Browse available ontologies
API · /ols-api
OLS Ontologie API
De EMBL-EBI Ontology Lookup Service (OLS) als een API — een enkel toegangspunt tot meer dan 280 biomedische en wetenschappelijke ontologieën en gecontroleerde vocabularia op één plek: de Gene Ontology (GO), de Human Disease Ontology (DOID), de Human Phenotype Ontology (HP), ChEBI (chemische entiteiten), Uberon (anatomie), de Experimental Factor Ontology (EFO), Mondo, NCIt en vele andere. /v1/search?q=diabetes doorzoekt termen in alle ontologieën (of beperk tot één met ontology=doid), en retourneert voor elke overeenkomst het label, OBO-id (zoals DOID:9351 of GO:0008150), ontologie, IRI en een korte definitie. /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 retourneert de details van één term — het label, de definitie, IRI, synoniemen en of deze verouderd is. /v1/ontologies bladert door de beschikbare ontologieën met hun id, titel, beschrijving en aantal termen. OBO-id's zien eruit als DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 of CHEBI:15377. Ideaal voor biomedische natuurlijke-taalverwerking, gegevensannotatie en -harmonisatie, automatisch aanvullen van wetenschappelijke terminologie, en semantische en kennisgraaf-tooling. Gegevens van EMBL-EBI OLS (open). Dit is een algemene ontologie / gecontroleerd-vocabularium-opzoeking die vele domeinen bestrijkt — breder dan een enkele medische thesaurus zoals MeSH.
API-gezondheid
gezond- Uptime
- 100.00%
- Serversondes · 24 uur
- Gem. latentie
- 974 ms
- Serversondes · 24 uur
- Abonnees
- 3,774
- actief
- Totaal aantal oproepen
- 8
- laatste 7 dagen
Prijzen
Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.
Free
Vrij
- 2,700 oproepen / maand
- 2 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 2700 oproepen/maand
- 2 verzoeken/sec
- Zoeken, term- & ontologieopzoekingen
- Geen creditcard
Starter
€6.50 /maand
- 52,000 oproepen / maand
- 5 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 52k oproepen/maand
- 5 verzoeken/sec
- 280+ ontologieën
- E-mailondersteuning
Pro
€21.50 /maand
- 222,000 oproepen / maand
- 12 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 222k oproepen/maand
- 12 verzoeken/sec
- Annotatie & NLP
- Prioritaire ondersteuning
Mega
€59.00 /maand
- 800,000 oproepen / maand
- 35 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 800k oproepen/maand
- 35 req/sec
- Harmonisatie met hoge doorvoer
- Toegewijde SLA
Gebouwd door
Gerelateerd APIs
Andere APIs met overlappende tags.
MeSH API
Medical Subject Headings (MeSH) als API, aangedreven door de officiële MeSH RDF-service van de U.S. National Library of Medicine. MeSH is de gezaghebbende gecontroleerde woordenschat van de NLM die wordt gebruikt om de biomedische literatuur in PubMed te indexeren — een samengestelde thesaurus van ziekten, anatomie, chemicaliën en geneesmiddelen, organismen, psychiatrie en psychologie, analytische en diagnostische technieken, gezondheidszorg en meer. Elk concept is een "descriptor" met een stabiele unieke id (bijv. D003920), een voorkeursnaam, een reeks ingangstermen (synoniemen en lekenvarianten) en een lijst met toegestane kwalificaties (subkoppen zoals medicamenteuze therapie, diagnose of epidemiologie). /v1/search?q=diabetes doorzoekt descriptoren op hun voorkeursnaam (match=contains, exact of startswith) en retourneert de id en het label van elke descriptor. /v1/term?q=heart attack lost een lekenterm of synoniem op naar de MeSH-descriptor(s) waartoe het behoort, zodat alledaagse taal wordt gekoppeld aan de gecontroleerde woordenschat (heart attack naar Myocardial Infarction). /v1/descriptor?id=D003920 retourneert het volledige record van een descriptor — de voorkeursnaam, alle ingangstermen (synoniemen), de toegestane kwalificaties en zie-ook kruisverwijzingen, met een link naar de MeSH-browser. Ideaal voor biomedische natuurlijke-taalverwerking en tekstmining, taggen en indexeren van literatuur, bouwen van klinische en onderzoekszoekhulpmiddelen, automatisch aanvullen van medische terminologie en het koppelen van vrije tekst aan een standaardontologie. Gegevens van NLM MeSH (publiek domein). Voor geneesmiddelspecifieke klinische nomenclatuur en interacties, zie de RxNorm API.
