oanor
Gratis registreren
Marktplaats Prijzen Functies Inloggen

API · /ena-api

ENA API

gezond 4,897 Abonnees

Het European Nucleotide Archive (ENA) als API, aangedreven door EMBL-EBI — een van de drie INSDC-partners naast NCBI GenBank en DDBJ, en het uitgebreide openbare archief van 's werelds nucleotidesequentiegegevens. ENA bevat ruwe sequencing-reads, geassembleerde en geannoteerde genomen, individuele sequenties, biologische monsters en de studies erachter, voor elk domein van het leven — de ruggengraatbron voor genomica, microbiologie, ecologie, evolutie en klinisch onderzoek. Deze API biedt een heldere driestappenworkflow over dat archief. Eerst lost /v1/taxon een organismenaam (bijv. "Homo sapiens") op naar zijn NCBI-taxon-id, wetenschappelijke naam, taxonomische rang en volledige afstamming — of zoekt een taxon direct op via id. Vervolgens doorzoekt /v1/search het archief naar records van dat taxon van een gekozen type: genoomassemblages (met assemblagenaam, niveau en basistelling), sequencing-runs (met platform, instrument en leestellingen), biologische monsters (met verzamelingsdatum en land), geannoteerde sequenties, leesexperimenten, analyses, coderende en niet-coderende sequenties, en studies — standaard inclusief alle afstammende taxa, of beperkt tot het exacte taxon. Ten slotte retourneert /v1/record een samenvatting voor elke ENA-accessie — assemblages (GCA_…), studies en projecten (PRJ…), monsters (SAM…/ERS…), sequencing-runs (ERR…/SRR…) en sequenties — met de titel, gegevenstype, taxon, wetenschappelijke naam, basis- en sequentietellingen en openbare status. Ideaal voor bioinformatica-pijplijnen, genoomgegevensontdekking, sequencing-metadata-oogst, biodiversiteits- en metagenomica-tooling, en reproduceerbaarheid van onderzoek. Taxon-id's zien eruit als 9606 (mens); accessies zoals GCA_000001405. Gegevens van EMBL-EBI ENA, een INSDC-archief, gratis te gebruiken.

#ena #nucleotide #genomics #sequencing #bioinformatics #embl-ebi #insdc #life-sciences
api.oanor.com/ena-api
Verkrijg een API-sleutel Probeer het in de speeltuin → Provider contacteren

Machineleesbare specificaties zodat AI-agenten deze API kunnen integreren.

/api/ena-api/openapi.json
/api/ena-api/llms.txt

Ontdekking: GET /api/index.json vermeldt elke API.

API-gezondheid

gezond
Uptime
100.00%
Serversondes · 24 uur
Gem. latentie
155 ms
Serversondes · 24 uur
Abonnees
4,897
actief
Totaal aantal oproepen
8
laatste 7 dagen
status Volledige statuspagina → · 12 sondes/24u

Prijzen

Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.

Free

Vrij

  • 600 oproepen / maand
  • 2 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 600 oproepen/maand
  • 2 verzoeken/sec
  • Taxon resolve, zoeken & records
  • Geen creditcard
Meld u aan om u te abonneren

Starter

€9.00 /maand

  • 24,000 oproepen / maand
  • 5 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 24k oproepen/maand
  • 5 verzoeken/sec
  • Alle recordtypen
  • E-mailondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Pro

€27.00 /maand

  • 115,000 oproepen / maand
  • 12 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 115k oproepen/maand
  • 12 verzoeken/sec
  • Pipeline en metadata harvesting
  • Prioritaire ondersteuning
Meld u aan om u te abonneren

Mega

€69.00 /maand

  • 470,000 oproepen / maand
  • 35 verzoeken / tweede
  • Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
  • 470k oproepen/maand
  • 35 verzoeken/sec
  • High-throughput genomica
  • Toegewijde SLA
Meld u aan om u te abonneren

Gebouwd door

P
PremiumApi

Gerelateerd APIs

Andere APIs met overlappende tags.

Genome Assemblies API

Referentie-genoomassemblages als een API — aangedreven door NCBI Assembly, het register van genoomversies voor organismen in de hele levensboom. Zoek assemblages op organisme (of vrije tekst) en raadpleeg de metadata van elke assemblage: de accession (GCF_… RefSeq of GCA_… GenBank), naam (bijv. GRCh38.p14), organisme en taxon-id, assemblage-niveau (volledig genoom, chromosoom, scaffold of contig), contiguïteitsstatistieken (contig- en scaffold-N50), sequentiedekking, RefSeq-categorie, UCSC- en Ensembl-namen, de indienende organisatie, releasedatum en FTP-downloadpaden. Van het menselijke referentiegenoom tot elk gesequenced microbe, plant of dier, het verandert het genoomassemblage-register in een schone zoek-en-haal API. Een genoomassemblage-register — te onderscheiden van sequentie (ENA), genoomannotatie (Ensembl), variant (ClinVar, dbVar) en genexpressie (GEO) databases. Open data van NCBI Assembly (publiek domein).

