MGnify API
MGnify als API, aangedreven door EMBL-EBI — 's werelds grootste gratis bron voor de analyse en archivering van microbiomsequencinggegevens, en de metagenomische zuster van PRIDE (proteomics) en MetaboLights (metabolomics). MGnify bevat tienduizenden openbare metagenomische en metabarcodingstudies die het menselijke darmmicrobioom, mariene en zoetwateromgevingen, bodems, afvalwater, de gebouwde omgeving en gastheer-geassocieerde gemeenschappen omvatten. Doorzoek de studies op trefwoord en verkrijg de MGnify-toegang (MGYS...), naam, samenvatting, bioom, aantal monsters en het bronsequencing BioProject van elke studie; lees de volledige metadata van een studie, inclusief naam en samenvatting, bioomclassificatie, aantal monsters, indienend centrum, openbare status, gegevensherkomst en datum van laatste update; en blader door de GOLD-stijl bioomclassificatieboom — van root:Host-associated:Human:Digestive system tot root:Environmental:Aquatic:Marine — met per-bioom monster- en studietellingen, voor ontdekking per omgeving. Ideaal voor microbiom- en omgevingsgenomica-onderzoek, hergebruik van datasets en meta-analyse, bioinformatica-pijplijnen en onderwijs. Studie-toegangen zien eruit als MGYS00006862. Gegevens van EMBL-EBI MGnify.
api.oanor.com/mgnify-api
