A gene's constraint & location
API · /gnomad-api
gnomAD API
Populatiegenetica als API, aangedreven door het Broad Institute's gnomAD (Genome Aggregation Database) — allelfrequenties en genconstraint geaggregeerd uit meer dan 800.000 menselijke exomen en genomen. Zoek de constraintscores van een gen (pLI, LOEUF, waargenomen versus verwacht verlies-van-functie, missense Z) en genomische locatie; verkrijg de allelfrequenties van een variant uitgesplitst naar afkomstpopulatie (Afrikaans/Afro-Amerikaans, Gemengd Amerikaans, Asjkenazisch Joods, Oost-Aziatisch, Fins, Niet-Fins Europees, Zuid-Aziatisch, Midden-Oosters…) in zowel genoom- als exoomcallsets, met rsID's, homozygoottellingen en voorspelde consequentie; zoek genen op symbool; lees de constraint van een transcript; en maak een lijst van de varianten in een klein genomisch gebied. Ondersteunt GRCh38 en GRCh37 en de gnomAD v4/v3/v2 datasets. Ideaal voor klinische en populatiegenetica, variantinterpretatie en -prioritering, onderzoek naar zeldzame ziekten en farmacogenomica, en bioinformatica-pijplijnen. Variant-ID's zijn chrom-pos-ref-alt.
API-gezondheid
gezond- Uptime
- 100.00%
- Serversondes · 24 uur
- Gem. latentie
- 191 ms
- Serversondes · 24 uur
- Abonnees
- 3,757
- actief
- Totaal aantal oproepen
- 18
- laatste 7 dagen
Prijzen
Kies een niveau: maandelijks gefactureerd en op elk gewenst moment opzegbaar.
Free
Vrij
- 510 oproepen / maand
- 2 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 510 oproepen/maand
- 2 verzoeken/sec
- Genen, varianten & regio's
- Geen creditcard
Starter
€7.35 /maand
- 19,000 oproepen / maand
- 6 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 19k oproepen/maand
- 6 verzoeken/sec
- Allelfrequenties & constraint
- E-mailondersteuning
Pro
€21.80 /maand
- 88,500 oproepen / maand
- 15 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 88,5k oproepen/maand
- 15 verzoeken/sec
- Variantinterpretatie
- Prioritaire ondersteuning
Mega
€59.80 /maand
- 342,000 oproepen / maand
- 40 verzoeken / tweede
- Hard cap (429 boven quotum, geen overschrijding)
- 342k oproepen/maand
- 40 verzoeken/sec
- Populatiegenetica met hoge doorvoer
- Toegewijde SLA
Gebouwd door
Gerelateerd APIs
Andere APIs met overlappende tags.
Structural Variants API
Menselijke genomische structurele variatie als een API — aangedreven door NCBI dbVar, het archief van structurele varianten (SVs): copy-number varianten (CNVs), grote deleties, duplicaties, inserties, inversies en translocaties, typisch groter dan 50 basenparen. Dit is de structurele tegenhanger van single-nucleotide variant databases: zoek naar structurele varianten die een gen overlappen (of via vrije tekst) en verkrijg de dbVar-accessie van elke variant, de studie waar deze vandaan komt, het type, de genen die het overlapt, de genomische plaatsing op GRCh38 en de klinische significantie; zoek vervolgens elke variant op voor het volledige record — plaatsingen op zowel GRCh37- als GRCh38-assemblages, varianttype, genen, klinische significantie, studietype, methoden en varianttellingen. Van BRCA1 CNVs tot Cri-du-chat deleties, het is ideaal voor genomica, cytogenetica, zeldzame ziekten en bioinformatica werk. Een structurele variatie / CNV-bron — anders dan klinische single-nucleotide variant interpretatie (ClinVar), populatie allelfrequenties (gnomAD) en eigenschapsassociaties (GWAS). Open data van NCBI dbVar (publiek domein).
api.oanor.com/dbvar-api
ClinVar API
ClinVar als API, aangedreven door de US National Library of Medicine via NCBI E-utilities. ClinVar is het openbare archief van de relaties tussen menselijke genetische varianten en gezondheid, waarbij de klinische betekenis (interpretatie) van elke variant wordt vastgelegd — of deze pathogeen, waarschijnlijk pathogeen, van onzekere betekenis, waarschijnlijk goedaardig of goedaardig is — samen met de aandoeningen waarmee deze geassocieerd is. /v1/search?gene=BRCA1 doorzoekt ClinVar op gensymbool, of op vrije tekst met q= (bijv. een ziekte of HGVS-expressie), en retourneert het totale aantal overeenkomende varianten en een lijst met ClinVar-variant-ID's. /v1/variant?id=4852102 retourneert een samenvatting van een variant: de ClinVar-toegang (VCV…), titel, varianttype, de variant- en cDNA-namen, de klinische classificatie en beoordelingsstatus, de geassocieerde aandoening(en), het/de gen(en) en primaire gen, het chromosoom en de locatie, de eiwitverandering en de moleculaire consequentie, plus een link naar de ClinVar-record. Haal een variant-ID op van /v1/search en haal vervolgens de details op. Ideaal voor klinisch-genomische en variant-annotatiepijplijnen, zeldzame-ziekte- en genetische-counselingtools, en onderzoeksdashboards. Gegevens van NCBI ClinVar (publiek domein). Dit is klinische variantinterpretatie — anders dan populatie-allelfrequentiedatabases (zoals gnomAD) en eiwit-/sequentiedatabases. Houd verzoekfrequenties bescheiden onder NCBI fair-use.
