InterPro API
Οικογένειες πρωτεϊνών, τομείς και λειτουργικές θέσεις ως API, με τη δύναμη της βάσης δεδομένων EBI InterPro. Το InterPro ταξινομεί τις πρωτεΐνες σε οικογένειες και αναγνωρίζει τους τομείς, τις επαναλήψεις και τις σημαντικές θέσεις που περιέχουν, συνδυάζοντας τις προγνωστικές υπογραφές πολλών μελών βάσεων δεδομένων (Pfam, SMART, PROSITE, CDD, PANTHER, SUPERFAMILY, NCBIfam και άλλες) σε έναν ενιαίο ολοκληρωμένο πόρο. Αναζητήστε μια καταχώρηση InterPro — μια οικογένεια, τομέα, επανάληψη, συντηρημένη/δεσμευτική/ενεργή θέση ή μετα-μεταφραστική τροποποίηση — με την περιγραφή της, όρους Gene Ontology και τις υπογραφές των μελών βάσεων δεδομένων που την ορίζουν· αναζητήστε καταχωρήσεις με όνομα και τύπο· διαβάστε τα μεταδεδομένα μιας πρωτεΐνης· και, το πιο χρήσιμο, δείτε τις καταχωρήσεις InterPro που βρίσκονται σε μια πρωτεΐνη μαζί με τις θέσεις έναρξης-λήξης τους, ώστε να μπορείτε να δείτε την αρχιτεκτονική τομέων μιας πρωτεΐνης. Ιδανικό για σχολιασμό πρωτεϊνών και πρόβλεψη λειτουργίας, συγκριτική γονιδιωματική, δομική βιολογία και βιοπληροφορικές ροές εργασίας, καθώς και εργαλεία έρευνας και διδασκαλίας. Τα αναγνωριστικά καταχωρήσεων είναι IPR ακολουθούμενα από έξι ψηφία· τα αναγνωριστικά πρωτεϊνών είναι προσβάσεις UniProt. Δεδομένα από EMBL-EBI.
api.oanor.com/interpro-api
