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API · /opentargets-api

API Open Targets

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Associations cible médicamenteuse–maladie sous forme d'API, propulsées par la plateforme Open Targets. Open Targets intègre la génétique humaine, la génomique, la transcriptomique, les médicaments connus, les modèles animaux et la littérature scientifique pour évaluer systématiquement la force de l'association entre une cible (gène/protéine) et une maladie — les preuves qui sous-tendent la découverte moderne de médicaments. Recherchez parmi les cibles, les maladies et les médicaments ; consultez une cible pour son symbole approuvé, son biotype, sa fonction, sa localisation génomique et ses identifiants UniProt ainsi que les maladies auxquelles elle est le plus fortement associée et leurs scores d'association globaux ; consultez une maladie pour sa description, ses domaines thérapeutiques et ses principales cibles associées avec scores ; et consultez un médicament pour sa modalité, son stade clinique maximal, ses noms commerciaux, ses synonymes et ses mécanismes d'action. Idéal pour les pipelines de découverte de médicaments et d'identification de cibles, la recherche par domaine thérapeutique, la science des données biomédicales et les outils de veille pharmaceutique. Les identifiants de cibles sont les identifiants de gènes Ensembl, les identifiants de maladies sont les identifiants EFO/MONDO/Orphanet, les identifiants de médicaments sont les identifiants ChEMBL. Les données sont ouvertes (CC0).

#open-targets #drug-discovery #target-disease #genetics #therapeutics #bioinformatics #life-sciences
api.oanor.com/opentargets-api
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/api/opentargets-api/openapi.json
/api/opentargets-api/llms.txt

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Connexes APIs

Autres APIs avec des balises qui se chevauchent.

API ChEMBL

La base de données ChEMBL de molécules bioactives sous forme d'API — la base de connaissances manuellement organisée de l'EBI sur les composés de type médicamenteux et leur activité biologique, alimentée par l'API officielle des données ChEMBL. Recherchez un composé par son identifiant ChEMBL pour sa phase de développement, sa structure chimique (SMILES, InChIKey), sa formule moléculaire et son poids, ses propriétés calculées (ALogP, surface polaire, donneurs/accepteurs de liaisons hydrogène, violations de la règle de cinq, QED de type médicament) et ses synonymes ; recherchez des composés par nom ; lisez une cible biologique avec son organisme et ses composants protéiques UniProt ; listez les mécanismes d'action d'un médicament ; listez ses indications approuvées et expérimentales (termes MeSH et EFO avec phase de développement) ; et extrayez ses bioactivités mesurées (IC50, Ki, EC50, puissance…) avec valeurs, unités, scores pChEMBL, essais et cibles. Idéal pour les pipelines de découverte de médicaments et de chémoinformatique, les outils de chimie médicinale et de pharmacologie, la recherche d'identification de cibles et de SAR, et les applications en sciences de la vie.

api.oanor.com/chembl-api

API de scores polygéniques

Scores polygéniques (de risque) sous forme d'API — propulsée par le NHGRI-EBI PGS Catalog, la base de données ouverte des scores polygéniques publiés : combinaisons pondérées de variants génétiques utilisées pour estimer la prédisposition génétique d'une personne à un trait ou une maladie. Recherchez des traits par nom pour trouver leurs identifiants d'ontologie, listez chaque score polygénique développé pour un trait, et lisez les métadonnées complètes d'un score — les traits rapportés et mappés (EFO/MONDO), le nombre de variants dans le score, la méthode de développement, la version du génome, la distribution d'ascendance des échantillons sur lesquels il a été construit et évalué, la publication associée (titre, revue, date, identifiant PubMed), la date de publication, la licence et un lien direct vers le fichier de scoring. Du cancer du sein et de la maladie coronarienne au diabète de type 2 et à l'IMC, il est idéal pour la génétique statistique, la génomique, la recherche en prédiction de risque et les outils bioinformatiques. Une ressource de scores polygéniques / prédiction de risque génétique — distincte des études d'association à variant unique (GWAS Catalog), des fréquences alléliques de population (gnomAD) et de l'interprétation clinique des variants (ClinVar). Données ouvertes du NHGRI-EBI PGS Catalog (CC BY 4.0).

