oanor
Δωρεάν εγγραφή
Αγορά Τιμές Λειτουργίες Σύνδεση

API · /biosamples-api

BioSamples API

υγιής 4,634 Συνδρομητές

BioSamples ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — η βάση δεδομένων που αποθηκεύει και συνδέει τα μεταδεδομένα βιολογικών δειγμάτων, τα φυσικά δείγματα πίσω από βιολογικά πειράματα. Ένα δείγμα στο BioSamples φέρει μια σταθερή πρόσβαση (όπως SAMEA3231268) και ένα πλούσιο σύνολο χαρακτηριστικών — οργανισμός, ιστός ή μέρος οργανισμού, τύπος κυττάρου, φύλο, ασθένεια, αναπτυξιακό στάδιο, στέλεχος και οποιαδήποτε χαρακτηριστικά παρέχονται από τον υποβάλλοντα — και αναφέρεται από άλλα αρχεία του EBI, συμπεριλαμβανομένων του European Nucleotide Archive (ENA), του ArrayExpress και του PRIDE. Το /v1/search?q=liver αναζητά δείγματα με ελεύθερο κείμενο και επιστρέφει την πρόσβαση, το όνομα, τον οργανισμό και την ημερομηνία κυκλοφορίας κάθε αντιστοιχίας. Το /v1/sample?id=SAMEA3231268 επιστρέφει τα μεταδεδομένα ενός δείγματος — την πρόσβαση, το όνομα, το αναγνωριστικό ταξινομίας NCBI, τον οργανισμό, τις ημερομηνίες κυκλοφορίας και ενημέρωσης, τον αριθμό σχέσεων με άλλα δείγματα και τα χαρακτηριστικά του που έχουν μετατραπεί σε έναν καθαρό χάρτη κλειδιού→τιμής. Οι προσβάσεις μοιάζουν με SAMEA…, SAMN… ή SAMD…· μπορείτε να λάβετε μία από το τελικό σημείο αναζήτησης. Ιδανικό για ενοποίηση δεδομένων βιοεπιστημών, παρακολούθηση δειγμάτων, εναρμόνιση μεταδεδομένων και σύνδεση δεδομένων αλληλούχισης ή έκφρασης με το αρχικό δείγμα. Δεδομένα από το EMBL-EBI BioSamples (δημόσια). Πρόκειται για ένα μητρώο μεταδεδομένων βιολογικών δειγμάτων — διακριτό από βάσεις δεδομένων μελετών (BioStudies), αλληλουχιών (ENA), παραλλαγών (ClinVar) και δομών.

#biosamples #samples #embl-ebi #metadata #life-sciences #specimens #bioinformatics
api.oanor.com/biosamples-api
Λάβετε ένα κλειδί API Δοκιμάστε στην παιδική χαρά → Επικοινωνήστε με τον πάροχο

Προδιαγραφές αναγνώσιμες από μηχανή, ώστε οι πράκτορες AI να μπορούν να ενσωματώσουν αυτό το API.

/api/biosamples-api/openapi.json
/api/biosamples-api/llms.txt

Ανακάλυψη: Το GET /api/index.json παραθέτει κάθε API.

Υγεία API

υγιής
Χρόνος λειτουργίας
100.00%
Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
Μέση καθυστέρηση
364 ms
Ανιχνευτές διακομιστή · 24 ώρες
Συνδρομητές
4,634
ενεργός
Σύνολο κλήσεων
6
τις τελευταίες 7 ημέρες
status Πλήρης σελίδα κατάστασης → · 9 ανιχνευτές/24 ώρες

Τιμολόγηση

Επιλέξτε μια βαθμίδα — χρεώνεται μηνιαία, ακυρώστε ανά πάσα στιγμή.

Free

Δωρεάν

  • 2,050 κλήσεις / μήνα
  • 2 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 2050 κλήσεις/μήνα
  • 2 αιτήσεις/δευτ.
  • Αναζήτηση & μεταδεδομένα δείγματος
  • Χωρίς πιστωτική κάρτα
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Starter

€6.00 /μήνας

  • 46,000 κλήσεις / μήνα
  • 5 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 46k κλήσεις/μήνα
  • 5 αιτήσεις/δευτερόλεπτο
  • Χάρτης χαρακτηριστικών
  • Υποστήριξη μέσω email
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Pro

€18.50 /μήνας

  • 211,000 κλήσεις / μήνα
  • 12 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 211k κλήσεις/μήνα
  • 12 req/sec
  • Ενσωμάτωση μεταδεδομένων
  • Υποστήριξη προτεραιότητας
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Mega

€51.00 /μήνας

  • 772,000 κλήσεις / μήνα
  • 35 αιτήματα / δευτερόλεπτο
  • Hard cap (429 πάνω από το όριο, χωρίς υπέρβαση)
  • 772k κλήσεις/μήνα
  • 35 αιτήσεις/δευτερόλεπτο
  • Επιστήμες ζωής υψηλής απόδοσης
  • Αφιερωμένο SLA
Συνδεθείτε για να εγγραφείτε

Κατασκευάστηκε από

P
PremiumApi

Σχετικό API

Άλλο API με επικαλυπτόμενες ετικέτες.

