζώο, μετατρέπει τον κατάλογο συναρμολογήσεων γονιδιώματος σε ένα καθαρό API αναζήτησης και λήψης. Ένας κατάλογος συναρμολογήσεων γονιδιώματος — διακριτός από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), γονιδιωματικής σχολιασμού (Ensembl), παραλλαγών (ClinVar, dbVar) και γονιδιακής έκφρασης (GEO). Ανοικτά δεδομένα από το NCBI Assembly (δημόσιος τομέας).
api.oanor.com/genomes-api
Συχνές ερωτήσεις
Γρήγορες απαντήσεις για τιμές, ποσοστώσεις και ενσωμάτωση.
Πώς αποκτώ ένα κλειδί API για το API AlphaFold;
Ποιο είναι το όριο ρυθμού του API AlphaFold;
Πόσο κοστίζει το API AlphaFold;
Μπορώ να ακυρώσω τη συνδρομή μου ανά πάσα στιγμή;
Είναι το API AlphaFold συμβατό με τον GDPR;
Επιλέξτε ένα τελικό σημείο από τη λίστα στα αριστερά για να δείτε τις λεπτομέρειες και δοκιμάστε το.
Αποσπάσματα κώδικα
Εγγραφείτε για να λάβετε ένα API key και, στη συνέχεια, καλέστε οποιαδήποτε διαδρομή κάτω από το slug σας.
curl https://api.oanor.com/alphafold-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/alphafold-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/alphafold-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/alphafold-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())
Αξιολογήσεις
Συνδεθείτε για να βαθμολογήσετε.
Δεν υπάρχουν ακόμη κριτικές.
Συζήτηση
Κάνε ερωτήσεις, μοιράσου συμβουλές, πάρε απαντήσεις από τον πάροχο και άλλους προγραμματιστές. Δημόσιο — όλοι μπορούν να διαβάσουν.
Συνδέσου για να γράψεις ή να απαντήσεις.
ΣύνδεσηΝέα συζήτηση
·
-
Απάντηση παρόχου
🔒 Η συζήτηση είναι κλειδωμένη — δεν επιτρέπονται νέες απαντήσεις.
-
·
- Δεν υπάρχουν συζητήσεις — ξεκίνα την πρώτη.
Υποστήριξη
Ιδιωτική υποστήριξη 1:1 με τον πάροχο — χρέωση, ενσωμάτωση, λογαριασμός. Μόνο εσύ και η ομάδα του παρόχου βλέπετε αυτά τα threads.
Συνδέσου για να ανοίξεις ticket υποστήριξης.
ΣύνδεσηΆνοιγμα νέου ticket
Περιέγραψε με τι χρειάζεσαι βοήθεια. Η ομάδα λαμβάνει email και απαντά στη σελίδα του ticket.
-
·
Επείγουσα - Δεν υπάρχουν tickets για αυτό το API.