oanor
Δωρεάν εγγραφή
Αγορά Τιμές Λειτουργίες Σύνδεση

API · /ucsc-api

API Γονιδιώματος UCSC

υγιής 3,196 Συνδρομητές

Το UCSC Genome Browser ως API — δεδομένα γονιδιώματος αναφοράς για εκατοντάδες είδη, από το διάσημο UCSC Genome Browser στο UC Santa Cruz. Το /v1/genomes παραθέτει τις 220+ συναρμολογήσεις γονιδιώματος που φιλοξενεί το UCSC, καθεμία με το αναγνωριστικό συναρμολόγησης (όπως hg38 για άνθρωπο, mm39 για ποντίκι, danRer11 για ψάρι ζέβρα), οργανισμό, περιγραφή και πηγή δεδομένων. Το /v1/chromosomes?genome=hg38 επιστρέφει τα χρωμοσώματα και τις αλληλουχίες μιας συναρμολόγησης με τα μεγέθη τους σε ζεύγη βάσεων, από το μεγαλύτερο στο μικρότερο. Το /v1/sequence?genome=hg38&chrom=chrM&start=0&end=100 ανακτά την ακατέργαστη αλληλουχία DNA οποιασδήποτε γονιδιωματικής περιοχής (έναρξη βάσει 0, ημι-ανοιχτό τέλος· οι περιοχές περιορίζονται σε 100.000 βάσεις ανά κλήση). Τα αναγνωριστικά συναρμολόγησης προέρχονται από το /v1/genomes και τα ονόματα χρωμοσωμάτων μοιάζουν με chr1, chrX ή chrM. Ιδανικό για βιοπληροφορικές αγωγούς, εργαλεία οπτικοποίησης γονιδιώματος και σχεδιασμού εκκινητών, αναζητήσεις περιοχών και αλληλουχιών, συγκριτική γονιδιωματική και διδασκαλία. Δεδομένα από το UCSC Genome Browser (δωρεάν για ακαδημαϊκή, μη κερδοσκοπική και προσωπική χρήση). Πρόκειται για τις συναρμολογήσεις και την ακατέργαστη αλληλουχία αναφοράς του προγράμματος περιήγησης γονιδιώματος — διακριτό από βάσεις δεδομένων γονιδιακής σήμανσης και πρωτεϊνικής αλληλουχίας όπως Ensembl, UniProt και ENA.

#ucsc #genome #genomics #dna-sequence #assemblies #bioinformatics #reference-genome
api.oanor.com/ucsc-api
Λάβετε ένα κλειδί API Δοκιμάστε στην παιδική χαρά → Επικοινωνήστε με τον πάροχο

Προδιαγραφές αναγνώσιμες από μηχανή, ώστε οι πράκτορες AI να μπορούν να ενσωματώσουν αυτό το API.

/api/ucsc-api/openapi.json
/api/ucsc-api/llms.txt

Ανακάλυψη: Το GET /api/index.json παραθέτει κάθε API.

Υγεία API

υγιής
Χρόνος λειτουργίας
100.00%
Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
Μέση καθυστέρηση
1062 ms
Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
Συνδρομητές
3,196
ενεργός
Σύνολο κλήσεων
8
τις τελευταίες 7 ημέρες
status Πλήρης σελίδα κατάστασης → · 12 ανιχνευτές/24 ώρες

Τιμολόγηση

Επιλέξτε μια βαθμίδα — χρεώνεται μηνιαία, ακυρώστε ανά πάσα στιγμή.

Free

Δωρεάν

  • 2,300 κλήσεις / μήνα
  • 2 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 2300 κλήσεις/μήνα
  • 2 αιτήματα/δευτερόλεπτο
  • Γονιδιώματα, χρωμοσώματα & αλληλουχία
  • Χωρίς πιστωτική κάρτα
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Starter

€7.50 /μήνας

  • 49,000 κλήσεις / μήνα
  • 5 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 49k κλήσεις/μήνα
  • 5 αιτήσεις/δευτερόλεπτο
  • Ανάκτηση αλληλουχίας DNA
  • Υποστήριξη μέσω email
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Pro

€23.00 /μήνας

  • 220,000 κλήσεις / μήνα
  • 12 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 220k κλήσεις/μήνα
  • 12 req/sec
  • Βιοπληροφορικές αγωγές
  • Υποστήριξη προτεραιότητας
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Mega

€63.00 /μήνας

  • 790,000 κλήσεις / μήνα
  • 35 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 790k κλήσεις/μήνα
  • 35 req/sec
  • Γονιδιωματική υψηλής απόδοσης
  • Αφιερωμένο SLA
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Κατασκευάστηκε από

P
PremiumApi

Σχετικό API

Άλλο API με επικαλυπτόμενες ετικέτες.