api.oanor.com/pgs-api

API du catalogue GWAS

Associations de traits génétiques humains sous forme d'API — propulsée par le catalogue GWAS NHGRI-EBI, la référence organisée des études d'association pangénomiques publiées. Elle répond à la question centrale de la génétique statistique : quels variants génétiques (SNP) sont associés à quels traits et maladies, et avec quelle force. Recherchez un SNP pour obtenir sa classe fonctionnelle, sa localisation génomique et les gènes cartographiés ; extrayez chaque association de trait rapportée pour celui-ci — le trait, la valeur p, la taille d'effet (odds ratio ou bêta), l'allèle à risque et sa fréquence, et les gènes rapportés par l'auteur ; et lisez l'étude derrière la preuve — trait, tailles d'échantillon, ascendances, technologie de génotypage et la publication (identifiant PubMed, auteurs, revue, date). Du diabète de type 2 et la maladie de Crohn au lupus érythémateux disséminé et à des centaines de milliers d'associations, elle est idéale pour la génomique, la bioinformatique, la génétique statistique et les outils de recherche biomédicale. Une base de preuves d'association génétique publiée — distincte des fréquences alléliques de population (gnomAD), de l'interprétation des variants cliniques (ClinVar) et de l'annotation du génome (Ensembl). Données ouvertes du catalogue GWAS NHGRI-EBI (EMBL-EBI).

api.oanor.com/gwas-api

API ClinVar

ClinVar en tant qu'API, alimentée par la Bibliothèque nationale de médecine des États-Unis via les E-utilities du NCBI. ClinVar est l'archive publique des relations entre les variants génétiques humains et la santé, enregistrant la signification clinique (interprétation) de chaque variant — qu'il soit pathogène, probablement pathogène, de signification incertaine, probablement bénin ou bénin — ainsi que les conditions auxquelles il est associé. /v1/search?gene=BRCA1 recherche dans ClinVar par symbole de gène, ou par texte libre avec q= (par exemple une maladie ou une expression HGVS), renvoyant le nombre total de variants correspondants et une liste d'identifiants de variants ClinVar. /v1/variant?id=4852102 renvoie un résumé d'un variant : son accession ClinVar (VCV…), son titre, son type de variant, les noms du variant et de l'ADNc, la classification clinique et le statut de révision, la ou les conditions associées, le ou les gènes et le gène principal, le chromosome et l'emplacement, le changement protéique et la conséquence moléculaire, ainsi qu'un lien vers l'enregistrement ClinVar. Obtenez un identifiant de variant depuis /v1/search, puis récupérez ses détails. Idéal pour les pipelines de génomique clinique et d'annotation de variants, les outils de maladies rares et de conseil génétique, et les tableaux de bord de recherche. Données provenant de NCBI ClinVar (domaine public). Il s'agit d'une interprétation de variants cliniques — distincte des bases de données de fréquence allélique de population (telles que gnomAD) et des bases de données de protéines/séquences. Veuillez maintenir des taux de requêtes modestes conformément à l'utilisation équitable du NCBI.

api.oanor.com/clinvar-api

Questions fréquentes

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Comment obtenir une clé API pour API Open Targets ?
Inscris-toi gratuitement sur oanor.com, génère une clé API depuis le tableau de bord développeur et appelle API Open Targets avec l'en-tête x-oanor-key. Aucune carte bancaire requise pour le forfait gratuit.
Quelle est la limite de débit de API Open Targets ?
Le forfait gratuit permet 1 requête par seconde. Les forfaits payants montent jusqu'à 50 requêtes par seconde sur le palier Mega. Les limites strictes renvoient HTTP 429 au-delà du quota — sans frais surprises.
Combien coûte API Open Targets ?
API Open Targets dispose d'un forfait gratuit avec 100 appels / mois. Les forfaits payants commencent à €7.45 / mois avec des quotas plus élevés et des limites de débit plus rapides.
Puis-je résilier mon abonnement à tout moment ?
Oui. Les abonnements sont facturés mensuellement et tu peux résilier à tout moment depuis le tableau de bord de facturation. Aucun engagement à long terme ni frais de résiliation.
API Open Targets est-il conforme au RGPD ?
Toutes les requêtes vers API Open Targets transitent par notre passerelle européenne. Ta clé API upstream ne quitte jamais notre serveur et aucune donnée personnelle n'est partagée avec le fournisseur upstream au-delà de la requête envoyée.

Choisissez un point de terminaison dans la liste de gauche pour voir ses détails et essayez-le.

Extraits de code

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curl https://api.oanor.com/opentargets-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/opentargets-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/opentargets-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/opentargets-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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