#metadata

BioSamples en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — la base de données qui stocke et lie les métadonnées des échantillons biologiques, les spécimens physiques derrière les expériences biologiques. Un échantillon dans BioSamples porte un accession stable (tel que SAMEA3231268) et un riche ensemble de caractéristiques — organisme, tissu ou partie d'organisme, type cellulaire, sexe, maladie, stade de développement, souche et tout attribut fourni par le soumissionnaire — et est référencé par d'autres archives de l'EBI, notamment l'European Nucleotide Archive (ENA), ArrayExpress et PRIDE. /v1/search?q=liver recherche des échantillons par texte libre et renvoie l'accession, le nom, l'organisme et la date de publication de chaque correspondance. /v1/sample?id=SAMEA3231268 renvoie les métadonnées d'un échantillon — son accession, son nom, son identifiant taxonomique NCBI, son organisme, ses dates de publication et de mise à jour, le nombre de relations avec d'autres échantillons, et ses caractéristiques aplaties en une carte clé→valeur propre. Les accessions ressemblent à SAMEA…, SAMN… ou SAMD… ; obtenez-en un à partir du point de terminaison de recherche. Idéal pour l'intégration de données en sciences de la vie, le suivi des échantillons, l'harmonisation des métadonnées et la liaison des données de séquençage ou d'expression à leur spécimen source. Données provenant d'EMBL-EBI BioSamples (publiques). Il s'agit d'un registre de métadonnées d'échantillons biologiques — distinct des bases de données d'études (BioStudies), de séquences (ENA), de variants (ClinVar) et de structures.

api.oanor.com/biosamples-api

BioStudies en tant qu'API, propulsé par EMBL-EBI — la base de données qui contient les descriptions d'études biologiques et relie leurs données à travers les ressources de l'EBI, y compris l'imagerie (BioImage Archive), la génomique fonctionnelle (ArrayExpress), la protéomique et la littérature (Europe PMC). Chaque étude possède un identifiant, un titre et un résumé, la collection à laquelle elle appartient et des liens vers ses données sous-jacentes et ses publications. /v1/search?query=covid recherche les études et renvoie l'identifiant de chaque correspondance (par exemple S-EPMC8017430), le titre, l'auteur, le type d'étude, la date de publication et les comptes de liens/fichiers. /v1/study?id=S-EPMC8017430 renvoie les métadonnées d'une étude — son identifiant, la collection à laquelle elle appartient (telle que EuropePMC, ArrayExpress ou BioImages), le titre, le résumé, la date de publication, les auteurs et le nombre de ressources liées. Les identifiants ressemblent à S-EPMC8017430 ou S-BSST123 ; obtenez-en un à partir du point de terminaison de recherche. Idéal pour la découverte de données de recherche, la liaison de la littérature à ses ensembles de données sous-jacents, les revues systématiques et les outils de reproductibilité. Données provenant d'EMBL-EBI BioStudies (publiques). Il s'agit d'un index de métadonnées d'études et d'ensembles de données — distinct des bases de données de séquences (UniProt, ENA), de structures (PDB, EMDB), de variants (ClinVar) et d'ontologies.

api.oanor.com/biostudies-api