oanor
Kostenlos starten
Marktplatz Preise Funktionen Anmelden

API · /biosamples-api

BioSamples API

gesund 4,634 Subscribers

BioSamples als API, betrieben von EMBL-EBI – die Datenbank, die die Metadaten biologischer Proben speichert und verknüpft, die physischen Exemplare hinter biologischen Experimenten. Eine Probe in BioSamples trägt eine stabile Zugangsnummer (wie SAMEA3231268) und eine umfangreiche Reihe von Merkmalen – Organismus, Gewebe oder Organbestandteil, Zelltyp, Geschlecht, Krankheit, Entwicklungsstadium, Stamm und alle vom Einreicher bereitgestellten Attribute – und wird von anderen EBI-Archiven referenziert, darunter das European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress und PRIDE. /v1/search?q=liver durchsucht Proben nach Freitext und gibt für jede Übereinstimmung die Zugangsnummer, den Namen, den Organismus und das Veröffentlichungsdatum zurück. /v1/sample?id=SAMEA3231268 gibt die Metadaten einer Probe zurück – ihre Zugangsnummer, ihren Namen, die NCBI-Taxon-ID, den Organismus, das Veröffentlichungs- und Aktualisierungsdatum, die Anzahl der Beziehungen zu anderen Proben und ihre Merkmale, reduziert auf eine saubere Schlüssel→Wert-Zuordnung. Zugangsnummern sehen aus wie SAMEA…, SAMN… oder SAMD…; erhalten Sie eine vom Such-Endpunkt. Ideal für die Integration lebenswissenschaftlicher Daten, Probenverfolgung, Metadatenharmonisierung und die Verknüpfung von Sequenzierungs- oder Expressionsdaten mit ihrem Ursprungsexemplar. Daten von EMBL-EBI BioSamples (öffentlich). Dies ist ein Register für biologische Probenmetadaten – zu unterscheiden von Studien- (BioStudies), Sequenz- (ENA), Varianten- (ClinVar) und Strukturdatenbanken.

#biosamples #samples #embl-ebi #metadata #life-sciences #specimens #bioinformatics
api.oanor.com/biosamples-api
API-Key holen Im Playground testen → Anbieter kontaktieren

Maschinenlesbare Spezifikation, damit KI-Agenten diese API integrieren können.

/api/biosamples-api/openapi.json
/api/biosamples-api/llms.txt

Discovery: GET /api/index.json listet alle APIs.

API-Health

gesund
Uptime
100.00%
Server-Probes · 24h
Latenz Ø
364 ms
Server-Probes · 24h
Subscribers
4,634
aktiv
Gesamt-Calls
6
letzte 7 Tage
status Detaillierte Status-Seite → · 9 Probes/24h

Preise

Wähle einen Tier — abrechnung monatlich, jederzeit kündbar.

Free

Kostenlos

  • 2,050 Calls / Monat
  • 2 Anfragen / Sekunde
  • Hartes Limit (429 oberhalb der Quote, keine Mehrkosten)
  • 2050 Anrufe/Monat
  • 2 Anfragen/Sekunde
  • Suche & Beispiel-Metadaten
  • Keine Kreditkarte
Anmelden zum Abonnieren

Starter

€6.00 /Monat

  • 46,000 Calls / Monat
  • 5 Anfragen / Sekunde
  • Hartes Limit (429 oberhalb der Quote, keine Mehrkosten)
  • 46k Aufrufe/Monat
  • 5 Anfragen/Sekunde
  • Merkmalskarte
  • E-Mail-Support
Anmelden zum Abonnieren

Pro

€18.50 /Monat

  • 211,000 Calls / Monat
  • 12 Anfragen / Sekunde
  • Hartes Limit (429 oberhalb der Quote, keine Mehrkosten)
  • 211k Aufrufe/Monat
  • 12 Anfragen/Sekunde
  • Metadatenintegration
  • Prioritäts-Support
Anmelden zum Abonnieren

Mega

€51.00 /Monat

  • 772,000 Calls / Monat
  • 35 Anfragen / Sekunde
  • Hartes Limit (429 oberhalb der Quote, keine Mehrkosten)
  • 772k Aufrufe/Monat
  • 35 req/sec
  • Hochdurchsatz-Lebenswissenschaften
  • Dedizierte SLA
Anmelden zum Abonnieren

Gebaut von

P
PremiumApi

Ähnliche APIs

Andere APIs mit überschneidenden Tags.