API Συναρμολογήσεων Γονιδιώματος

Συναρμολογήσεις γονιδιώματος αναφοράς ως API — με τη δύναμη του NCBI Assembly, του καταλόγου γονιδιωματικών κατασκευών για οργανισμούς σε όλο το δέντρο της ζωής. Αναζητήστε συναρμολογήσεις ανά οργανισμό (ή ελεύθερο κείμενο) και δείτε τα μεταδεδομένα οποιασδήποτε συναρμολόγησης: την πρόσβασή της (GCF_… RefSeq ή GCA_… GenBank), το όνομα (π.χ. GRCh38.p14), τον οργανισμό και το αναγνωριστικό taxon, το επίπεδο συναρμολόγησης (πλήρες γονιδίωμα, χρωμόσωμα, σκαλωσιά ή contig), στατιστικά συνέχειας (N50 contig και scaffold), κάλυψη αλληλούχισης, κατηγορία RefSeq, ονόματα UCSC και Ensembl, τον οργανισμό υποβολής, ημερομηνία κυκλοφορίας και διαδρομές λήψης FTP. Από το ανθρώπινο γονιδίωμα αναφοράς έως οποιονδήποτε αλληλουχημένο μικροοργανισμό, φυτό ή ζώο, μετατρέπει τον κατάλογο συναρμολογήσεων γονιδιώματος σε ένα καθαρό API αναζήτησης και λήψης. Ένας κατάλογος συναρμολογήσεων γονιδιώματος — διακριτός από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), γονιδιωματικής σχολιασμού (Ensembl), παραλλαγών (ClinVar, dbVar) και γονιδιακής έκφρασης (GEO). Ανοικτά δεδομένα από το NCBI Assembly (δημόσιος τομέας).

api.oanor.com/genomes-api

API Γονιδιακής Έκφρασης

Πειράματα λειτουργικής γονιδιωματικής ως API — υποστηρίζεται από το NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), το μεγαλύτερο δημόσιο αποθετήριο δεδομένων γονιδιακής έκφρασης. Το GEO αρχειοθετεί σειρές έκφρασης και επιμελημένα σύνολα δεδομένων από πειράματα μικροσυστοιχιών και αλληλούχησης υψηλής απόδοσης σε κάθε οργανισμό. Αναζητήστε πειράματα με λέξη-κλειδί και προαιρετικά με οργανισμό, και αναζητήστε οποιαδήποτε σειρά ή σύνολο δεδομένων για να λάβετε τα μεταδεδομένα του: τίτλο, περίληψη, τύπο ανάλυσης (προφίλ έκφρασης με μικροσυστοιχία ή με αλληλούχηση), οργανισμό, αριθμό δειγμάτων, πλατφόρμα και τη δημοσίευση που το υποστηρίζει. Από μελέτες στρες β-κυττάρων έως μεταγραφομική καρκίνου σε άνθρωπο και ποντίκι, μετατρέπει το αρχείο GEO σε ένα απλό API αναζήτησης και ανάκτησης για μεταγραφομική, βιοπληροφορική και ανακάλυψη ερευνητικών δεδομένων. Ένα αποθετήριο συνόλων δεδομένων γονιδιακής έκφρασης / λειτουργικής γονιδιωματικής — διακριτό από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (ENA), παραλλαγών (ClinVar, dbVar), δομής (PDB) και οντολογιών. Ανοικτά δεδομένα από το NCBI GEO (δημόσιος τομέας).

