#protein-interactions

Δίκτυα αλληλεπιδράσεων πρωτεΐνης-πρωτεΐνης ως API — υποστηρίζεται από το STRING, τη βάση δεδομένων γνωστών και προβλεπόμενων συσχετίσεων πρωτεϊνών που συνδυάζει στοιχεία από εργαστηριακά πειράματα, επιμελημένες βάσεις δεδομένων μονοπατιών, γονιδιακή συνεκφραση, γονιδιωματικό πλαίσιο και αυτοματοποιημένη εξόρυξη κειμένου σε μια ενιαία βαθμολογία εμπιστοσύνης, σε χιλιάδες οργανισμούς. Λάβετε τους κορυφαίους συνεργάτες αλληλεπίδρασης μιας πρωτεΐνης (καθένας με τη συνδυασμένη βαθμολογία εμπιστοσύνης και τις επτά υποβαθμολογίες καναλιών απόδειξης), το δίκτυο αλληλεπίδρασης μεταξύ οποιουδήποτε συνόλου πρωτεϊνών ως βαθμολογημένες ακμές και λειτουργικό εμπλουτισμό για ένα σύνολο γονιδίων — τους υπερ-αντιπροσωπευόμενους όρους GO, μονοπάτια KEGG, τομείς Pfam και άλλα, το καθένα με την p-τιμή, το FDR και τα μέλη γονίδιά του. Περάστε σύμβολα γονιδίων (TP53) ή αναγνωριστικά STRING/Ensembl, για άνθρωπο (προεπιλογή) ή οποιοδήποτε είδος με αναγνωριστικό ταξινομίας NCBI. Είναι ακρογωνιαίος λίθος της συστημικής βιολογίας — ιδανικό για ανάλυση δικτύων, λειτουργική γονιδιωματική, μονοπάτια και εργαλεία βιοπληροφορικής. Ένας πόρος δικτύου αλληλεπίδρασης πρωτεϊνών — διακριτός από βιολογικά μονοπάτια (Reactome), επιμελημένα σύμπλοκα πρωτεϊνών (Complex Portal) και σχολιασμούς Γονιδιακής Οντολογίας (QuickGO). Ανοιχτά δεδομένα από το STRING (CC BY 4.0).

api.oanor.com/stringdb-api

Η βάση δεδομένων αλληλεπιδράσεων πρωτεϊνών STRING ως API — το επιμελημένο και προβλεπόμενο δίκτυο λειτουργικών συσχετίσεων μεταξύ πρωτεϊνών, που υποστηρίζεται από το επίσημο STRING API. Επιλύστε ονόματα γονιδίων ή πρωτεϊνών σε αναγνωριστικά STRING με σχολιασμούς· λάβετε τους κορυφαίους συνεργάτες αλληλεπίδρασης μιας πρωτεΐνης με συνδυασμένη βαθμολογία εμπιστοσύνης και ανά κανάλι αποδείξεις (πειραματικές, επιμελημένες βάσεις δεδομένων, συνέκφραση, εξόρυξη κειμένου, γονιδιακή σύντηξη, γειτνίαση και συν-εμφάνιση)· δημιουργήστε το δίκτυο αλληλεπιδράσεων μεταξύ ενός συνόλου πρωτεϊνών ως ακμές με βαθμολογία· εκτελέστε λειτουργικό εμπλουτισμό ενός συνόλου γονιδίων σε Gene Ontology, KEGG, Reactome, Pfam, InterPro και άλλα με p-τιμές και ποσοστά ψευδούς ανακάλυψης· και βαθμολογήστε ομολογία μεταξύ πρωτεϊνών. Καλύπτει 12.000+ οργανισμούς (προεπιλογή άνθρωπος, NCBI taxon 9606). Ιδανικό για συστημική βιολογία και δίκτυα βιολογίας, ανάλυση γονιδιακών συνόλων και μονοπατιών, έρευνα φαρμακευτικών στόχων και γονιδίων ασθενειών, και πίνακες ελέγχου βιοπληροφορικής.

api.oanor.com/string-api