api.oanor.com/genomes-api

Gene Expression API

Functionele-genomica-experimenten als een API — aangedreven door NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), de grootste openbare repository van genexpressiegegevens. GEO archiveert expressieseries en samengestelde datasets van microarray- en high-throughput-sequencing-experimenten voor elk organisme. Zoek experimenten op trefwoord en optioneel op organisme, en raadpleeg elke serie of dataset om de metadata te krijgen: titel, samenvatting, assaytype (expressieprofilering door array of door sequencing), organisme, aantal monsters, platform en de publicatie erachter. Van β-celstressstudies tot kankertranscriptomics bij mens en muis, het verandert het GEO-archief in een eenvoudige zoek-en-ophaal-API voor transcriptomics, bio-informatica en onderzoeksgegevensontdekking. Een genexpressie / functionele-genomica-datasetrepository — te onderscheiden van sequentie- (ENA), variant- (ClinVar, dbVar), structuur- (PDB) en ontologiedatabases. Open data van NCBI GEO (publiek domein).

api.oanor.com/geodatasets-api

Structural Variants API

Menselijke genomische structurele variatie als een API — aangedreven door NCBI dbVar, het archief van structurele varianten (SVs): copy-number varianten (CNVs), grote deleties, duplicaties, inserties, inversies en translocaties, typisch groter dan 50 basenparen. Dit is de structurele tegenhanger van single-nucleotide variant databases: zoek naar structurele varianten die een gen overlappen (of via vrije tekst) en verkrijg de dbVar-accessie van elke variant, de studie waar deze vandaan komt, het type, de genen die het overlapt, de genomische plaatsing op GRCh38 en de klinische significantie; zoek vervolgens elke variant op voor het volledige record — plaatsingen op zowel GRCh37- als GRCh38-assemblages, varianttype, genen, klinische significantie, studietype, methoden en varianttellingen. Van BRCA1 CNVs tot Cri-du-chat deleties, het is ideaal voor genomica, cytogenetica, zeldzame ziekten en bioinformatica werk. Een structurele variatie / CNV-bron — anders dan klinische single-nucleotide variant interpretatie (ClinVar), populatie allelfrequenties (gnomAD) en eigenschapsassociaties (GWAS). Open data van NCBI dbVar (publiek domein).

api.oanor.com/dbvar-api

Protein Interactions API

Eiwit-eiwit interactienetwerken als een API — aangedreven door STRING, de database van bekende en voorspelde eiwitassociaties die bewijs uit laboratoriumexperimenten, samengestelde pathway-databases, gen-co-expressie, genomische context en geautomatiseerde tekstmining combineert in één betrouwbaarheidsscore, voor duizenden organismen. Verkrijg de top interactiepartners van een eiwit (elk met de gecombineerde betrouwbaarheidsscore en de zeven bewijskanaal-subscores), het interactienetwerk tussen een willekeurige set eiwitten als gescoorde randen, en functionele verrijking voor een genset — de oververtegenwoordigde GO-termen, KEGG-pathways, Pfam-domeinen en meer, elk met zijn p-waarde, FDR en lidgenen. Geef gensymbolen (TP53) of STRING/Ensembl-id's, voor menselijk (standaard) of elke soort via NCBI-taxon-id. Het is een hoeksteen van systeembiologie — ideaal voor netwerkanalyse, functionele genomica, pathway- en bioinformatica-tools. Een eiwit-interactienetwerk-bron — onderscheiden van biologische pathways (Reactome), samengestelde eiwitcomplexen (Complex Portal) en Gene Ontology-annotaties (QuickGO). Open data van STRING (CC BY 4.0).

api.oanor.com/stringdb-api

Veelgestelde vragen

Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.

Hoe krijg ik een API-sleutel voor ENA API?
Registreer gratis op oanor.com, genereer een API-sleutel in het ontwikkelaarsdashboard en roep ENA API aan met de x-oanor-key-header. Geen creditcard nodig voor het gratis abonnement.
Wat is de rate-limit voor ENA API?
Het gratis pakket staat 1 verzoek per seconde toe. Betaalde pakketten schalen tot 50 verzoeken per seconde op het Mega-niveau. Harde limieten geven HTTP 429 boven de quota — geen verrassende meerkosten.
Wat kost ENA API?
ENA API heeft een gratis pakket met 100 calls / maand. Betaalde pakketten beginnen bij €9.00 / maand met hogere quota's en snellere rate-limits.
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Ja. Abonnementen worden maandelijks gefactureerd en je kunt op elk moment opzeggen via je facturatie-dashboard. Geen langetermijncontracten en geen opzegkosten.
Voldoet ENA API aan de AVG?
Alle aanvragen aan ENA API lopen via onze EU-gateway. Je upstream-API-sleutel verlaat nooit onze server en er worden geen persoonsgegevens gedeeld met de upstream-leverancier behalve de aanvraag zelf.

Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.

Codefragmenten

Meld u aan om een ​​API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.

curl https://api.oanor.com/ena-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/ena-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/ena-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/ena-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Beoordelingen

Log in om te beoordelen.

Nog geen beoordelingen.

Discussie

Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.

Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.

Inloggen

Nieuwe discussie

/ 4000

📌 Vastgepind 🔒 Vergrendeld

·

· ·

/ 4000

🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.

  • Nog geen discussies — start de eerste.

Support

Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.

Meld je aan om een supportticket te openen.

Inloggen

Nieuw ticket openen

Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.

  • Nog geen tickets voor deze API.

Abonnement actief: calls kunnen direct starten.

Verstuur uw eerste aanvraag —

Abonnement actief: kopieer een fragment en start uw eerste oproep.