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MeSH API

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Medical Subject Headings (MeSH) als API, betrieben durch den offiziellen MeSH-RDF-Dienst der U.S. National Library of Medicine. MeSH ist der maßgebliche kontrollierte Wortschatz der NLM zur Indexierung der biomedizinischen Literatur in PubMed – ein kuratierter Thesaurus von Krankheiten, Anatomie, Chemikalien und Arzneimitteln, Organismen, Psychiatrie und Psychologie, analytischen und diagnostischen Techniken, Gesundheitsversorgung und mehr. Jedes Konzept ist ein „Deskriptor“ mit einer stabilen eindeutigen ID (z. B. D003920), einem bevorzugten Namen, einer Reihe von Eintragsbegriffen (Synonyme und Laienvarianten) und einer Liste zulässiger Qualifikatoren (Unterüberschriften wie Arzneimitteltherapie, Diagnose oder Epidemiologie). /v1/search?q=diabetes durchsucht Deskriptoren nach ihrem bevorzugten Namen (Übereinstimmung=enthält, exakt oder beginnt mit) und gibt die ID und Bezeichnung jedes Deskriptors zurück. /v1/term?q=heart attack löst einen Laienbegriff oder ein Synonym in den zugehörigen MeSH-Deskriptor(en) auf, sodass umgangssprachliche Sprache auf den kontrollierten Wortschatz abgebildet wird (heart attack zu Myocardial Infarction). /v1/descriptor?id=D003920 gibt den vollständigen Datensatz eines Deskriptors zurück – seinen bevorzugten Namen, alle Eintragsbegriffe (Synonyme), die zulässigen Qualifikatoren und Siehe-auch-Querverweise, mit einem Link zum MeSH-Browser. Ideal für biomedizinische Verarbeitung natürlicher Sprache und Text Mining, Tagging und Indexierung von Literatur, Erstellung klinischer und forschungsbezogener Suchwerkzeuge, Autovervollständigung über medizinische Terminologie und Abbildung von Freitext auf eine Standardontologie. Daten von NLM MeSH (Public Domain). Für arzneimittelspezifische klinische Nomenklatur und Wechselwirkungen siehe die RxNorm API.

#mesh #medical-vocabulary #nlm #biomedical #ontology #pubmed #terminology
api.oanor.com/mesh-api
API-Key holen Im Playground testen → Anbieter kontaktieren

Maschinenlesbare Spezifikation, damit KI-Agenten diese API integrieren können.

/api/mesh-api/openapi.json
/api/mesh-api/llms.txt

Discovery: GET /api/index.json listet alle APIs.

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OLS Ontology API

Der EMBL-EBI Ontology Lookup Service (OLS) als API – ein zentraler Zugangspunkt zu mehr als 280 biomedizinischen und wissenschaftlichen Ontologien und kontrollierten Vokabularen an einem Ort: der Gene Ontology (GO), der Human Disease Ontology (DOID), der Human Phenotype Ontology (HP), ChEBI (chemische Entitäten), Uberon (Anatomie), der Experimental Factor Ontology (EFO), Mondo, NCIt und vielen weiteren. /v1/search?q=diabetes durchsucht Begriffe in allen Ontologien (oder beschränkt auf eine mit ontology=doid) und gibt für jeden Treffer die Bezeichnung, die OBO-ID (wie DOID:9351 oder GO:0008150), die Ontologie, die IRI und eine kurze Definition zurück. /v1/term?ontology=doid&id=DOID:9351 gibt die Details eines einzelnen Begriffs zurück – seine Bezeichnung, Definition, IRI, Synonyme und ob er veraltet ist. /v1/ontologies listet die verfügbaren Ontologien mit ihrer ID, ihrem Titel, ihrer Beschreibung und der Anzahl der Begriffe auf. OBO-IDs sehen aus wie DOID:9351, GO:0008150, HP:0000118 oder CHEBI:15377. Ideal für biomedizinische Verarbeitung natürlicher Sprache, Datenannotation und -harmonisierung, Autovervollständigung über wissenschaftliche Terminologie sowie semantische und Wissensgraph-Werkzeuge. Daten von EMBL-EBI OLS (offen). Dies ist eine allgemeine Ontologie-/kontrollierte Vokabular-Suche, die viele Bereiche abdeckt – breiter als ein einzelner medizinischer Thesaurus wie MeSH.

api.oanor.com/ols-api

Cellosaurus API

Cellosaurus als API, bereitgestellt vom SIB Swiss Institute of Bioinformatics – die Referenz-Enzyklopädie für Zelllinien, die in der biomedizinischen Forschung verwendet werden. Mit mehr als 150.000 Einträgen, die Krebszelllinien, Hybridome, induzierte pluripotente Stammzellen und Linien von Hunderten von Arten umfassen, ist Cellosaurus der maßgebliche Katalog, den Forscher verwenden, um die Zelllinien hinter veröffentlichten Experimenten zu identifizieren und zu validieren. Durchsuchen Sie die Zelllinien nach Name oder Stichwort und erhalten Sie für jede Linie die Cellosaurus-Accession (CVCL_…), Name, Kategorie, Spezies und Krankheit; und lesen Sie den vollständigen Datensatz einer Zelllinie – ihren Namen und Synonyme, Kategorie (z. B. Krebszelllinie, Hybridom, Stammzelle), Spezies mit NCBI-Taxonomie-ID, Geschlecht, Alter, die Krankheit, von der sie stammt, mit NCIt/Ontologie-Identifikatoren, das Gewebe oder die anatomische Herkunftsstelle, ihre Elternzelllinie und die Anzahl der abgeleiteten Tochterlinien, die Anzahl der Literaturreferenzen und die vielen Querverweise (zu ATCC, DSMZ, ECACC, Wikidata und mehr), relevante Webseiten und – entscheidend für die Reproduzierbarkeit der Forschung – ob die Linie als PROBLEMATISCH markiert ist, was bedeutet, dass sie falsch identifiziert oder kreuzkontaminiert wurde, zusammen mit den erklärenden Anmerkungen. Ideal für Laborkontrolle und Zelllinienauthentifizierung, biomedizinische und Krebsforschung, Datenkuratierung und Reproduzierbarkeitsprüfungen. Accessions sehen aus wie CVCL_0030 (HeLa). Daten von Cellosaurus (CC-BY 4.0).