api.oanor.com/clinvar-api
Ensembl API
De Ensembl-genoomdatabase als een API, aangedreven door de officiële Ensembl REST-service van EMBL-EBI. Zoek elk gen op via symbool of Ensembl stabiel ID voor zijn biotype, genomische locatie, streng, beschrijving en transcripten; los elk kenmerk (gen, transcript, exon) op via stabiel ID; haal externe database-verwijzingen op; haak sequentievarianten op via rsID met hun allelen, meest ernstige consequentie, frequentie van het minst voorkomende allel, klinische significantie en genomische mapping; maak een lijst van de genen, transcripten, exonen, variaties of herhalingen die overlappen met een genomische regio; verkrijg genomische, cDNA, CDS of eiwitsequenties via ID; en lees genoomassemblage-metadata inclusief het karyotype en chromosoomlengtes. Voor mens, muis en 300+ gewervelde soorten. Ideaal voor bioinformatica-pijplijnen, genoomviewers en variantannotatietools, genetisch onderzoeksapps, klinisch-genomische dashboards en levenswetenschap-chatbots.
api.oanor.com/ensembl-api
Genome Assemblies API
Referentie-genoomassemblages als een API — aangedreven door NCBI Assembly, het register van genoomversies voor organismen in de hele levensboom. Zoek assemblages op organisme (of vrije tekst) en raadpleeg de metadata van elke assemblage: de accession (GCF_… RefSeq of GCA_… GenBank), naam (bijv. GRCh38.p14), organisme en taxon-id, assemblage-niveau (volledig genoom, chromosoom, scaffold of contig), contiguïteitsstatistieken (contig- en scaffold-N50), sequentiedekking, RefSeq-categorie, UCSC- en Ensembl-namen, de indienende organisatie, releasedatum en FTP-downloadpaden. Van het menselijke referentiegenoom tot elk gesequenced microbe, plant of dier, het verandert het genoomassemblage-register in een schone zoek-en-haal API. Een genoomassemblage-register — te onderscheiden van sequentie (ENA), genoomannotatie (Ensembl), variant (ClinVar, dbVar) en genexpressie (GEO) databases. Open data van NCBI Assembly (publiek domein).
api.oanor.com/genomes-api
Veelgestelde vragen
Snelle antwoorden over prijzen, quota's en integratie.
Hoe krijg ik een API-sleutel voor gnomAD API?
Wat is de rate-limit voor gnomAD API?
Wat kost gnomAD API?
Kan ik mijn abonnement op elk moment opzeggen?
Voldoet gnomAD API aan de AVG?
Kies een eindpunt uit de lijst aan de linkerkant om de details ervan te bekijken en het te proberen.
Codefragmenten
Meld u aan om een API-sleutel te krijgen en roep vervolgens een pad onder uw naaktslak aan.
curl https://api.oanor.com/gnomad-api/SOME_PATH \
-H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/gnomad-api/SOME_PATH", {
headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/gnomad-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
"https://api.oanor.com/gnomad-api/SOME_PATH",
headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())
Beoordelingen
Log in om te beoordelen.
Nog geen beoordelingen.
Discussie
Stel vragen, deel tips, krijg antwoorden van de aanbieder en andere ontwikkelaars. Openbaar — iedereen kan meelezen.
Meld je aan om te schrijven of te antwoorden.
InloggenNieuwe discussie
·
-
Antwoord van aanbieder
🔒 Deze discussie is vergrendeld — geen nieuwe antwoorden.
-
·
- Nog geen discussies — start de eerste.
Support
Privé 1:1-support met de aanbieder — facturatie, integratie, account. Alleen jij en het aanbiedersteam zien deze threads.
Meld je aan om een supportticket te openen.
InloggenNieuw ticket openen
Beschrijf waar je hulp bij nodig hebt. Het team krijgt een mail en antwoordt op de ticketpagina.
-
·
Urgent - Nog geen tickets voor deze API.