api.oanor.com/mesh-api
Ontology API
Biomedische ontologieën als API, aangedreven door de EBI Ontology Lookup Service (OLS). Doorzoek meer dan 280+ samengestelde ontologieën — ziekten (MONDO), menselijke fenotypes (HP), de Gene Ontology (GO), anatomie (UBERON), celtypen (CL), chemie (ChEBI), experimentele factoren (EFO), de NCI Thesaurus en vele andere — om termen te vinden op naam; blader door de volledige ontologiecatalogus met versies en termaantallen; lees elke term voor de definitie, exacte synoniemen, OBO-id, IRI en verouderde status; en doorloop de klassehiërarchie via de directe ouders en kinderen van een term. Ideaal voor klinische data-harmonisatie en -codering, biomedisch zoeken en automatisch aanvullen, kennisgraafverrijking, annotatie- en curatiepijplijnen, en onderzoeks- en EPD-toepassingen die standaardvocabulaires nodig hebben. OBO-ids zien eruit als MONDO:0005148 of GO:0008150.
api.oanor.com/ontology-api
BioSamples API
BioSamples als API, aangedreven door EMBL-EBI — de database die de metadata van biologische monsters opslaat en koppelt, de fysieke specimens achter biologische experimenten. Een monster in BioSamples heeft een stabiele toegang (zoals SAMEA3231268) en een rijke set kenmerken — organisme, weefsel of orgaandeel, celtype, geslacht, ziekte, ontwikkelingsstadium, stam en alle door de indiener verstrekte attributen — en wordt gerefereerd door andere EBI-archieven, waaronder het European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress en PRIDE. /v1/search?q=liver doorzoekt monsters op vrije tekst en retourneert de toegang, naam, organisme en releasedatum van elke overeenkomst. /v1/sample?id=SAMEA3231268 retourneert de metadata van een monster — de toegang, naam, NCBI-taxon-id, organisme, release- en updatedatums, het aantal relaties met andere monsters, en de kenmerken afgevlakt tot een schone sleutel→waarde-kaart. Toegangen zien eruit als SAMEA…, SAMN… of SAMD…; haal er een uit het zoekendpoint. Ideaal voor levenswetenschappelijke data-integratie, monstertracking, metadata-harmonisatie en het koppelen van sequencing- of expressiegegevens terug naar het oorspronkelijke specimen. Gegevens van EMBL-EBI BioSamples (openbaar). Dit is een biologisch-monster-metadataregister — te onderscheiden van studie- (BioStudies), sequentie- (ENA), variant- (ClinVar) en structuurdatabases.
api.oanor.com/biosamples-api
BioStudies API
BioStudies als API, aangedreven door EMBL-EBI — de database die de beschrijvingen van biologische studies bevat en hun gegevens verbindt over EBI-bronnen heen, waaronder beeldvorming (BioImage Archive), functionele genomica (ArrayExpress), proteomics en de literatuur (Europe PMC). Elke studie heeft een accession, een titel en samenvatting, de collectie waartoe het behoort en links naar de onderliggende gegevens en publicaties. /v1/search?query=covid doorzoekt de studies en retourneert de accession (bijv. S-EPMC8017430), titel, auteur, studietype, releasedatum en link/bestandtellingen van elke overeenkomst. /v1/study?id=S-EPMC8017430 retourneert de metadata van een studie — de accession, de collectie waartoe het behoort (zoals EuropePMC, ArrayExpress of BioImages), titel, samenvatting, releasedatum, auteurs en het aantal gekoppelde bronnen. Accessions zien eruit als S-EPMC8017430 of S-BSST123; haal er een uit het zoekendpoint. Ideaal voor onderzoeksgegevensontdekking, het koppelen van literatuur aan de onderliggende datasets, systematische reviews en reproduceerbaarheidstools. Gegevens van EMBL-EBI BioStudies (openbaar). Dit is een index van studies en datasets metadata — verschillend van de sequentie- (UniProt, ENA), structuur- (PDB, EMDB), variant- (ClinVar) en ontologiedatabases.
api.oanor.com/biostudies-api
Veelgestelde vragen
Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.
Hoe krijg ik een API-sleutel voor OLS Ontologie API?
Wat is de rate-limit voor OLS Ontologie API?
Wat kost OLS Ontologie API?
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Voldoet OLS Ontologie API aan de AVG?
Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.
Codefragmenten
Meld u aan om een API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.
curl https://api.oanor.com/ols-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/ols-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/ols-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/ols-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())
Beoordelingen
Log in om te beoordelen.
Nog geen beoordelingen.
Discussie
Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.
Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.
InloggenNieuwe discussie
·
-
Antwoord van aanbieder
🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.
-
·
- Nog geen discussies — start de eerste.
Support
Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.
Meld je aan om een supportticket te openen.
InloggenNieuw ticket openen
Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.
-
·
Urgent - Nog geen tickets voor deze API.