#metabolism

De KEGG moleculaire database als een API, aangedreven door de officiële KEGG REST-service. KEGG (de Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) verbindt genomen, chemie en ziekte. Haal elk KEGG-item op geparseerd naar JSON — een metabolische verbinding, KEGG Orthology-groep (KO), enzym (EC-nummer), reactie, module, medicijn, ziekte, glycaan, gen of pathway-kaart; doorzoek elke KEGG-database op naam; vermeld de items van een database; kruisverwijs items tussen databases (een gen naar zijn pathways, een pathway naar zijn verbindingen, een enzym naar zijn reacties); en converteer KEGG-identificaties naar en van externe naamruimten (NCBI Gene/Protein, UniProt, ChEBI, PubChem). Ideaal voor systeembiologie- en metabolomics-pijplijnen, enzym- en orthologie-mapping, medicijn- en ziekteonderzoek, gen-naar-pathway-annotatie en bioinformatica-ID-conversie. KEGG-IDs hebben een lettervoorvoegsel (C verbinding, K orthologie, D medicijn, H ziekte, M module, R reactie, G glycaan) of zijn organisme-gecodeerd (hsa mens, eco E. coli).

api.oanor.com/kegg-api

De Reactome pathway-kennisbank als API — de open, peer-reviewed database van biologische pathways en reacties, aangedreven door de officiële Reactome ContentService. Doorzoek de samengestelde archieven van pathways, reacties en moleculen; lees elke entiteit op basis van zijn Reactome stabiele ID (een pathway, reactie, complex of eiwit: naam, type, soort, compartimenten, samenvatting en ziekte-indicator); toon de gebeurtenissen (sub-pathways en reacties) in een pathway; toon de moleculen die deelnemen aan een pathway of reactie met hun referentie-identificatoren; verkrijg de top-level pathways voor elk modelorganisme; koppel een UniProt-eiwit aan de pathways waarin het deelneemt; en toon de ondersteunde soorten. Omvat mens en 15+ modelorganismen in metabolisme, signaaltransductie, celcyclus, immuunsysteem, ziekte en meer. Ideaal voor systeembiologie en bioinformatica-pijplijnen, pathway-verrijkings- en medicijndoelwit-tools, biomedische onderzoeksapps, lesmateriaal en levenswetenschap-chatbots.

api.oanor.com/reactome-api