API · /ols-api

OLS Ontologie API

gezond 3,774 Abonnees

De EMBL-EBI Ontology Lookup Service (OLS) als een API — een enkel toegangspunt tot meer dan 280 biomedische en wetenschappelijke ontologieën en gecontroleerde vocabularia op één plek: de Gene Ontology (GO), de Human Disease Ontology (DOID), de Human Phenotype Ontology (HP), ChEBI (chemische entiteiten), Uberon (anatomie), de Experimental Factor Ontology (EFO), Mondo, NCIt en vele andere. /v1/search?q=diabetes doorzoekt termen in alle ontologieën (of beperk tot één met ontology=doid), en retourneert voor elke overeenkomst het label, OBO-id (zoals DOID:9351 of GO:0008150), ontologie, IRI en een korte definitie. /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 retourneert de details van één term — het label, de definitie, IRI, synoniemen en of deze verouderd is. /v1/ontologies bladert door de beschikbare ontologieën met hun id, titel, beschrijving en aantal termen. OBO-id's zien eruit als DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 of CHEBI:15377. Ideaal voor biomedische natuurlijke-taalverwerking, gegevensannotatie en -harmonisatie, automatisch aanvullen van wetenschappelijke terminologie, en semantische en kennisgraaf-tooling. Gegevens van EMBL-EBI OLS (open). Dit is een algemene ontologie / gecontroleerd-vocabularium-opzoeking die vele domeinen bestrijkt — breder dan een enkele medische thesaurus zoals MeSH.

api.oanor.com/ols-api
Verkrijg een API-sleutel Probeer het in de speeltuin → Provider contacteren

Machineleesbare specificaties zodat AI-agenten deze API kunnen integreren.

/api/ols-api/openapi.json
/api/ols-api/llms.txt

Ontdekking: GET /api/index.json vermeldt elke API.

API-gezondheid

gezond
Uptime
100.00%
Serversondes · 24 uur
Gem. latentie
974 ms
Serversondes · 24 uur
Abonnees
3,774
actief
Totaal aantal oproepen
8
laatste 7 dagen
status Volledige statuspagina → · 12 sondes/24u

Prijzen

Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.

Free

Vrij

  • 2,700 oproepen / maand
  • 2 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 2700 oproepen/maand
  • 2 verzoeken/sec
  • Zoeken, term- & ontologieopzoekingen
  • Geen creditcard
Meld u aan om u te abonneren

Starter

€6.50 /maand

  • 52,000 oproepen / maand
  • 5 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 52k oproepen/maand
  • 5 verzoeken/sec
  • 280+ ontologieën
  • E-mailondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Pro

€21.50 /maand

  • 222,000 oproepen / maand
  • 12 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 222k oproepen/maand
  • 12 verzoeken/sec
  • Annotatie & NLP
  • Prioritaire ondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Mega

€59.00 /maand

  • 800,000 oproepen / maand
  • 35 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 800k oproepen/maand
  • 35 req/sec
  • Harmonisatie met hoge doorvoer
  • Toegewijde SLA
Meld u aan om u te abonneren

Gebouwd door

Gerelateerd APIs

Andere APIs met overlappende tags.

MeSH API

Medical Subject Headings (MeSH) als API, aangedreven door de officiële MeSH RDF-service van de U.S. National Library of Medicine. MeSH is de gezaghebbende gecontroleerde woordenschat van de NLM die wordt gebruikt om de biomedische literatuur in PubMed te indexeren — een samengestelde thesaurus van ziekten, anatomie, chemicaliën en geneesmiddelen, organismen, psychiatrie en psychologie, analytische en diagnostische technieken, gezondheidszorg en meer. Elk concept is een "descriptor" met een stabiele unieke id (bijv. D003920), een voorkeursnaam, een reeks ingangstermen (synoniemen en lekenvarianten) en een lijst met toegestane kwalificaties (subkoppen zoals medicamenteuze therapie, diagnose of epidemiologie). /v1/search?q=diabetes doorzoekt descriptoren op hun voorkeursnaam (match=contains, exact of startswith) en retourneert de id en het label van elke descriptor. /v1/term?q=heart attack lost een lekenterm of synoniem op naar de MeSH-descriptor(s) waartoe het behoort, zodat alledaagse taal wordt gekoppeld aan de gecontroleerde woordenschat (heart attack naar Myocardial Infarction). /v1/descriptor?id=D003920 retourneert het volledige record van een descriptor — de voorkeursnaam, alle ingangstermen (synoniemen), de toegestane kwalificaties en zie-ook kruisverwijzingen, met een link naar de MeSH-browser. Ideaal voor biomedische natuurlijke-taalverwerking en tekstmining, taggen en indexeren van literatuur, bouwen van klinische en onderzoekszoekhulpmiddelen, automatisch aanvullen van medische terminologie en het koppelen van vrije tekst aan een standaardontologie. Gegevens van NLM MeSH (publiek domein). Voor geneesmiddelspecifieke klinische nomenclatuur en interacties, zie de RxNorm API.

api.oanor.com/mesh-api

Ontology API

Biomedische ontologieën als API, aangedreven door de EBI Ontology Lookup Service (OLS). Doorzoek meer dan 280+ samengestelde ontologieën — ziekten (MONDO), menselijke fenotypes (HP), de Gene Ontology (GO), anatomie (UBERON), celtypen (CL), chemie (ChEBI), experimentele factoren (EFO), de NCI Thesaurus en vele andere — om termen te vinden op naam; blader door de volledige ontologiecatalogus met versies en termaantallen; lees elke term voor de definitie, exacte synoniemen, OBO-id, IRI en verouderde status; en doorloop de klassehiërarchie via de directe ouders en kinderen van een term. Ideaal voor klinische data-harmonisatie en -codering, biomedisch zoeken en automatisch aanvullen, kennisgraafverrijking, annotatie- en curatiepijplijnen, en onderzoeks- en EPD-toepassingen die standaardvocabulaires nodig hebben. OBO-ids zien eruit als MONDO:0005148 of GO:0008150.

