#interpro

Familles de protéines, domaines et sites fonctionnels sous forme d'API, propulsée par la base de données InterPro de l'EBI. InterPro classe les protéines en familles et identifie les domaines, répétitions et sites importants qu'elles contiennent, en combinant les signatures prédictives de nombreuses bases de données membres (Pfam, SMART, PROSITE, CDD, PANTHER, SUPERFAMILY, NCBIfam et plus) en une ressource intégrée unique. Recherchez une entrée InterPro — une famille, un domaine, une répétition, un site conservé/de liaison/actif ou une modification post-traductionnelle — avec sa description, ses termes Gene Ontology et les signatures des bases de données membres qui la définissent ; recherchez des entrées par nom et type ; lisez les métadonnées d'une protéine ; et, surtout, listez les entrées InterPro trouvées sur une protéine avec leurs positions de début et de fin, afin de visualiser l'architecture des domaines d'une protéine. Idéal pour l'annotation des protéines et la prédiction de fonctions, la génomique comparative, les pipelines de biologie structurale et de bioinformatique, ainsi que les outils de recherche et d'enseignement. Les identifiants d'entrée sont IPR suivis de six chiffres ; les identifiants de protéines sont des accessions UniProt. Données provenant d'EMBL-EBI.

api.oanor.com/interpro-api