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API · /mgnify-api

API de MGnify

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MGnify como API, impulsado por EMBL-EBI, el recurso gratuito más grande del mundo para el análisis y archivo de datos de secuenciación del microbioma, y la hermana metagenómica de PRIDE (proteómica) y MetaboLights (metabolómica). MGnify alberga decenas de miles de estudios públicos de metagenómica y metabarcoding que abarcan el microbioma intestinal humano, ambientes marinos y de agua dulce, suelos, aguas residuales, el entorno construido y comunidades asociadas a hospedadores. Busque estudios por palabra clave, obteniendo el acceso de MGnify de cada estudio (MGYS...), nombre, resumen, bioma, recuento de muestras y el BioProject de secuenciación de origen; lea los metadatos completos de un estudio, incluidos su nombre y resumen, clasificación del bioma, número de muestras, centro de envío, estado público, origen de los datos y fecha de última actualización; y navegue por el árbol de clasificación de biomas estilo GOLD, desde raíz:Asociado al hospedador:Humano:Sistema digestivo hasta raíz:Ambiental:Acuático:Marino, con recuentos de muestras y estudios por bioma, para descubrimiento por entorno. Ideal para investigación del microbioma y genómica ambiental, reutilización de conjuntos de datos y metaanálisis, pipelines de bioinformática y enseñanza. Los accesos de estudio se ven como MGYS00006862. Datos de EMBL-EBI MGnify.

#mgnify #metagenomics #microbiome #datasets #environmental-genomics #bioinformatics #life-sciences
api.oanor.com/mgnify-api
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Especificaciones legibles por máquina para que los agentes de IA puedan integrar este API.

/api/mgnify-api/openapi.json
/api/mgnify-api/llms.txt

Descubrimiento: GET /api/index.json enumera todos los API.

salud API

degradada
tiempo de actividad
87.50%
Sondas del servidor · 24h
Latencia promedio
422 ms
Sondas del servidor · 24h
Suscriptoras
3,355
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últimos 7 días
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Relacionado APIs

Otros APIs con etiquetas superpuestas.

API de Expresión Génica

Experimentos de genómica funcional como una API — impulsada por NCBI GEO (Gene Expression Omnibus), el repositorio público más grande de datos de expresión génica. GEO archiva series de expresión y conjuntos de datos curados de experimentos de microarreglos y secuenciación de alto rendimiento en todos los organismos. Busque experimentos por palabra clave y opcionalmente por organismo, y consulte cualquier serie o conjunto de datos para obtener sus metadatos: título, resumen, tipo de ensayo (perfil de expresión por microarreglo o por secuenciación), organismo, número de muestras, plataforma y la publicación detrás de él. Desde estudios de estrés de células β hasta transcriptómica del cáncer en humanos y ratones, convierte el archivo GEO en una API simple de búsqueda y obtención para transcriptómica, bioinformática y descubrimiento de datos de investigación. Un repositorio de conjuntos de datos de expresión génica / genómica funcional — distinto de las bases de datos de secuencia (ENA), variantes (ClinVar, dbVar), estructura (PDB) y ontología. Datos abiertos de NCBI GEO (dominio público).

api.oanor.com/geodatasets-api

API de DataCite

DataCite como API: el registro global de DOIs (Identificadores de Objetos Digitales) para resultados de investigación. Mientras que Crossref registra DOIs para artículos de revistas, DataCite registra y describe DOIs para datos de investigación, software, muestras, disertaciones, preprints, modelos, imágenes y otros resultados, de repositorios como Zenodo, Dryad y miles de instituciones. /v1/search?query=climate realiza búsquedas de texto completo en el registro y se puede acotar por tipo de recurso (type=dataset, software, text, image, audiovisual, collection, model y más), devolviendo cada DOI con su título, tipo, creadores, editorial y año de publicación. /v1/doi?id=10.5281/zenodo.3509134 devuelve los metadatos completos de un solo DOI: título, tipo de recurso, creadores, editorial, año de publicación, descripción, materias, versión, licencia y fecha de registro. Los DOIs se ven como 10.5281/zenodo.3509134 (Zenodo) o 10.5061/dryad.xxxx (Dryad). Ideal para herramientas de descubrimiento y citación de datos de investigación, repositorios de datos y gestión de referencias, funciones de citación de software y flujos de trabajo de reproducibilidad. Los metadatos son CC0 de DataCite. Este es el registro de DOIs de datos de investigación y software, distinto del índice de DOIs de artículos de revistas (Crossref) y de servicios de preprints y acceso abierto.