BioStudies API

Το BioStudies ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — η βάση δεδομένων που περιέχει τις περιγραφές βιολογικών μελετών και συνδέει τα δεδομένα τους σε όλους τους πόρους του EBI, συμπεριλαμβανομένων της απεικόνισης (BioImage Archive), της λειτουργικής γονιδιωματικής (ArrayExpress), της πρωτεομικής και της βιβλιογραφίας (Europe PMC). Κάθε μελέτη έχει έναν κωδικό πρόσβασης, έναν τίτλο και μια περίληψη, τη συλλογή στην οποία ανήκει και συνδέσμους προς τα υποκείμενα δεδομένα και τις δημοσιεύσεις της. Το /v1/search?query=covid αναζητά τις μελέτες και επιστρέφει τον κωδικό πρόσβασης κάθε αντιστοιχίας (π.χ. S-EPMC8017430), τον τίτλο, τον συγγραφέα, τον τύπο μελέτης, την ημερομηνία κυκλοφορίας και τον αριθμό συνδέσμων/αρχείων. Το /v1/study?id=S-EPMC8017430 επιστρέφει τα μεταδεδομένα μιας μελέτης — τον κωδικό πρόσβασης, τη συλλογή στην οποία ανήκει (όπως EuropePMC, ArrayExpress ή BioImages), τον τίτλο, την περίληψη, την ημερομηνία κυκλοφορίας, τους συγγραφείς και τον αριθμό των συνδεδεμένων πόρων. Οι κωδικοί πρόσβασης μοιάζουν με S-EPMC8017430 ή S-BSST123· λάβετε έναν από το τελικό σημείο αναζήτησης. Ιδανικό για ανακάλυψη ερευνητικών δεδομένων, σύνδεση βιβλιογραφίας με τα υποκείμενα σύνολα δεδομένων, συστηματικές ανασκοπήσεις και εργαλεία αναπαραγωγιμότητας. Δεδομένα από το EMBL-EBI BioStudies (δημόσια). Πρόκειται για ένα ευρετήριο μεταδεδομένων μελετών και συνόλων δεδομένων — διακριτό από τις βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (UniProt, ENA), δομής (PDB, EMDB), παραλλαγών (ClinVar) και οντολογιών.

api.oanor.com/biostudies-api

EMDB API

Η Τράπεζα Δεδομένων Ηλεκτρονικής Μικροσκοπίας (EMDB) ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — το δημόσιο αρχείο τρισδιάστατων χαρτών πυκνότητας ηλεκτρονικής μικροσκοπίας πρωτεϊνών, νουκλεϊκών οξέων και μεγάλων μακρομοριακών συμπλόκων. Το EMDB είναι το αντίστοιχο της Τράπεζας Δεδομένων Πρωτεϊνών για την ηλεκτρονική μικροσκοπία, περιέχοντας χάρτες που επιλύθηκαν με κρυο-ΗΜ μονοσωματιδίου, ηλεκτρονική τομογραφία και ηλεκτρονική κρυσταλλογραφία, την τεχνική πίσω από την πρόσφατη «επανάσταση ανάλυσης» στη δομική βιολογία. Το /v1/search?q=ribosome αναζητά στο αρχείο και επιστρέφει για κάθε αντίστοιχη εγγραφή το αναγνωριστικό EMDB (π.χ. EMD-1010), τον τίτλο, τη μέθοδο ηλεκτρονικής μικροσκοπίας και την ανάλυση σε ångström. Το /v1/entry?id=EMD-1010 επιστρέφει τα μεταδεδομένα μιας εγγραφής — τον τίτλο της, τη μέθοδο ΗΜ (μονοσωματίδιο, τομογραφία, …), την κατάσταση συσσωμάτωσης, την ανάλυση, το βιολογικό δείγμα που μελετήθηκε, λέξεις-κλειδιά ταξινόμησης, τις ημερομηνίες κατάθεσης, απελευθέρωσης χάρτη και τελευταίας ενημέρωσης, και τους συγγραφείς κατάθεσης. Τα αναγνωριστικά EMDB μοιάζουν με EMD-1010, και μπορείτε να περάσετε μόνο τον αριθμό. Ιδανικό για εργαλεία δομικής βιολογίας και κρυο-ΗΜ, εφαρμογές σύγκρισης δομών και οπτικοποίησης, και εκπαίδευση. Δεδομένα από το EMBL-EBI EMDB (δημόσιος τομέας). Αυτό είναι το αρχείο πειραματικών ΧΑΡΤΩΝ ηλεκτρονικής μικροσκοπίας — διακριτό από δομές ατομικών συντεταγμένων (PDB), προβλεπόμενες δομές (AlphaFold) και βάσεις δεδομένων αλληλουχιών πρωτεϊνών (UniProt).