BioStudies API

BioStudies als API, bereitgestellt von EMBL-EBI – die Datenbank, die die Beschreibungen biologischer Studien enthält und ihre Daten über EBI-Ressourcen hinweg verknüpft, einschließlich Bildgebung (BioImage Archive), funktioneller Genomik (ArrayExpress), Proteomik und der Literatur (Europe PMC). Jede Studie hat eine Accession, einen Titel und ein Abstract, die Sammlung, zu der sie gehört, sowie Links zu ihren zugrunde liegenden Daten und Publikationen. /v1/search?query=covid durchsucht die Studien und gibt für jede Übereinstimmung die Accession (z. B. S-EPMC8017430), den Titel, den Autor, den Studientyp, das Veröffentlichungsdatum und die Anzahl der Links/Dateien zurück. /v1/study?id=S-EPMC8017430 gibt die Metadaten einer Studie zurück – ihre Accession, die Sammlung, zu der sie gehört (wie EuropePMC, ArrayExpress oder BioImages), Titel, Abstract, Veröffentlichungsdatum, Autoren und die Anzahl der verknüpften Ressourcen. Accessions sehen aus wie S-EPMC8017430 oder S-BSST123; eine davon erhalten Sie vom Such-Endpunkt. Ideal für die Entdeckung von Forschungsdaten, die Verknüpfung von Literatur mit ihren zugrunde liegenden Datensätzen, systematische Übersichtsarbeiten und Reproduzierbarkeits-Tools. Daten von EMBL-EBI BioStudies (öffentlich). Dies ist ein Index für Studien- und Datensatz-Metadaten – unterscheidet sich von den Sequenz- (UniProt, ENA), Struktur- (PDB, EMDB), Varianten- (ClinVar) und Ontologie-Datenbanken.

api.oanor.com/biostudies-api

EMDB API

Die Electron Microscopy Data Bank (EMDB) als API, bereitgestellt von EMBL-EBI – das öffentliche Archiv für dreidimensionale elektronenmikroskopische Dichtekarten von Proteinen, Nukleinsäuren und großen makromolekularen Komplexen. EMDB ist das elektronenmikroskopische Gegenstück zur Protein Data Bank und enthält Karten, die durch Einzelpartikel-Kryo-EM, Elektronentomographie und Elektronenkristallographie gelöst wurden – die Technik hinter der jüngsten „Auflösungsrevolution“ in der Strukturbiologie. /v1/search?q=ribosome durchsucht das Archiv und gibt für jeden Treffer die EMDB-ID (z. B. EMD-1010), den Titel, die elektronenmikroskopische Methode und die Auflösung in Ångström zurück. /v1/entry?id=EMD-1010 gibt die Metadaten eines Eintrags zurück – seinen Titel, die EM-Methode (Einzelpartikel, Tomographie, …), den Aggregatzustand, die Auflösung, die untersuchte biologische Probe, Klassifikationsschlüsselwörter, die Daten der Hinterlegung, Kartenfreigabe und letzten Aktualisierung sowie die hinterlegenden Autoren. EMDB-IDs sehen aus wie EMD-1010, und Sie können nur die Nummer übergeben. Ideal für strukturbiologische und Kryo-EM-Werkzeuge, Strukturvergleichs- und Visualisierungs-Apps sowie Bildung. Daten von EMBL-EBI EMDB (Public Domain). Dies ist das Archiv experimenteller elektronenmikroskopischer KARTEN – zu unterscheiden von Atomkoordinatenstrukturen (PDB), vorhergesagten Strukturen (AlphaFold) und Proteinsequenzdatenbanken (UniProt).

api.oanor.com/emdb-api

BioModels API

BioModels als API, bereitgestellt von EMBL-EBI – das weltweit größte Repository kuratierter, veröffentlichter mathematischer Modelle biologischer Systeme. BioModels sammelt Computermodelle (hauptsächlich in SBML, der Systems Biology Markup Language) von Stoffwechsel, Zellsignalisierung, Genregulationsnetzwerken, Zellzyklus, Krankheitsprozessen und Physiologie, jeweils verknüpft mit der begutachteten Veröffentlichung, aus der sie stammen. /v1/search?query=glycolysis durchsucht das Repository und gibt für jedes passende Modell die ID (wie BIOMD0000000012), den Namen, das Format, den Einreicher sowie die Einreichungs-/Änderungsdaten zurück. /v1/model?id=BIOMD0000000012 gibt die Metadaten eines Modells zurück – seinen Namen und Beschreibung, das Kodierungsformat, den Modellierungsansatz (z. B. gewöhnliches Differentialgleichungsmodell), den Kuratierungsstatus, die zugrunde liegende Veröffentlichung (Titel, Zeitschrift, Jahr, Autoren) und die Modelldateien. Modell-IDs sehen aus wie BIOMD0000000012 für kuratierte Modelle oder MODEL1234567890 für nicht kuratierte Einreichungen; erhalten Sie sie vom Such-Endpunkt. Ideal für Systembiologie- und Computermodellierungswerkzeuge, reproduzierbare Forschungs- und Modellwiederverwendungs-Workflows sowie Lehre. Daten von EMBL-EBI BioModels (CC0). Dies ist ein Systembiologie-/Computermodell-Repository – abzugrenzen von Sequenz- (UniProt, ENA), Struktur- (PDB, AlphaFold), Pathway- und Varianten-Datenbanken (ClinVar).

