API de ENA
El Archivo Europeo de Nucleótidos (ENA) como API, impulsado por EMBL-EBI — uno de los tres socios de INSDC junto con NCBI GenBank y DDBJ, y el archivo público integral de los datos de secuencias de nucleótidos del mundo. ENA contiene lecturas de secuenciación sin procesar, genomas ensamblados y anotados, secuencias individuales, muestras biológicas y los estudios detrás de ellos, para cada dominio de la vida — el recurso fundamental para genómica, microbiología, ecología, evolución e investigación clínica. Esta API proporciona un flujo de trabajo limpio de tres pasos sobre ese archivo. Primero, /v1/taxon resuelve un nombre de organismo (por ejemplo, "Homo sapiens") a su ID de taxón de NCBI, nombre científico, rango taxonómico y linaje completo — o busca un taxón directamente por ID. Luego, /v1/search consulta el archivo para los registros de ese taxón de un tipo elegido: ensamblajes de genoma (con nombre de ensamblaje, nivel y recuento de bases), ejecuciones de secuenciación (con plataforma, instrumento y recuentos de lecturas), muestras biológicas (con fecha de recolección y país), secuencias anotadas, experimentos de lectura, análisis, secuencias codificantes y no codificantes, y estudios — por defecto incluyendo todos los taxones descendientes, o restringido al taxón exacto. Finalmente, /v1/record devuelve un resumen para cualquier acceso de ENA — ensamblajes (GCA_…), estudios y proyectos (PRJ…), muestras (SAM…/ERS…), ejecuciones de secuenciación (ERR…/SRR…) y secuencias — con su título, tipo de datos, taxón, nombre científico, recuentos de bases y secuencias y estado público. Ideal para pipelines bioinformáticos, descubrimiento de datos genómicos, recolección de metadatos de secuenciación, herramientas de biodiversidad y metagenómica, y reproducibilidad de la investigación. Los IDs de taxón se ven como 9606 (humano); los accesos como GCA_000001405. Datos de EMBL-EBI ENA, un archivo de INSDC, de uso gratuito.
api.oanor.com/ena-api