api.oanor.com/emdb-api

BioModels API

BioModels ως API, με την υποστήριξη του EMBL-EBI — το μεγαλύτερο αποθετήριο στον κόσμο επιμελημένων, δημοσιευμένων μαθηματικών μοντέλων βιολογικών συστημάτων. Το BioModels συλλέγει υπολογιστικά μοντέλα (κυρίως σε SBML, τη Γλώσσα Σήμανσης Συστημάτων Βιολογίας) μεταβολισμού, σηματοδότησης κυττάρων, γονιδιακών ρυθμιστικών δικτύων, κυτταρικού κύκλου, διαδικασιών ασθενειών και φυσιολογίας, το καθένα συνδεδεμένο με την αξιολογημένη από ομοτίμους δημοσίευση από την οποία προέρχεται. Το /v1/search?query=glycolysis αναζητά στο αποθετήριο και επιστρέφει κάθε ταιριαστό μοντέλο με το id του (όπως BIOMD0000000012), όνομα, μορφή, υποβολέα και ημερομηνίες υποβολής/τροποποίησης. Το /v1/model?id=BIOMD0000000012 επιστρέφει τα μεταδεδομένα ενός μοντέλου — το όνομα και την περιγραφή του, τη μορφή κωδικοποίησης, την προσέγγιση μοντελοποίησης (π.χ. μοντέλο συνήθων διαφορικών εξισώσεων), την κατάσταση επιμέλειας, τη δημοσίευση πίσω από αυτό (τίτλος, περιοδικό, έτος, συγγραφείς) και τα αρχεία μοντέλου. Τα id μοντέλων μοιάζουν με BIOMD0000000012 για επιμελημένα μοντέλα ή MODEL1234567890 για μη επιμελημένες υποβολές· λάβετε τα από το τελικό σημείο αναζήτησης. Ιδανικό για εργαλεία συστημικής βιολογίας και υπολογιστικής μοντελοποίησης, ροές εργασίας αναπαραγώγιμης έρευνας και επαναχρησιμοποίησης μοντέλων, και διδασκαλία. Δεδομένα από EMBL-EBI BioModels (CC0). Πρόκειται για ένα αποθετήριο συστημικής βιολογίας / υπολογιστικών μοντέλων — διακριτό από βάσεις δεδομένων αλληλουχίας (UniProt, ENA), δομής (PDB, AlphaFold), μονοπατιών και παραλλαγών (ClinVar).

api.oanor.com/biomodels-api

OLS Οντολογία API

Η Υπηρεσία Αναζήτησης Οντολογιών (OLS) του EMBL-EBI ως API — ένα ενιαίο σημείο πρόσβασης σε περισσότερες από 280 βιοϊατρικές και επιστημονικές οντολογίες και ελεγχόμενα λεξιλόγια σε ένα μέρος: τη Γονιδιακή Οντολογία (GO), την Οντολογία Ανθρώπινων Ασθενειών (DOID), την Οντολογία Ανθρώπινου Φαινοτύπου (HP), ChEBI (χημικές οντότητες), Uberon (ανατομία), την Οντολογία Πειραματικών Παραγόντων (EFO), Mondo, NCIt και πολλές άλλες. Το /v1/search?q=diabetes αναζητά όρους σε όλες τις οντολογίες (ή περιορίζεται σε μία με ontology=doid), επιστρέφοντας την ετικέτα κάθε αντιστοίχισης, το OBO id (όπως DOID:9351 ή GO:0008150), την οντολογία, το IRI και έναν σύντομο ορισμό. Το /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 επιστρέφει τις λεπτομέρειες ενός μόνο όρου — την ετικέτα, τον ορισμό, το IRI, τα συνώνυμα και αν είναι απαρχαιωμένος. Το /v1/ontologies περιηγείται στις διαθέσιμες οντολογίες με το id, τον τίτλο, την περιγραφή και τον αριθμό όρων τους. Τα OBO ids μοιάζουν με DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 ή CHEBI:15377. Ιδανικό για βιοϊατρική επεξεργασία φυσικής γλώσσας, σχολιασμό και εναρμόνιση δεδομένων, αυτόματη συμπλήρωση επιστημονικής ορολογίας και εργαλεία σημασιολογίας και γράφων γνώσης. Δεδομένα από το EMBL-EBI OLS (ανοιχτά). Πρόκειται για μια γενική αναζήτηση οντολογίας / ελεγχόμενου λεξιλογίου που καλύπτει πολλούς τομείς — ευρύτερη από ένα μόνο ιατρικό θησαυρό όπως το MeSH.

api.oanor.com/ols-api

Συχνές ερωτήσεις

Γρήγορες απαντήσεις για τιμές, ποσοστώσεις και ενσωμάτωση.