api.oanor.com/biomodels-api

OLS Ontology API

Der EMBL-EBI Ontology Lookup Service (OLS) als API – ein zentraler Zugangspunkt zu mehr als 280 biomedizinischen und wissenschaftlichen Ontologien und kontrollierten Vokabularen an einem Ort: der Gene Ontology (GO), der Human Disease Ontology (DOID), der Human Phenotype Ontology (HP), ChEBI (chemische Entitäten), Uberon (Anatomie), der Experimental Factor Ontology (EFO), Mondo, NCIt und vielen weiteren. /v1/search?q=diabetes durchsucht Begriffe in allen Ontologien (oder beschränkt auf eine mit ontology=doid) und gibt für jeden Treffer die Bezeichnung, die OBO-ID (wie DOID:9351 oder GO:0008150), die Ontologie, die IRI und eine kurze Definition zurück. /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 gibt die Details eines einzelnen Begriffs zurück – seine Bezeichnung, Definition, IRI, Synonyme und ob er veraltet ist. /v1/ontologies listet die verfügbaren Ontologien mit ihrer ID, ihrem Titel, ihrer Beschreibung und der Anzahl der Begriffe auf. OBO-IDs sehen aus wie DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 oder CHEBI:15377. Ideal für biomedizinische Verarbeitung natürlicher Sprache, Datenannotation und -harmonisierung, Autovervollständigung über wissenschaftliche Terminologie sowie semantische und Wissensgraph-Werkzeuge. Daten von EMBL-EBI OLS (offen). Dies ist eine allgemeine Ontologie-/kontrollierte Vokabular-Suche, die viele Bereiche abdeckt – breiter als ein einzelner medizinischer Thesaurus wie MeSH.

api.oanor.com/ols-api

Häufig gestellte Fragen

Schnelle Antworten zu Preisen, Kontingenten und Integration.

Wie bekomme ich einen API-Key für BioSamples API?
Registriere dich kostenlos auf oanor.com, erstelle einen API-Key im Entwickler-Dashboard und rufe BioSamples API mit dem x-oanor-key-Header auf. Keine Kreditkarte für den Free-Tier nötig.
Wie hoch ist das Rate-Limit für BioSamples API?
Der Free-Tier erlaubt 1 Anfrage pro Sekunde. Bezahlte Pläne skalieren bis zu 50 Anfragen pro Sekunde im Mega-Tier. Harte Limits liefern HTTP 429 oberhalb der Quote — keine überraschenden Mehrkosten.
Was kostet BioSamples API?
BioSamples API hat einen Free-Tier mit 100 Calls / Monat. Bezahlte Pläne starten bei €6.00 / Monat mit höheren Kontingenten und schnelleren Rate-Limits.
Kann ich mein Abo jederzeit kündigen?
Ja. Pläne werden monatlich abgerechnet und du kannst jederzeit in deinem Billing-Dashboard kündigen. Keine Mindestlaufzeit und keine Kündigungsgebühr.
Ist BioSamples API DSGVO-konform?
Alle Anfragen an BioSamples API laufen über unser EU-Gateway. Dein Upstream-API-Key verlässt nie unseren Server und es werden keine personenbezogenen Daten an den Upstream-Anbieter weitergegeben außer der Anfrage selbst.

Wähle einen Endpoint aus der Liste links — Details und Playground erscheinen hier.

Code-Snippets

Registrieren, um einen API-Key zu bekommen, dann jeden Pfad unter deinem Slug aufrufen.

curl https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/biosamples-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

Bewertungen

Melde dich an, um zu bewerten.

Noch keine Bewertungen.

Diskussion

Stelle Fragen, teile Tipps, bekomme Antworten vom Anbieter und anderen Entwicklern. Öffentlich — jeder kann mitlesen.

Melde dich an, um zu schreiben oder zu antworten.

Anmelden

Neue Diskussion

/ 4000

📌 Angepinnt 🔒 Gesperrt

·

· ·

/ 4000

🔒 Diese Diskussion ist gesperrt — keine neuen Antworten möglich.

  • Noch keine Diskussionen — starte die erste.

Support

Privater 1:1-Support mit dem Anbieter — Abrechnungsfragen, Integrationsprobleme, Account-Themen. Nur du und das Anbieter-Team sehen diese Threads.

Melde dich an, um ein Support-Ticket zu öffnen.

Anmelden

Neues Ticket öffnen

Beschreibe wobei du Hilfe brauchst. Das Anbieter-Team bekommt eine Mail und antwortet auf der Ticket-Seite.

  • Noch keine Tickets für diese API.

Subscription aktiv — Calls können sofort starten.

Erste Anfrage senden —

Subscription aktiv — kopiere ein Snippet und kalibriere deinen ersten Call.