BioModels API
BioModels als API, aangedreven door EMBL-EBI — 's werelds grootste repository van gecureerde, gepubliceerde wiskundige modellen van biologische systemen. BioModels verzamelt computationele modellen (meestal in SBML, de Systems Biology Markup Language) van metabolisme, celsignalering, genregulatienetwerken, de celcyclus, ziekteprocessen en fysiologie, elk gekoppeld aan de peer-reviewed publicatie waaruit het afkomstig is. /v1/search?query=glycolysis doorzoekt de repository en retourneert voor elk overeenkomend model de id (zoals BIOMD0000000012), naam, formaat, indiener en inzendings-/wijzigingsdatums. /v1/model?id=BIOMD0000000012 retourneert de metadata van een model — de naam en beschrijving, het coderingsformaat, de modelleringsaanpak (bijv. gewone differentiaalvergelijkingmodel), de curatiestatus, de publicatie erachter (titel, tijdschrift, jaar, auteurs) en de modelbestanden. Model-ID's zien eruit als BIOMD0000000012 voor gecureerde modellen of MODEL1234567890 voor niet-gecureerde inzendingen; haal ze op uit het zoekendpoint. Ideaal voor systeembiologie- en computationele modelleringstools, reproduceerbaar onderzoek en modelhergebruikworkflows, en onderwijs. Gegevens van EMBL-EBI BioModels (CC0). Dit is een systeembiologie-/computationeel-modelrepository — te onderscheiden van sequentie- (UniProt, ENA), structuur- (PDB, AlphaFold), pathway- en variantdatabases (ClinVar).
api.oanor.com/biomodels-api