api.oanor.com/geodatasets-api

API Δομικών Παραλλαγών

Ανθρώπινη γονιδιωματική δομική παραλλαγή ως API — υποστηρίζεται από το NCBI dbVar, το αρχείο δομικών παραλλαγών (SVs): παραλλαγές αριθμού αντιγράφων (CNVs), μεγάλες διαγραφές, διπλασιασμοί, ενθέσεις, αναστροφές και μετατοπίσεις, συνήθως μεγαλύτερες από 50 ζεύγη βάσεων. Αυτό είναι το δομικό αντίστοιχο των βάσεων δεδομένων παραλλαγών μονού νουκλεοτιδίου: αναζητήστε δομικές παραλλαγές που επικαλύπτουν ένα γονίδιο (ή με ελεύθερο κείμενο) και λάβετε την πρόσβαση dbVar κάθε παραλλαγής, τη μελέτη από την οποία προήλθε, τον τύπο της, τα γονίδια που επικαλύπτει, τη γονιδιωματική της θέση στο GRCh38 και την κλινική της σημασία· στη συνέχεια, αναζητήστε οποιαδήποτε παραλλαγή για το πλήρες αρχείο — θέσεις και στα δύο συναρμολογήματα GRCh37 και GRCh38, τύπο παραλλαγής, γονίδια, κλινική σημασία, τύπο μελέτης, μεθόδους και αριθμούς παραλλαγών. Από CNVs BRCA1 έως διαγραφές Cri-du-chat, είναι ιδανικό για εργασίες γονιδιωματικής, κυτταρογενετικής, σπάνιων ασθενειών και βιοπληροφορικής. Ένας πόρος δομικής παραλλαγής / CNV — διακριτός από την ερμηνεία κλινικών παραλλαγών μονού νουκλεοτιδίου (ClinVar), τις συχνότητες αλληλόμορφων πληθυσμού (gnomAD) και τις συσχετίσεις χαρακτηριστικών (GWAS). Ανοικτά δεδομένα από το NCBI dbVar (δημόσιος τομέας).

api.oanor.com/dbvar-api

API Αλληλεπιδράσεων Πρωτεϊνών

Δίκτυα αλληλεπιδράσεων πρωτεΐνης-πρωτεΐνης ως API — υποστηρίζεται από το STRING, τη βάση δεδομένων γνωστών και προβλεπόμενων συσχετίσεων πρωτεϊνών που συνδυάζει στοιχεία από εργαστηριακά πειράματα, επιμελημένες βάσεις δεδομένων μονοπατιών, γονιδιακή συνεκφραση, γονιδιωματικό πλαίσιο και αυτοματοποιημένη εξόρυξη κειμένου σε μια ενιαία βαθμολογία εμπιστοσύνης, σε χιλιάδες οργανισμούς. Λάβετε τους κορυφαίους συνεργάτες αλληλεπίδρασης μιας πρωτεΐνης (καθένας με τη συνδυασμένη βαθμολογία εμπιστοσύνης και τις επτά υποβαθμολογίες καναλιών απόδειξης), το δίκτυο αλληλεπίδρασης μεταξύ οποιουδήποτε συνόλου πρωτεϊνών ως βαθμολογημένες ακμές και λειτουργικό εμπλουτισμό για ένα σύνολο γονιδίων — τους υπερ-αντιπροσωπευόμενους όρους GO, μονοπάτια KEGG, τομείς Pfam και άλλα, το καθένα με την p-τιμή, το FDR και τα μέλη γονίδιά του. Περάστε σύμβολα γονιδίων (TP53) ή αναγνωριστικά STRING/Ensembl, για άνθρωπο (προεπιλογή) ή οποιοδήποτε είδος με αναγνωριστικό ταξινομίας NCBI. Είναι ακρογωνιαίος λίθος της συστημικής βιολογίας — ιδανικό για ανάλυση δικτύων, λειτουργική γονιδιωματική, μονοπάτια και εργαλεία βιοπληροφορικής. Ένας πόρος δικτύου αλληλεπίδρασης πρωτεϊνών — διακριτός από βιολογικά μονοπάτια (Reactome), επιμελημένα σύμπλοκα πρωτεϊνών (Complex Portal) και σχολιασμούς Γονιδιακής Οντολογίας (QuickGO). Ανοιχτά δεδομένα από το STRING (CC BY 4.0).

api.oanor.com/stringdb-api

Συχνές ερωτήσεις

Γρήγορες απαντήσεις για τιμές, ποσοστώσεις και ενσωμάτωση.