api.oanor.com/datacite-api

API de BioStudies

BioStudies como API, impulsado por EMBL-EBI — la base de datos que contiene las descripciones de estudios biológicos y enlaza sus datos a través de los recursos de EBI, incluyendo imágenes (BioImage Archive), genómica funcional (ArrayExpress), proteómica y la literatura (Europe PMC). Cada estudio tiene un acceso, un título y resumen, la colección a la que pertenece y enlaces a sus datos subyacentes y publicaciones. /v1/search?query=covid busca en los estudios y devuelve el acceso de cada coincidencia (ej. S-EPMC8017430), título, autor, tipo de estudio, fecha de publicación y recuentos de enlaces/archivos. /v1/study?id=S-EPMC8017430 devuelve los metadatos de un estudio — su acceso, la colección a la que pertenece (como EuropePMC, ArrayExpress o BioImages), título, resumen, fecha de publicación, autores y el número de recursos enlazados. Los accesos tienen el formato S-EPMC8017430 o S-BSST123; obtenga uno del endpoint de búsqueda. Ideal para el descubrimiento de datos de investigación, vinculación de literatura con sus conjuntos de datos subyacentes, revisiones sistemáticas y herramientas de reproducibilidad. Datos de EMBL-EBI BioStudies (público). Este es un índice de metadatos de estudios y conjuntos de datos — distinto de las bases de datos de secuencias (UniProt, ENA), estructuras (PDB, EMDB), variantes (ClinVar) y ontologías.

api.oanor.com/biostudies-api

API de Hugging Face

El Hugging Face Hub como API: el registro central y abierto de modelos y conjuntos de datos de aprendizaje automático que impulsa gran parte del ecosistema moderno de IA. Esta API envuelve el hub público huggingface.co en JSON limpio. /v1/models busca los modelos del Hub y te permite filtrar por tarea (pipeline_tag — p. ej., text-generation, text-to-image, image-classification, automatic-speech-recognition, sentence-similarity) y por biblioteca (transformers, diffusers, sentence-transformers, …), ordenados por descargas, me gusta, última modificación, fecha de creación o puntuación de tendencia — cada modelo devuelto con su id, autor, tarea, biblioteca, recuento de descargas y me gusta, licencia, etiquetas y marcas de tiempo. /v1/model?id=google-bert/bert-base-uncased devuelve los metadatos completos de un solo modelo. /v1/datasets busca conjuntos de datos de ML de la misma manera, y /v1/dataset?id=ILSVRC/imagenet-1k devuelve los metadatos de un solo conjunto de datos. Los ids tienen la forma org/nombre (tómalos de los endpoints de búsqueda). Ideal para herramientas de ML y MLOps, sitios de descubrimiento y comparación de modelos, tableros de clasificación y paneles de IA, y asistentes de IA que recomiendan modelos. Los datos provienen del Hugging Face Hub público (gratuito para usar). Este es el centro de modelos y conjuntos de datos de IA/ML, distinto de los registros de paquetes de software (npm, PyPI, Maven, NuGet) y los índices de artículos académicos (arXiv).

api.oanor.com/huggingface-api

Preguntas frecuentes

Respuestas rápidas sobre precios, cuotas e integración.

¿Cómo obtengo una clave API para API de MGnify?
Regístrate gratis en oanor.com, genera una clave API desde el panel de desarrollador y llama a API de MGnify con la cabecera x-oanor-key. No se necesita tarjeta de crédito para el plan gratuito.
¿Cuál es el límite de velocidad de API de MGnify?
El plan gratuito permite 1 solicitud por segundo. Los planes de pago escalan hasta 50 solicitudes por segundo en el nivel Mega. Los límites rígidos devuelven HTTP 429 por encima de la cuota — sin cargos sorpresa por exceso.
¿Cuánto cuesta API de MGnify?
API de MGnify ofrece un plan gratuito con 100 llamadas / mes. Los planes de pago empiezan en €6.50 / mes con cuotas más altas y límites de tasa más rápidos.
¿Puedo cancelar mi suscripción en cualquier momento?
Sí. Los planes se facturan mensualmente y puedes cancelar en cualquier momento desde el panel de facturación. Sin contratos a largo plazo ni penalización por cancelación.
¿Cumple API de MGnify con el RGPD?
Todas las solicitudes a API de MGnify pasan por nuestra pasarela en la UE. Tu clave API upstream nunca sale de nuestro servidor y no se comparten datos personales con el proveedor upstream más allá de la solicitud enviada.

Elija un punto final de la lista de la izquierda para ver sus detalles y pruébelo.

Fragmentos de código

Regístrese para obtener una clave API, luego llame a cualquier ruta debajo de su slug.

curl https://api.oanor.com/mgnify-api/SOME_PATH \
  -H "x-oanor-key: oanor_test_..."
const res = await fetch("https://api.oanor.com/mgnify-api/SOME_PATH", {
  headers: { "x-oanor-key": "oanor_test_..." }
});
const data = await res.json();
$ch = curl_init("https://api.oanor.com/mgnify-api/SOME_PATH");
curl_setopt($ch, CURLOPT_RETURNTRANSFER, true);
curl_setopt($ch, CURLOPT_HTTPHEADER, ["x-oanor-key: oanor_test_..."]);
$response = curl_exec($ch);
import requests
r = requests.get(
    "https://api.oanor.com/mgnify-api/SOME_PATH",
    headers={"x-oanor-key": "oanor_test_..."},
)
print(r.json())

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