api.oanor.com/ontology-api

BioSamples API

BioSamples als API, aangedreven door EMBL-EBI — de database die de metadata van biologische monsters opslaat en koppelt, de fysieke specimens achter biologische experimenten. Een monster in BioSamples heeft een stabiele toegang (zoals SAMEA3231268) en een rijke set kenmerken — organisme, weefsel of orgaandeel, celtype, geslacht, ziekte, ontwikkelingsstadium, stam en alle door de indiener verstrekte attributen — en wordt gerefereerd door andere EBI-archieven, waaronder het European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress en PRIDE. /v1/search?q=liver doorzoekt monsters op vrije tekst en retourneert de toegang, naam, organisme en releasedatum van elke overeenkomst. /v1/sample?id=SAMEA3231268 retourneert de metadata van een monster — de toegang, naam, NCBI-taxon-id, organisme, release- en updatedatums, het aantal relaties met andere monsters, en de kenmerken afgevlakt tot een schone sleutel→waarde-kaart. Toegangen zien eruit als SAMEA…, SAMN… of SAMD…; haal er een uit het zoekendpoint. Ideaal voor levenswetenschappelijke data-integratie, monstertracking, metadata-harmonisatie en het koppelen van sequencing- of expressiegegevens terug naar het oorspronkelijke specimen. Gegevens van EMBL-EBI BioSamples (openbaar). Dit is een biologisch-monster-metadataregister — te onderscheiden van studie- (BioStudies), sequentie- (ENA), variant- (ClinVar) en structuurdatabases.

api.oanor.com/biosamples-api

BioStudies API

BioStudies als API, aangedreven door EMBL-EBI — de database die de beschrijvingen van biologische studies bevat en hun gegevens verbindt over EBI-bronnen heen, waaronder beeldvorming (BioImage Archive), functionele genomica (ArrayExpress), proteomics en de literatuur (Europe PMC). Elke studie heeft een accession, een titel en samenvatting, de collectie waartoe het behoort en links naar de onderliggende gegevens en publicaties. /v1/search?query=covid doorzoekt de studies en retourneert de accession (bijv. S-EPMC8017430), titel, auteur, studietype, releasedatum en link/bestandtellingen van elke overeenkomst. /v1/study?id=S-EPMC8017430 retourneert de metadata van een studie — de accession, de collectie waartoe het behoort (zoals EuropePMC, ArrayExpress of BioImages), titel, samenvatting, releasedatum, auteurs en het aantal gekoppelde bronnen. Accessions zien eruit als S-EPMC8017430 of S-BSST123; haal er een uit het zoekendpoint. Ideaal voor onderzoeksgegevensontdekking, het koppelen van literatuur aan de onderliggende datasets, systematische reviews en reproduceerbaarheidstools. Gegevens van EMBL-EBI BioStudies (openbaar). Dit is een index van studies en datasets metadata — verschillend van de sequentie- (UniProt, ENA), structuur- (PDB, EMDB), variant- (ClinVar) en ontologiedatabases.

api.oanor.com/biostudies-api

Veelgestelde vragen

Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.

Hoe krijg ik een API-sleutel voor OLS Ontologie API?
Registreer gratis op oanor.com, genereer een API-sleutel in het ontwikkelaarsdashboard en roep OLS Ontologie API aan met de x-oanor-key-header. Geen creditcard nodig voor het gratis abonnement.
Wat is de rate-limit voor OLS Ontologie API?
Het gratis pakket staat 1 verzoek per seconde toe. Betaalde pakketten schalen tot 50 verzoeken per seconde op het Mega-niveau. Harde limieten geven HTTP 429 boven de quota — geen verrassende meerkosten.
Wat kost OLS Ontologie API?
OLS Ontologie API heeft een gratis pakket met 100 calls / maand. Betaalde pakketten beginnen bij €6.50 / maand met hogere quota's en snellere rate-limits.
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Ja. Abonnementen worden maandelijks gefactureerd en je kunt op elk moment opzeggen via je facturatie-dashboard. Geen langetermijncontracten en geen opzegkosten.
Voldoet OLS Ontologie API aan de AVG?
Alle aanvragen aan OLS Ontologie API lopen via onze EU-gateway. Je upstream-API-sleutel verlaat nooit onze server en er worden geen persoonsgegevens gedeeld met de upstream-leverancier behalve de aanvraag zelf.

Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.

Codefragmenten

Meld u aan om een ​​API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.

curl https://api.oanor.com/ols-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/ols-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/ols-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/ols-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Beoordelingen

Log in om te beoordelen.

Nog geen beoordelingen.

Discussie

Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.

Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.

Inloggen

Nieuwe discussie

/ 4000

📌 Vastgepind 🔒 Vergrendeld

·

· ·

/ 4000

🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.

  • Nog geen discussies — start de eerste.

Support

Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.

Meld je aan om een supportticket te openen.

Inloggen

Nieuw ticket openen

Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.

  • Nog geen tickets voor deze API.

Abonnement actief: calls kunnen direct starten.

Verstuur uw eerste aanvraag —

Abonnement actief: kopieer een fragment en start uw eerste oproep.