#ontology

El Servicio de Búsqueda de Ontologías (OLS) de EMBL-EBI como una API — un punto de acceso único a más de 280 ontologías biomédicas y científicas y vocabularios controlados en un solo lugar: la Ontología Génica (GO), la Ontología de Enfermedades Humanas (DOID), la Ontología del Fenotipo Humano (HP), ChEBI (entidades químicas), Uberon (anatomía), la Ontología de Factores Experimentales (EFO), Mondo, NCIt y muchos más. /v1/search?q=diabetes busca términos en todas las ontologías (o restringe a una con ontology=doid), devolviendo la etiqueta de cada coincidencia, el id OBO (como DOID:9351 o GO:0008150), la ontología, el IRI y una definición breve. /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 devuelve el detalle de un solo término: su etiqueta, definición, IRI, sinónimos y si está obsoleto. /v1/ontologies navega por las ontologías disponibles con su id, título, descripción y número de términos. Los ids OBO se ven como DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 o CHEBI:15377. Ideal para procesamiento de lenguaje natural biomédico, anotación y armonización de datos, autocompletado sobre terminología científica, y herramientas semánticas y de grafos de conocimiento. Datos de EMBL-EBI OLS (abierto). Esta es una búsqueda general de ontologías/vocabularios controlados que abarca muchos dominios — más amplia que un solo tesauro médico como MeSH.

api.oanor.com/ols-api

Encabezados de Materias Médicas (MeSH) como una API, impulsada por el servicio oficial de MeSH RDF de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU. MeSH es el vocabulario controlado autorizado de la NLM utilizado para indexar la literatura biomédica en PubMed: un tesauro curado de enfermedades, anatomía, productos químicos y fármacos, organismos, psiquiatría y psicología, técnicas analíticas y de diagnóstico, atención médica y más. Cada concepto es un "descriptor" con un identificador único estable (por ejemplo, D003920), un nombre preferido, un conjunto de términos de entrada (sinónimos y variantes legas) y una lista de calificadores permitidos (subencabezados como farmacoterapia, diagnóstico o epidemiología). /v1/search?q=diabetes busca descriptores por su nombre preferido (coincidencia=contiene, exacta o comienza con) y devuelve el id y la etiqueta de cada descriptor. /v1/term?q=heart attack resuelve un término lego o sinónimo al descriptor de MeSH al que pertenece, por lo que el lenguaje coloquial se asigna al vocabulario controlado (heart attack a Myocardial Infarction). /v1/descriptor?id=D003920 devuelve el registro completo de un descriptor: su nombre preferido, todos los términos de entrada (sinónimos), los calificadores permitidos y referencias cruzadas de ver también, con un enlace al navegador de MeSH. Ideal para el procesamiento de lenguaje natural biomédico y la minería de textos, etiquetado e indexación de literatura, construcción de herramientas de búsqueda clínica y de investigación, autocompletado sobre terminología médica y mapeo de texto libre a una ontología estándar. Datos de NLM MeSH (dominio público). Para nomenclatura clínica e interacciones específicas de fármacos, consulte la API de RxNorm.

api.oanor.com/mesh-api

Ontologías biomédicas como API, impulsadas por el Servicio de Búsqueda de Ontologías del EBI (OLS). Busque en más de 280 ontologías curadas — enfermedades (MONDO), fenotipos humanos (HP), la Ontología Génica (GO), anatomía (UBERON), tipos celulares (CL), química (ChEBI), factores experimentales (EFO), el Tesauro del NCI y muchas más — para encontrar términos por nombre; explore el catálogo completo de ontologías con versiones y recuentos de términos; lea cualquier término para obtener su definición, sinónimos exactos, id OBO, IRI y estado de obsoleto; y recorra la jerarquía de clases a través de los padres e hijos directos de un término. Ideal para armonización y codificación de datos clínicos, búsqueda biomédica y autocompletado, enriquecimiento de grafos de conocimiento, anotación y curaduría, y aplicaciones de investigación y EHR que necesiten vocabularios estándar. Los ids OBO se ven como MONDO:0005148 o GO:0008150.

api.oanor.com/ontology-api