UCSC Genoom API
De UCSC Genome Browser als API — referentiegenoomgegevens voor honderden soorten, van de gerenommeerde UCSC Genome Browser aan UC Santa Cruz. /v1/genomes toont de 220+ genoomassemblages die UCSC host, elk met zijn assemblage-ID (zoals hg38 voor mens, mm39 voor muis, danRer11 voor zebravis), organisme, beschrijving en gegevensbron. /v1/chromosomes?genome=hg38 retourneert de chromosomen en sequenties van een assemblage met hun grootte in basenparen, grootste eerst. /v1/sequence?genome=hg38&chrom=chrM&start=0&end=100 haalt de ruwe DNA-sequentie op van elk genomisch gebied (0-gebaseerde start, half-open einde; gebieden zijn beperkt tot 100.000 basen per aanroep). Assemblage-ID's komen van /v1/genomes en chromosoomnamen zien eruit als chr1, chrX of chrM. Ideaal voor bioinformatica-pijplijnen, genoomvisualisatie- en primerontwerptools, regio- en sequentieopzoekingen, vergelijkende genomica en onderwijs. Gegevens van de UCSC Genome Browser (gratis voor academisch, non-profit en persoonlijk gebruik). Dit is de genoomassemblages en ruwe referentiesequentie van de browser — te onderscheiden van gen-annotatie- en eiwitsequentiedatabases zoals Ensembl, UniProt en ENA.
api.oanor.com/ucsc-api
