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API · /kegg-api

KEGG API

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KEGG分子数据库作为API，由官方KEGG REST服务提供支持。KEGG（京都基因与基因组百科全书）连接基因组、化学和疾病。获取任何KEGG条目并解析为JSON——代谢化合物、KEGG直系同源组（KO）、酶（EC编号）、反应、模块、药物、疾病、聚糖、基因或通路图；按名称搜索任何KEGG数据库；列出数据库的条目；在数据库之间交叉链接条目（基因到其通路、通路到其化合物、酶到其反应）；以及将KEGG标识符与外部命名空间（NCBI Gene/Protein、UniProt、ChEBI、PubChem）相互转换。非常适合系统生物学和代谢组学流程、酶和直系同源映射、药物和疾病研究、基因到通路注释以及生物信息学标识符转换。KEGG ID以字母为前缀（C化合物、K直系同源、D药物、H疾病、M模块、R反应、G聚糖）或按生物体编码（hsa人类、eco大肠杆菌）。

#kegg #molecular-biology #compounds #orthology #enzymes #metabolism #bioinformatics
api.oanor.com/kegg-api
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/api/kegg-api/openapi.json
/api/kegg-api/llms.txt

Individuazione: GET /api/index.json elenca ogni API.

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Chemistry API

Chemical compound data as an API, powered by NIH PubChem (>100 million compounds). Look up any compound by common name, PubChem CID or SMILES and get its molecular formula, molecular and exact mass, IUPAC name, canonical SMILES, InChI and InChIKey, plus physicochemical properties (XLogP, TPSA, formal charge, hydrogen-bond donor/acceptor counts, rotatable bonds, heavy-atom count). List a compound's synonyms and trade/registry names, or resolve a name to PubChem CIDs. Ideal for cheminformatics, lab software, education, drug-discovery tooling and scientific data pipelines.

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Reactome API

La base de conocimiento de rutas Reactome como API — la base de datos abierta y revisada por pares de rutas y reacciones biológicas, impulsada por el Reactome ContentService oficial. Busque en el archivo curado de rutas, reacciones y moléculas; lea cualquier entidad por su ID estable de Reactome (una ruta, reacción, complejo o proteína: nombre, tipo, especie, compartimentos, resumen y bandera de enfermedad); enumere los eventos (sub-rutas y reacciones) contenidos en una ruta; enumere las moléculas que participan en una ruta o reacción con sus identificadores de referencia; obtenga las rutas de nivel superior para cualquier organismo modelo; asigne una proteína UniProt a las rutas en las que participa; y enumere las especies compatibles. Cubre humanos y más de 15 organismos modelo en metabolismo, transducción de señales, ciclo celular, sistema inmunológico, enfermedades y más. Ideal para pipelines de biología de sistemas y bioinformática, herramientas de enriquecimiento de rutas y dianas farmacológicas, aplicaciones de investigación biomédica, recursos educativos y chatbots de ciencias de la vida.

api.oanor.com/reactome-api

Genome Assemblies API

Reference genome assemblies as an API — powered by NCBI Assembly, the registry of genome builds for organisms across the tree of life. Search assemblies by organism (or free text) and look up any assembly's metadata: its accession (GCF_… RefSeq or GCA_… GenBank), name (e.g. GRCh38.p14), organism and taxon id, assembly level (complete genome, chromosome, scaffold or contig), contiguity statistics (contig and scaffold N50), sequencing coverage, RefSeq category, UCSC and Ensembl names, the submitting organization, release date and FTP download paths. From the human reference genome to any sequenced microbe, plant or animal, it turns the genome-assembly registry into a clean search-and-fetch API. A genome-assembly registry — distinct from sequence (ENA), genome annotation (Ensembl), variant (ClinVar, dbVar) and gene-expression (GEO) databases. Open data from NCBI Assembly (public domain).

api.oanor.com/genomes-api

Gene Expression API

Functional-genomics experiments as an API — powered by NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), the largest public repository of gene-expression data. GEO archives expression series and curated datasets from microarray and high-throughput-sequencing experiments across every organism. Search experiments by keyword and optionally by organism, and look up any series or dataset to get its metadata: title, summary, assay type (expression profiling by array or by sequencing), organism, number of samples, platform and the publication behind it. From β-cell stress studies to cancer transcriptomics across human and mouse, it turns the GEO archive into a simple search-and-fetch API for transcriptomics, bioinformatics and research-data discovery. A gene-expression / functional-genomics dataset repository — distinct from sequence (ENA), variant (ClinVar, dbVar), structure (PDB) and ontology databases. Open data from NCBI GEO (public domain).

api.oanor.com/geodatasets-api

Domande frequenti

Risposte rapide su prezzi, quote e integrazione.

Come ottengo una chiave API per KEGG API?
Registrati gratuitamente su oanor.com, genera una chiave API dalla dashboard sviluppatore e chiama KEGG API con l'header x-oanor-key. Nessuna carta di credito richiesta per il piano gratuito.
Qual è il limite di velocità di KEGG API?
Il piano gratuito consente 1 richiesta al secondo. I piani a pagamento arrivano fino a 50 richieste al secondo nel piano Mega. I limiti rigorosi restituiscono HTTP 429 oltre la quota — nessuna spesa imprevista.
Quanto costa KEGG API?
KEGG API ha un piano gratuito con 100 chiamate / mese. I piani a pagamento partono da €7.25 / mese con quote più alte e limiti di velocità più rapidi.
Posso cancellare l'abbonamento in qualsiasi momento?
Sì. I piani sono fatturati mensilmente e puoi cancellare in qualsiasi momento dalla dashboard di fatturazione. Nessun contratto a lungo termine e nessuna penale di cancellazione.
KEGG API è conforme al GDPR?
Tutte le richieste a KEGG API passano attraverso il nostro gateway in UE. La tua chiave upstream non lascia mai il nostro server e nessun dato personale viene condiviso con il fornitore upstream oltre alla richiesta inviata.

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curl https://api.oanor.com/kegg-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/kegg-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/kegg-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/kegg-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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