#mass-spectrometry

MetaboLights en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — le premier référentiel ouvert au monde pour les expériences de métabolomique (spectroscopie RMN et spectrométrie de masse) et une ressource sœur de PRIDE pour la protéomique. Recherchez les études de métabolomique publiques par mot-clé (retournant l'accession, le titre, la description et l'organisme de chaque étude) ; lisez les métadonnées complètes d'une étude, y compris son résumé, son statut, ses dates de soumission et de publication, les descripteurs de conception d'étude, les facteurs expérimentaux, les analyses analytiques avec leur type de mesure, technologie et plateforme, les contributeurs et leurs rôles, les publications liées avec DOI et identifiants PubMed, les soumetteurs, le nombre d'échantillons, l'URL de téléchargement FTP et la licence des données ; inspectez le flux de travail analytique — chaque protocole avec son nom, son type, sa description et ses paramètres (collecte d'échantillons, extraction, chromatographie, spectroscopie RMN/MS, transformation des données et identification des métabolites) ; et listez les organismes et parties d'organismes étudiés avec leurs termes d'ontologie. Idéal pour la recherche en métabolomique et en biologie des systèmes, la réutilisation des ensembles de données et la méta-analyse, les pipelines bioinformatiques et les outils qui intègrent des preuves expérimentales. Les accessions d'étude ressemblent à MTBLS1. Données provenant d'EMBL-EBI MetaboLights.

api.oanor.com/metabolights-api

L'archive protéomique PRIDE sous forme d'API, propulsée par l'archive PRIDE de l'EMBL-EBI — le plus grand dépôt public mondial de données de protéomique par spectrométrie de masse et membre fondateur de ProteomeXchange. Recherchez les expériences protéomiques publiques par mot-clé (renvoyant l'accession, le titre, les organismes, les maladies et les instruments de chaque projet) ; lisez les métadonnées complètes d'un projet, y compris sa description, ses mots-clés, ses organismes et parties d'organismes, ses instruments de spectrométrie de masse, ses logiciels, les modifications protéiques identifiées, les protocoles de traitement des échantillons et des données, les soumetteurs, les affiliations et la publication liée (DOI et PubMed) ; listez les fichiers de données d'un projet avec leur catégorie, format, taille et un lien de téléchargement direct ; et explorez les facettes — les maladies, organismes, instruments, types d'expériences, logiciels et pays représentés parmi les projets correspondants — pour la découverte. Idéal pour la recherche en protéomique et en biologie des systèmes, la réutilisation d'ensembles de données et la méta-analyse, les pipelines bioinformatiques et les outils intégrant des preuves expérimentales. Les accessions de projet ressemblent à PXD000001. Données de l'EMBL-EBI.

api.oanor.com/pride-api