Πώς αποκτώ ένα κλειδί API για το API Γονιδιώματος UCSC;
Εγγράψου δωρεάν στο oanor.com, δημιούργησε ένα κλειδί API από τον πίνακα ελέγχου προγραμματιστή και κάλεσε το API Γονιδιώματος UCSC με την κεφαλίδα x-oanor-key. Δεν απαιτείται πιστωτική κάρτα για το δωρεάν πλάνο.
Ποιο είναι το όριο ρυθμού του API Γονιδιώματος UCSC;
Το δωρεάν πλάνο επιτρέπει 1 αίτημα ανά δευτερόλεπτο. Τα επί πληρωμή πλάνα κλιμακώνονται έως 50 αιτήματα ανά δευτερόλεπτο στο επίπεδο Mega. Τα αυστηρά όρια επιστρέφουν HTTP 429 πάνω από την ποσόστωση — χωρίς εκπλήξεις στις χρεώσεις υπερβάσεων.
Πόσο κοστίζει το API Γονιδιώματος UCSC;
Το API Γονιδιώματος UCSC έχει δωρεάν πλάνο με 100 κλήσεις / μήνα. Τα επί πληρωμή πλάνα ξεκινούν από €7.50 / μήνα με υψηλότερες ποσοστώσεις και ταχύτερα όρια ρυθμού.
Μπορώ να ακυρώσω τη συνδρομή μου ανά πάσα στιγμή;
Ναι. Τα πλάνα χρεώνονται μηνιαίως και μπορείς να ακυρώσεις οποτεδήποτε από το ταμπλό χρέωσης. Χωρίς μακροπρόθεσμα συμβόλαια και χωρίς τέλος ακύρωσης.
Είναι το API Γονιδιώματος UCSC συμβατό με τον GDPR;
Όλα τα αιτήματα προς API Γονιδιώματος UCSC περνούν μέσω της πύλης μας στην ΕΕ. Το upstream API κλειδί σου δεν φεύγει ποτέ από τον διακομιστή μας και δεν μοιράζονται προσωπικά δεδομένα με τον upstream πάροχο πέρα από το αίτημα που στέλνεις.

Επιλέξτε ένα τελικό σημείο από τη λίστα στα αριστερά για να δείτε τις λεπτομέρειες και δοκιμάστε το.

Αποσπάσματα κώδικα

Εγγραφείτε για να λάβετε ένα API key και, στη συνέχεια, καλέστε οποιαδήποτε διαδρομή κάτω από το slug σας.

curl https://api.oanor.com/ucsc-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/ucsc-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/ucsc-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/ucsc-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Αξιολογήσεις

Συνδεθείτε για να βαθμολογήσετε.

Δεν υπάρχουν ακόμη κριτικές.

Συζήτηση

Κάνε ερωτήσεις, μοιράσου συμβουλές, πάρε απαντήσεις από τον πάροχο και άλλους προγραμματιστές. Δημόσιο — όλοι μπορούν να διαβάσουν.

Συνδέσου για να γράψεις ή να απαντήσεις.

Σύνδεση

Νέα συζήτηση

/ 4000

📌 Καρφιτσωμένη 🔒 Κλειδωμένη

·

· ·

/ 4000

🔒 Η συζήτηση είναι κλειδωμένη — δεν επιτρέπονται νέες απαντήσεις.

  • Δεν υπάρχουν συζητήσεις — ξεκίνα την πρώτη.

Υποστήριξη

Ιδιωτική υποστήριξη 1:1 με τον πάροχο — χρέωση, ενσωμάτωση, λογαριασμός. Μόνο εσύ και η ομάδα του παρόχου βλέπετε αυτά τα threads.

Συνδέσου για να ανοίξεις ticket υποστήριξης.

Σύνδεση

Άνοιγμα νέου ticket

Περιέγραψε με τι χρειάζεσαι βοήθεια. Η ομάδα λαμβάνει email και απαντά στη σελίδα του ticket.

  • Δεν υπάρχουν tickets για αυτό το API.

Η συνδρομή είναι ενεργή — οι κλήσεις μπορούν να ξεκινήσουν αμέσως.

Στείλτε το πρώτο σας αίτημα —

Η συνδρομή είναι ενεργή — αντιγράψτε ένα απόσπασμα και ενεργοποιήστε την πρώτη σας κλήση.