API de Rfam
La base de datos Rfam de familias de ARN no codificante como una API, impulsada por EMBL-EBI. Rfam agrupa ARN funcionales que comparten un origen evolutivo común en familias, cada una modelada por un modelo de covarianza construido a partir de una alineación de semillas curada y una estructura secundaria. Busque las familias por nombre, descripción o tipo de ARN — riboswitches y otros elementos cis-reguladores, ribozimas, familias de microARN, ARN ribosómicos, ARN de transferencia, ARN nucleares pequeños y ARN nucleolares pequeños, ARN largos no codificantes y repeticiones directas CRISPR — obteniendo el acceso Rfam de cada familia, nombre, descripción, tipo de ARN y curadores; lea el registro completo de una familia, incluyendo su descripción, clasificación de tipo de ARN, los curadores que la construyeron, el número de secuencias en sus alineaciones completas y de semillas, la fuente de la estructura, el comentario del curador, el clan (grupo de familias relacionadas) al que pertenece y la versión de Rfam; y navegue por las familias según la clase de ARN. Ideal para biología de ARN, pipelines bioinformáticos, anotación de ARN no codificante, genómica comparativa y enseñanza. Los accesos de las familias se ven como RF00005 (ARN de transferencia). Datos de EMBL-EBI Rfam. Para familias y dominios de proteínas, consulte la API de InterPro, para secuencias de proteínas UniProt, para conjuntos de datos de proteómica PRIDE y para metabolómica MetaboLights.
api.oanor.com/rfam-api