api.oanor.com/cellosaurus-api

Europe PMC API

Europe PMC als API, bereitgestellt von EMBL-EBI – ein offenes Repository für biomedizinische und lebenswissenschaftliche Literatur mit über 45 Millionen Abstracts und über 9 Millionen Volltextartikeln aus PubMed, PubMed Central, Preprint-Servern (bioRxiv und medRxiv), Patenten und Agricola. Durchsuchen Sie die Literatur mit einer umfangreichen Feldsyntax (nach Autor, Titel, Zeitschrift, MeSH-Begriff, Veröffentlichungsjahr oder Open-Access-Status), ordnen Sie Ergebnisse nach Relevanz, Datum oder Zitationsanzahl und beschränken Sie sich optional nur auf Preprints; lesen Sie die vollständigen Metadaten und Abstracts eines Artikels – seine Autoren, Zeitschrift, Band und Seiten, DOI, PubMed- und PMC-IDs, MeSH-Begriffe, Schlüsselwörter, Förderzuschüsse und Links zum freien Volltext; und durchlaufen Sie das Zitationsnetzwerk in beide Richtungen: die Artikel, die ein bestimmtes Papier zitieren, und die Werke, auf die dieses Papier selbst verweist. Zusammen ermöglichen diese Funktionen die Messung wissenschaftlicher Wirkung, die Erstellung von Zitationsgraphen, die Verfolgung eines Forschungsthemas über Preprints und begutachtete Artikel hinweg sowie die Bereitstellung von Belegen für bibliometrische, systematische Überprüfungs- und Forschungsintelligenz-Tools. Artikelkennungen sind PubMed-IDs (numerisch), PMC-IDs (PMC…) oder Preprint-IDs (PPR…); die Quelle ist standardmäßig PubMed (MED). Daten von EMBL-EBI Europe PMC.

api.oanor.com/europepmc-api

Ontology API

Biomedizinische Ontologien als API, unterstützt durch den EBI Ontology Lookup Service (OLS). Durchsuchen Sie über 280 kuratierte Ontologien — Krankheiten (MONDO), menschliche Phänotypen (HP), die Gene Ontology (GO), Anatomie (UBERON), Zelltypen (CL), Chemie (ChEBI), experimentelle Faktoren (EFO), den NCI Thesaurus und viele mehr — um Begriffe nach Namen zu finden; durchstöbern Sie den vollständigen Ontologiekatalog mit Versionen und Begriffszahlen; lesen Sie jeden Begriff für seine Definition, exakte Synonyme, OBO-ID, IRI und Veraltungsstatus; und durchlaufen Sie die Klassenhierarchie über die direkten Eltern- und Kindknoten eines Begriffs. Ideal für klinische Datenharmonisierung und -kodierung, biomedizinische Suche und Autovervollständigung, Wissensgraphenanreicherung, Annotation und Kuratierungspipelines sowie Forschungs- und EHR-Anwendungen, die standardisierte Vokabulare benötigen. OBO-IDs sehen aus wie MONDO:0005148 oder GO:0008150.

api.oanor.com/ontology-api

Häufig gestellte Fragen

Schnelle Antworten zu Preisen, Kontingenten und Integration.

Wie bekomme ich einen API-Key für MeSH API?
Registriere dich kostenlos auf oanor.com, erstelle einen API-Key im Entwickler-Dashboard und rufe MeSH API mit dem x-oanor-key-Header auf. Keine Kreditkarte für den Free-Tier nötig.
Wie hoch ist das Rate-Limit für MeSH API?
Der Free-Tier erlaubt 1 Anfrage pro Sekunde. Bezahlte Pläne skalieren bis zu 50 Anfragen pro Sekunde im Mega-Tier. Harte Limits liefern HTTP 429 oberhalb der Quote — keine überraschenden Mehrkosten.
Was kostet MeSH API?
MeSH API hat einen Free-Tier mit 100 Calls / Monat. Bezahlte Pläne starten bei €6.50 / Monat mit höheren Kontingenten und schnelleren Rate-Limits.
Kann ich mein Abo jederzeit kündigen?
Ja. Pläne werden monatlich abgerechnet und du kannst jederzeit in deinem Billing-Dashboard kündigen. Keine Mindestlaufzeit und keine Kündigungsgebühr.
Ist MeSH API DSGVO-konform?
Alle Anfragen an MeSH API laufen über unser EU-Gateway. Dein Upstream-API-Key verlässt nie unseren Server und es werden keine personenbezogenen Daten an den Upstream-Anbieter weitergegeben außer der Anfrage selbst.

Wähle einen Endpoint aus der Liste links — Details und Playground erscheinen hier.

Code-Snippets

Registrieren, um einen API-Key zu bekommen, dann jeden Pfad unter deinem Slug aufrufen.

curl https://api.oanor.com/mesh-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/mesh-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/mesh-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/mesh-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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