Πώς αποκτώ ένα κλειδί API για το BioSamples API;
Εγγράψου δωρεάν στο oanor.com, δημιούργησε ένα κλειδί API από τον πίνακα ελέγχου προγραμματιστή και κάλεσε το BioSamples API με την κεφαλίδα x-oanor-key. Δεν απαιτείται πιστωτική κάρτα για το δωρεάν πλάνο.
Ποιο είναι το όριο ρυθμού του BioSamples API;
Το δωρεάν πλάνο επιτρέπει 1 αίτημα ανά δευτερόλεπτο. Τα επί πληρωμή πλάνα κλιμακώνονται έως 50 αιτήματα ανά δευτερόλεπτο στο επίπεδο Mega. Τα αυστηρά όρια επιστρέφουν HTTP 429 πάνω από την ποσόστωση — χωρίς εκπλήξεις στις χρεώσεις υπερβάσεων.
Πόσο κοστίζει το BioSamples API;
Το BioSamples API έχει δωρεάν πλάνο με 100 κλήσεις / μήνα. Τα επί πληρωμή πλάνα ξεκινούν από €6.00 / μήνα με υψηλότερες ποσοστώσεις και ταχύτερα όρια ρυθμού.
Μπορώ να ακυρώσω τη συνδρομή μου ανά πάσα στιγμή;
Ναι. Τα πλάνα χρεώνονται μηνιαίως και μπορείς να ακυρώσεις οποτεδήποτε από το ταμπλό χρέωσης. Χωρίς μακροπρόθεσμα συμβόλαια και χωρίς τέλος ακύρωσης.
Είναι το BioSamples API συμβατό με τον GDPR;
Όλα τα αιτήματα προς BioSamples API περνούν μέσω της πύλης μας στην ΕΕ. Το upstream API κλειδί σου δεν φεύγει ποτέ από τον διακομιστή μας και δεν μοιράζονται προσωπικά δεδομένα με τον upstream πάροχο πέρα από το αίτημα που στέλνεις.

Επιλέξτε ένα τελικό σημείο από τη λίστα στα αριστερά για να δείτε τις λεπτομέρειες και δοκιμάστε το.

Αποσπάσματα κώδικα

Εγγραφείτε για να λάβετε ένα API key και, στη συνέχεια, καλέστε οποιαδήποτε διαδρομή κάτω από το slug σας.

curl https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Αξιολογήσεις

Συνδεθείτε για να βαθμολογήσετε.

Δεν υπάρχουν ακόμη κριτικές.

Συζήτηση

Κάνε ερωτήσεις, μοιράσου συμβουλές, πάρε απαντήσεις από τον πάροχο και άλλους προγραμματιστές. Δημόσιο — όλοι μπορούν να διαβάσουν.

Συνδέσου για να γράψεις ή να απαντήσεις.

Σύνδεση

Νέα συζήτηση

/ 4000

📌 Καρφιτσωμένη 🔒 Κλειδωμένη

·

· ·

/ 4000

🔒 Η συζήτηση είναι κλειδωμένη — δεν επιτρέπονται νέες απαντήσεις.

  • Δεν υπάρχουν συζητήσεις — ξεκίνα την πρώτη.

Υποστήριξη

Ιδιωτική υποστήριξη 1:1 με τον πάροχο — χρέωση, ενσωμάτωση, λογαριασμός. Μόνο εσύ και η ομάδα του παρόχου βλέπετε αυτά τα threads.

Συνδέσου για να ανοίξεις ticket υποστήριξης.

Σύνδεση

Άνοιγμα νέου ticket

Περιέγραψε με τι χρειάζεσαι βοήθεια. Η ομάδα λαμβάνει email και απαντά στη σελίδα του ticket.

  • Δεν υπάρχουν tickets για αυτό το API.

Η συνδρομή είναι ενεργή — οι κλήσεις μπορούν να ξεκινήσουν αμέσως.

Στείλτε το πρώτο σας αίτημα —

Η συνδρομή είναι ενεργή — αντιγράψτε ένα απόσπασμα και ενεργοποιήστε την πρώτη σας κλήση.